胃鏡取樣的良性和惡變組織的分子標志篩選.pdf

1、胃癌是常見惡性腫瘤,其死亡率仍占世界第二位,僅次于肺癌。中國屬胃癌高發(fā)國家,病死率較高。胃癌的5年生存率與其浸潤深度有關(guān),胃癌早期診斷和根治性治療是取得良好預(yù)后的唯一途徑。胃鏡配合內(nèi)鏡活檢病理用于早期胃癌的診斷后,由于胃鏡活檢以及病理學檢查受限于取樣醫(yī)師的技術(shù)熟練程度和病理醫(yī)生的判斷等諸多主觀因素,術(shù)前胃癌的漏診率仍可達10％~20%。發(fā)展新的基于分子水平的胃癌早期輔助診斷系統(tǒng)對胃癌的防治至關(guān)重要。因此本課題通過比較胃鏡下采集的病理診斷

2、分別為胃粘膜良性和惡性病變組織的表達差異基因,尋找有效區(qū)分兩者的分子標志組合。胃鏡下取35對有病理診斷的病變胃粘膜和正常對照組織,提取總RNA,經(jīng)RNA放大處理后和含有1299個基因的Oligo芯片進行雜交,局部加權(quán)回歸法(LOWESS)進行數(shù)據(jù)歸一化處理,SAM法鑒別組內(nèi)差異基因,t檢驗法(P＜0.01)篩查惡性和良性組間的差異基因,Real-time PCR驗證候選基因的在良、惡性表達差異。惡性病變粘膜組織分別與自身正常組織作對照進

3、行比較,367個基因上調(diào),261個基因下調(diào);良性病變和分別與自身正常組織作對照比較,496個基因上調(diào),252基因下調(diào);組間具有極明顯差異的基因共49個。49個基因組間差異基因的組合可100%成功區(qū)分胃粘膜良性和惡性病變組織。隨機抽取49個基因中的6個基因,mRNA定量表達檢測結(jié)果與芯片一致。應(yīng)用49個基因組合對6例新的胃組織進行盲法檢測,預(yù)測準確率達85%。因此,寡核苷酸基因芯片進行基因表達譜檢測方法可以用于區(qū)分胃粘膜良、惡性病變的分子