魯西牛微衛(wèi)星標記和MHC多態(tài)性及其與生長發(fā)育性狀的關(guān)系.pdf

1、本研究采用基因組掃描法、候選基因法和生物信息學(xué)方法，對魯西牛群體遺傳結(jié)構(gòu)、遺傳多樣性及其與體重、體尺等生長發(fā)育性狀相關(guān)的基因進行了檢測和分析，旨在獲得相應(yīng)的分子遺傳學(xué)信息，找到經(jīng)濟性狀的分子標記，為中國黃牛遺傳資源的保護利用、分子標記輔助育種的開展和肉牛以及奶牛生產(chǎn)性能的提高提供科學(xué)依據(jù)。
　　 采用微衛(wèi)星標記、PCR-SSCP、克隆測序法和最小二乘線性模型分析方法，以120頭魯西牛為研究對象，從分布于牛的60條染色體的30對微

2、衛(wèi)星引物中，篩選出多樣性豐富的8對微衛(wèi)星位點，探討了與魯西牛生長發(fā)育性狀相關(guān)聯(lián)的分子遺傳標記；分析了與魯西牛生長發(fā)育性狀相關(guān)顯著的分子標記的遺傳效應(yīng)。研究了主要組織相容性復(fù)合體（Major Histocompatibility Complex，MHC)Ⅱ類a 亞區(qū)DRB3基因的第二外顯子（BoLA-DRB3*exon2)在魯西牛群體中的遺傳多樣性，檢測了90 頭魯西牛BoLA-DRB3*exon2基因的遺傳變異。結(jié)果發(fā)現(xiàn),7個微衛(wèi)星座位

3、和BoLA-DRB3*exon2的不同基因型之間的差異達到顯著（P<0.05）或極顯著水平（P<0.01）；發(fā)現(xiàn)了一些對生長發(fā)育有利和不利的基因型，主要研究結(jié)果總結(jié)如下：
　　 （1）關(guān)于魯西牛群體的遺傳多態(tài)性：共檢測到34個等位基因，每個微衛(wèi)星座位的等位基因數(shù)為3-6個，平均等位基因數(shù)為4.25，該群體的基因平均雜合度（H）為0.5613，多態(tài)信息含量（PIC）為0.4983。表明：該群體呈中度遺傳多樣性，遺傳多樣性較為豐富，

4、尚有較好的選擇潛力，但有降低的趨勢。
　　 （2）發(fā)現(xiàn)了顯著影響魯西牛體尺性狀的有利基因型：ETH185座位的AE與體高，BM711座位的CC和BM1824座位的BB與體長，TGLA53座位的AD和BM711座位的CC與管圍，BM1824座位的BB和DVGA55座位的AB與腹圍都有顯著的有利作用。也發(fā)現(xiàn)了一些顯著影響體尺性狀的不利基因型：ETH185位點AA與體高，ETH185位點的BC和BM711位點的EE型與管圍，BM182

5、4位點的AB型與體長和腹圍，DVGA55位點的AA型與腹圍都有顯著的負效應(yīng)。
　　 （3）發(fā)現(xiàn)了顯著影響魯西牛體重性狀的有利基因型：TGLA53座位的AC、ETH185座位的BD、BM711座位的AB、DVGA46座位的AC、DVGA44座位的BB和DVGA55座位的BB都對體重有顯著的有利效應(yīng)。也發(fā)現(xiàn)了體重方面的一些不利基因型：TGLA53位點的BB型，ETH185位點的BC型，DVGA46位點的AD型，DVGA55位點的AA

6、型和AC型，DVGA44位點的AD型，都對體重性狀有明顯的負效應(yīng)。（4）魯西牛BoLA-DRB3*exon2基因遺傳變異檢測結(jié)果：統(tǒng)計的等位基因數(shù)、有效等位基因數(shù)和等位基因頻率分別是2、1.4060、0.8250和0.1750。觀測雜合度、期望雜合度和平均雜合度分別為0.0500、0.2962和0.2888。發(fā)現(xiàn)了BoLA-DRB3*exon2基因的三種基因型，它們與生長發(fā)育性狀的關(guān)聯(lián)性分析結(jié)果表明：除了體高和管圍2個性狀外，在其它的4

7、個性狀上均發(fā)現(xiàn)了顯著影響魯西黃牛生長發(fā)育性狀的位點和等位基因。在體長性狀上，AA型個體極顯著的高于AB型（P<0.01），在胸圍、腹圍和體重3個性狀上，AA型個體極顯著的高于AB型和BB型（P<0.01），說明AA型對牛的生長發(fā)育有利。對魯西牛生長速度有顯著影響的有利基因型為AA型，其次為BB型。
　　 魯西牛BoLA-DRB3*exon 2目的基因的原序列長168bp，在這168bp長度中通過測序發(fā)現(xiàn)共有14個突變位點，占序列

8、總長度的8.33％，其中，共同突變位點為11個。
　　 BoLA-DRB3*exon 2基因的3種基因型分別是AA、AB和BB，AA型是在第55堿基處的胸腺嘧啶（T）突變?yōu)橄汆堰剩ˋ），為堿基顛換；AB型是在第56位堿基處的胞嘧啶（C）突變?yōu)轼B嘌呤（G），也是顛換；BB型是在第153堿基處的鳥嘌呤（G）突變?yōu)橄汆堰剩ˋ），為堿基轉(zhuǎn)換。
　　 研究結(jié)果為魯西牛的標記輔助選擇和早期基因型選種提供了可借鑒的分子標記，也為魯西牛