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文檔簡介
1、第一部分:[目的]證明豬IDO基因的存在,分析并克隆豬IDO基因的編碼序列,明確其生物信息學(xué)結(jié)構(gòu)特點(diǎn)及表達(dá)分布特點(diǎn)。
[方法]運(yùn)用生物信息學(xué)方法從GenBank獲得與人IDO基因同源的豬EST序列,通過電子克隆得到預(yù)測(cè)序列,再經(jīng)比對(duì)得相似度高的豬mRNA序列,然后通過RT-PCR技術(shù)在豬血管內(nèi)皮細(xì)胞系PED中驗(yàn)證該序列的準(zhǔn)確性,對(duì)該序列進(jìn)行生物信息學(xué)分析,并在核酸水平研究其組織表達(dá)分布特點(diǎn)。應(yīng)用體細(xì)胞雜交板(somatic
2、 cell hybrid panel,SCHP)技術(shù)對(duì)豬IDO基因進(jìn)行染色體定位分析。以已公布的人IDO同源蛋白的三級(jí)結(jié)構(gòu)為模板,利用生物信息學(xué)軟件及相關(guān)數(shù)據(jù)庫構(gòu)建豬IDO蛋白的三維空間結(jié)構(gòu)模型。
[結(jié)果]通過分子克隆、測(cè)序、同源性分析,證實(shí)豬存在IDO基因,將結(jié)果提交至GenBank,獲得登錄號(hào)為HM209418。豬IDO基因在豬的胸腺、肺、附睪和眼底中有基礎(chǔ)水平的表達(dá),尤其在豬外周血單核/巨噬細(xì)胞中表達(dá)豐富,IFN-γ
3、刺激后豬血管內(nèi)皮細(xì)胞上可表達(dá)IDO。
[結(jié)論]生物信息學(xué)方法指導(dǎo)分子生物學(xué)實(shí)驗(yàn),有助于新基因的預(yù)測(cè)、發(fā)現(xiàn)與鑒定。本研究確證了豬存在IDO基因的推測(cè),明確了該基因相關(guān)的分子結(jié)構(gòu)信息,為研究豬IDO蛋白的免疫學(xué)功能奠定了基礎(chǔ)。
第二部分:[目的]分別構(gòu)建高水平表達(dá)天然poIDO分子和帶標(biāo)簽蛋白的poIDO融合蛋白的重組表達(dá)載體。
[方法]利用RT-PCR擴(kuò)增豬IDO基因編碼區(qū)片段,連接至T載體,經(jīng)測(cè)
4、序驗(yàn)證無誤后,分別亞克隆至真核表達(dá)載體pcDNA 3.1(-)和pCMV-Tag2B,構(gòu)建重組質(zhì)粒。將重組質(zhì)粒和空載體分別轉(zhuǎn)染至CHO細(xì)胞和PED細(xì)胞,用G418進(jìn)行篩選;通過Western Blot、免疫化學(xué)和免疫熒光等方法檢測(cè),鑒定出能穩(wěn)定表達(dá)pcDNA 3.1(-)-poIDO、 pcDNA 3.1(-)的PED細(xì)胞亞群和能穩(wěn)定表達(dá)pCMV-Tag2B-poIDO和pCMV-Tag2B的CHO細(xì)胞亞群。
[結(jié)果]經(jīng)過
5、雙酶切和測(cè)序鑒定,重組質(zhì)粒pcDNA 3.1(-)-poIDO與pCMV-Tag2B-poIDO構(gòu)建成功。
[結(jié)論]成功構(gòu)建出能表達(dá)天然豬IDO分子的載體質(zhì)粒pcDNA 3.1(-)-poIDO和能表達(dá)出融合蛋白pCMV-Tag2B-poIDO,該蛋白可作為豬IDO介導(dǎo)人血清殺傷豬血管內(nèi)皮細(xì)胞作用研究的重要工具。
第三部分:[目的]研究豬IDO在人血清對(duì)豬內(nèi)皮細(xì)胞殺傷效果中的作用,并進(jìn)一步研究其在這一過程中的
6、作用機(jī)制。
[方法]利用流式細(xì)胞術(shù)檢測(cè)IDO特異性阻斷劑1-MT對(duì)人血清對(duì)PED殺傷效果的影響,由此初步判斷IDO對(duì)人血清殺傷豬血管內(nèi)皮細(xì)胞的影響。建立用PI單染法檢測(cè)人血清對(duì)豬血管內(nèi)皮細(xì)胞系(SV-40-PED)細(xì)胞毒作用的方法。
[結(jié)果]人血清對(duì)豬血管內(nèi)皮細(xì)胞的殺傷作用顯著;在加入1-MT后,人血清對(duì)豬血管內(nèi)皮細(xì)胞的殺傷效果受到抑制。
[結(jié)論] IDO促進(jìn)人血清對(duì)豬血管內(nèi)皮細(xì)胞的殺傷作用;P
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