秦川牛和南陽牛生長(zhǎng)發(fā)育性狀的分子標(biāo)記研究.pdf

1、本研究采用PCR-SSCP和DNA測(cè)序技術(shù)，以136頭秦川牛和105頭南陽牛為研究對(duì)象，首次研究了GHR基因、GHRH基因、TG基因、TG基因5’端區(qū)4個(gè)基因位點(diǎn)上的遺傳變異，分析了其遺傳結(jié)構(gòu)和遺傳多樣性，并以體尺性狀作為衡量牛生長(zhǎng)發(fā)育性狀的指標(biāo)，對(duì)所檢測(cè)到的多態(tài)位點(diǎn)與生長(zhǎng)發(fā)育性狀的關(guān)系進(jìn)行了分析，探討了GHR基因、GHRIt基因、TG基因、TG基因5’端區(qū)作為影響牛生長(zhǎng)發(fā)育性狀候選基因的可能性，所得結(jié)果如下： 1.GHR基因位

2、點(diǎn)多態(tài)及其與生長(zhǎng)發(fā)育性狀關(guān)系分析發(fā)現(xiàn)了GHR基因第10外顯子上一個(gè)多態(tài)性位點(diǎn)，該位點(diǎn)有A、B、C 3個(gè)等位基因，秦川牛3個(gè)等位基因頻率依次是0.5956/0.2905/0.1140，南陽牛的3個(gè)等位基因頻率依次是0.5619/0.3000/0.1381，所研究的兩種牛群體處于哈代一溫伯格平衡狀態(tài)。純合基因型測(cè)序表明：AA型個(gè)體在7419位存在A>C的突變，在7471位存在。T>C的突變；BB型個(gè)體在6931位存在C>T的突變，在7419

3、位存在A>C的突變，在7471位存在T>c的突變；CC型個(gè)體在6931位存在C>T的突變，在6970位存在C>T的突變，在7152位存在G>T的突變，在7264位存在A>T的突變，在7319位存在C>T的突變，在7471位存在T>C的突變。 分析了GHR基因多態(tài)性與生長(zhǎng)發(fā)育性狀的關(guān)系。分析結(jié)果表明，秦川牛AB基因型個(gè)體在體重、腰角寬、尻長(zhǎng)3項(xiàng)指標(biāo)上高于BC型個(gè)體(P<0.05)；而胸圍指標(biāo)AB型個(gè)體高于.AC、BC型個(gè)體(P<0

4、.05)。南陽牛初生重指標(biāo)上AC基因型高于BC型(P<0.05)；6月齡的體高、體斜長(zhǎng)、體重、12月齡的體斜長(zhǎng)、體重、18月齡的體斜長(zhǎng)、體重、24月齡的體高、體斜長(zhǎng)、體重指標(biāo)上AB型高于BC型(P<0.05)，其中，24月齡體重指標(biāo)上，AB基因型與BC基因型差異達(dá)極顯著水平(P<0.01)；18月齡胸圍上，AB型高于CC型(P<0.05)；18月齡體重上，AB型亦高于AA型、BB型和AC型(P<0.05)，其中，AB型與AC型差異極顯著

5、(P<0.01)；24月齡體高上，AA型、CC型、亦高于BC型(P<0.05)，其中AA型與BC型差異達(dá)極顯著水平(P

6、個(gè)等位基因的頻率依次為0.8476/0.1524。所研究的秦川牛和南陽牛群體處于哈代一溫伯格平衡狀態(tài)。對(duì)檢測(cè)到的不同基因型個(gè)體分別進(jìn)行測(cè)序，測(cè)序結(jié)果表明，AB基因型的4308位存在T>C的突變。 分析了GHRH基因多態(tài)性與生長(zhǎng)發(fā)育性狀的關(guān)系。分析結(jié)果未發(fā)現(xiàn)秦川牛兩種基因型與生長(zhǎng)發(fā)育性狀有顯著差異。而南陽牛6月齡坐骨端寬、體重、12月齡體重、18月齡體重、體斜長(zhǎng)、24月齡體重指標(biāo)上AB型高于AA型(P<0.05)，其中18月齡體重

7、二者差異達(dá)極顯著水平(P<0.01)。3.TG基因5’端區(qū)位點(diǎn)多態(tài)及其與生長(zhǎng)發(fā)育性狀關(guān)系分析發(fā)現(xiàn)了TG基因5’端區(qū)存在一個(gè)多態(tài)位點(diǎn)，該位點(diǎn)有A、B 2個(gè)等位基因，秦川牛2個(gè)等位基因的頻率依次為0.3015/0.6985，南陽牛2個(gè)等位基因的頻率依次為0.2714／0.7286。所研究的秦川牛群體處于哈代一溫伯格不平衡狀態(tài)，而南陽牛處于哈代一溫伯格平衡狀態(tài)。測(cè)序發(fā)現(xiàn)：AA型在355存在G>C的突變，在630存在G>T的突變，671位存在C

8、>T突變；AB型在390存在G>T的突變、513存在T>A的突變、671位存在C>T的突變。 分析了TG基因5’端區(qū)多態(tài)性與生長(zhǎng)發(fā)育性狀的關(guān)系。研究表明秦川牛群體中，在體高、十字部高、坐骨端寬三項(xiàng)指標(biāo)上，BB型群體高于AB型群體(P<0.05)，其中坐骨端寬二者差異達(dá)極顯著水平(P<0.01)；而腰角寬指標(biāo)上，AA基因型群體高于BB型群體、AB型群體(P<0.05)，且與AB型群體差異達(dá)極顯著水平(P<0.01)。TG基因5，端

9、區(qū)不同基因型對(duì)南陽牛不同年齡階段多項(xiàng)性狀影響顯著，BB基因型在6月齡坐骨端寬指標(biāo)上高于AA型(P<0.05)：BB基因型在6月齡的體高、體斜長(zhǎng)、胸圍、體重，12月齡胸圍、18月齡體斜長(zhǎng)、胸圍，24月齡體斜長(zhǎng)、胸圍指標(biāo)上高于AA型和AB型(P<0.05)，其中BB型與AA型在6月齡體高、胸圍、體重，12月齡胸圍，18月齡胸圍、24月齡胸圍指標(biāo)上差異達(dá)極顯著水平(P<0.01)。4.TG基因位點(diǎn)多態(tài)及其與生長(zhǎng)發(fā)育性狀關(guān)系分析發(fā)現(xiàn)了TG基因一

10、個(gè)多態(tài)位點(diǎn)，該位點(diǎn)有A、B 2個(gè)等位基因，秦川牛2個(gè)等位基因的頻率依次為0.8235/0.1765，南陽牛2個(gè)等位基因的頻率依次為：0.6476/0.3524。所研究的秦川牛群體和南陽牛群體處于哈代-溫伯格不平衡狀態(tài)。測(cè)序發(fā)現(xiàn)AA型在906位存在T>C的突變；在920位存在由G>C的突變；在959位存在A>G的突變。而AB型在920位存在一由G>C的突變；在959位存在由A>G的突變。分析了TG基因多態(tài)性與生長(zhǎng)性狀的關(guān)系。結(jié)果發(fā)現(xiàn)，除了