兩品種雞生長模型探析及PGC-1α基因與肉品質(zhì)及其相關(guān)基因表達(dá)的關(guān)聯(lián)分析.pdf

1、以我國著名優(yōu)質(zhì)地方品種清遠(yuǎn)麻雞和國外引進(jìn)的快大型品種隱性白羽雞為研究對象,用Logistic模型、Gompertz模型和Von Bertalanffy模型對體重和脛長進(jìn)行了生長曲線的擬合,并比較了3種模型擬合效果的優(yōu)劣;測定了肌內(nèi)脂肪含量、剪切力和胸肌失水率等肉品質(zhì)指標(biāo):對影響肉品質(zhì)的一個關(guān)鍵候選基因PGC-1α(peroxisome proliferators activated receptor gamma coactivator-

2、1 alpha,過氧化物酶體增殖物活化受體Y輔激活因子1-α)進(jìn)行SNP位點(diǎn)篩查,并與肉質(zhì)性狀進(jìn)行關(guān)聯(lián)分析,找出對肉品質(zhì)有重要影響的多態(tài)性位點(diǎn);分析了PGC-1α基因以及與肌纖維類型相關(guān)的不同亞型的肌球蛋白重鏈(MyHC)基因(FWM(fast whight muscle)基因、FRM(fast red muscle)基因和SM(slow muscle)基因)在肌肉組織中的發(fā)育表達(dá)規(guī)律,并分析了PGC-1α基因表達(dá)與FWM基因、FRM基

3、因和SM基因的相關(guān)性。主要研究結(jié)果如下:
　　 1.用Logistc模型、Gompertz模型和Von Bertalanffy模型對隱性白羽雞和清遠(yuǎn)麻雞的體重和脛長進(jìn)行生長曲線擬合,發(fā)現(xiàn)0周齡-4周齡隱性白羽雞的體重用VonBertalanffy模型擬合效果最好,5周齡-14周齡隱形白羽雞的體重以及0周齡-14周齡清遠(yuǎn)麻雞的體重用Gompertz模型擬合效果最好。隱性白羽雞和清遠(yuǎn)麻雞的脛長均是Logistci模型的擬合效果最好。

4、
　　 2.Gompertz模型對隱性白公、母雞和清遠(yuǎn)麻公、母雞體重擬合的拐點(diǎn)周齡分別為8.6周齡、8.6周齡、8.5周齡和9.0周齡,四者相差不大。Logistic模型對隱性白公、母雞和清遠(yuǎn)麻公、母雞脛長擬合的拐點(diǎn)周齡分別為4.2周齡、4.0周齡、4.2周齡和3.6周齡,四者相差也不大。隱性白的最大周增重比清遠(yuǎn)麻的最大周增重約100 g。
　　 3.各周齡的體重和脛長的相關(guān)分析表明,2周齡的體重與3周齡-14周齡的體重

5、之間的相關(guān)均極顯著(P＜0.01),R2值為0.8;3周齡的脛長與3周齡-14周齡的體重之間的相關(guān)也均極顯著(P＜0.01),R2值為0.8,因此可以通過對早期體重和脛長的個體選擇,達(dá)到挑選出上市日齡較大體重的目的。
　　 4.用PCR-SSCP結(jié)合直接測序法對PGC-1α基因13個外顯子和部分內(nèi)含子進(jìn)行SNP位點(diǎn)篩查,與Genbank中的DNA序列(登錄號:NW001471687)比對,共發(fā)現(xiàn)了13個突變位點(diǎn),分別是:SNP0

6、(G5407189A)、SNP1(G5368254A)、SNP2(C5377373T)、SNP3(C5405129T)、SNP4-1(T5406152c)、SNP4-2(A5406203G)、SNP5(G5407235A)、SNP6-1(C5411336T)、SNP6-2(A5411345G)、SNP8(A5419140G)、SNP13(G5420542A)、SNP14(T5420953C)和SNP15(G5430392A)。其中SNP

7、0、SNP2、SNP3、SNP4-1、SNP6-1、SNP6-2和SNP8位點(diǎn)處于外顯子中,屬于沉默突變;SNP4-2、SNP5和SNP15位點(diǎn)處于外顯子中,分別導(dǎo)致了氨基酸序列R173G、D216N和R673H的變異;SNP1、SNP13和SNP14位點(diǎn)處于內(nèi)含子中。
　　 隱性白和清遠(yuǎn)麻兩個品種中各突變位點(diǎn)的基因型分布均符合哈代-溫伯平衡定律(P＞0.05);品種之間除了SNP8位點(diǎn)外,其他位點(diǎn)基因型分布差異均極顯著。兩個品

8、種各突變位點(diǎn)的優(yōu)勢等位基因相同。隱性白羽雞和清遠(yuǎn)麻雞PGC-1α基因的平均多態(tài)信息含量含量分別為0.088和0.133,屬于低度多態(tài)位點(diǎn)。
　　 5.隱性白羽雞和清遠(yuǎn)麻雞肉品質(zhì)的分析
　　 對7周齡隱性白公母雞、17周齡隱性白公母雞和17周齡清遠(yuǎn)麻公母雞進(jìn)行常規(guī)肉品質(zhì)檢測與分析。7周齡隱性白公、母雞之間肌內(nèi)脂肪含量、剪切力和胸肌失水率差異均不顯著;17周齡隱性白公雞的剪切力極顯著高于母雞的,胸肌失水率極顯著低于母雞的,肌

9、內(nèi)脂肪含量的差異不顯著。17周齡清遠(yuǎn)麻公雞的剪切力極顯著高于母雞的,肌內(nèi)脂肪含量和胸肌失水率沒有顯著差異。
　　 隱性白羽雞17周齡的肌內(nèi)脂肪含量極顯著高于7周齡的,剪切力和胸肌失水率均極顯著低于7周齡的。17周齡清遠(yuǎn)麻的脂肪含量極顯著低于7周齡隱性白的,但絕對值相差不大,而剪切力和胸肌失水率均極顯著低于7周齡隱性白的。17周齡清遠(yuǎn)麻的脂肪含量和剪切力均顯著低于17周齡隱性白的,胸肌失水率沒有較大差異。
　　 6.對檢測

10、到的突變位點(diǎn)進(jìn)行肉質(zhì)關(guān)聯(lián)分析,發(fā)現(xiàn):
　　 SNP3、SNP4-1、SNP6、SNP8、SNP13和SNP14對肉品質(zhì)沒有顯著影響,SNP0、SNP1、SNP2、SNP4-2、SNP5和SNP15都對肉品質(zhì)有一定影響。
　　 ①SNP0位點(diǎn)對7周齡隱性白公雞的剪切力有顯著影響,其中AA基因型的剪切力極顯著小于AG基因型和GG基因型的;其它種群的公母雞的剪切力在該位點(diǎn)基因型差異不顯著。
　　 ②SNP1位點(diǎn)與品種、

11、性別的三階交互作用對胸肌失水率的影響顯著,但在各品種性別中,胸肌失水率在基因型之間的差異不顯著。
　　 ③SNP2位點(diǎn)對脂肪含量有顯著影響,其中CC基因型的含量顯著高于CT基因型的。該位點(diǎn)清遠(yuǎn)麻母雞的胸肌失水率也有影響,其中CC基因型的胸肌失水率極顯著高于CT基因型的。
　　 ④SNP4-2位點(diǎn)與品種、性別的三階交互作用對胸肌失水率的影響顯著,但在各品種性別中,胸肌失水率在基因型之間的差異不顯著。
　　 ⑤SNP

12、5位點(diǎn)對7周齡隱性白羽雞的胸肌失水率有極顯著影響,其中AA基因型和AG基因型的胸肌失水率極顯著高于GG基因型的,AA基因型和AG基因型之間沒有顯著差異,AG基因型的顯著高于GG基因型的。該位點(diǎn)對17周齡清遠(yuǎn)麻雞的胸肌失水率也有極顯著的影響,AA基因型的胸肌失水率極顯著高于AG基因型和GG基因型的。17周齡隱性白羽雞中沒有發(fā)現(xiàn)胸肌失水率在該位點(diǎn)基因型之間的顯著差異。
　　 ⑥SNP15對剪切力有極顯著的影響,其中AA基因型的剪切力

13、極顯著低于AG基因型和GG基因型的,AG基因型和GG基因型之間差異不顯著。
　　 7.用SYBR GreenⅠ熒光定量法對清遠(yuǎn)麻、隱性白0周齡-12周齡。PGC-1α基因和與肌纖維類型相關(guān)的FWM基因、FRM基因、SM基因進(jìn)行了表達(dá)水平的相對定量。心肌、胸肌和腓腸肌中PGC-1α基因的表達(dá)量在不同性別中隨周齡變化趨勢相同,在不同品種中隨周齡變化趨勢不同。隱性白、清遠(yuǎn)麻腓腸肌中PGC-1α基因0周齡-2周齡表達(dá)量下降,2周齡-10

14、周齡表達(dá)量趨于平穩(wěn),10周齡-12周齡又開始上升。隱性白上升的幅度較清遠(yuǎn)麻為大。FWM基因和FRM基因在腓腸肌中的整體變化趨勢呈“U”型,早期表達(dá)量比較高,到8周齡時表達(dá)量最低,然后又開始回升。SM基因在腓腸肌中的表達(dá)量沒有一定的規(guī)律,但在8周齡時的表達(dá)量也較低。
　　 8.在隱性白公雞腓腸肌中,PGC-1α基因與FWM基因表達(dá)量呈極顯著負(fù)相關(guān),相關(guān)系數(shù)為-0.719,與FRM基因表達(dá)量呈極顯著正相關(guān),相關(guān)系數(shù)為0.748;在隱