冷脅迫下東鄉(xiāng)野生稻表達譜測序分析.pdf

1、野生稻是重要的種質資源，它含有豐富的抗性基因，其中也包括抗寒基因。將轉錄組測序技術運用到野生稻抗寒性研究上，能更加準確的研究水稻的抗寒機制，有利于培育出高抗寒的水稻。
　　 苗期抗寒性研究的材料是12個水稻雜交組合，方法是葉片的相對電導率和植株的成苗率;轉錄組的研究對象是93-11、東鄉(xiāng)野生稻、茶陵野生稻、越冬混合池，方法是信息學分析技術。主要的研究結果如下:
　　 1通過觀察12個水稻雜交組合（包括父母本）的苗期葉片的

2、相對電導率和植株的成苗率，來探討水稻苗期抗寒性的雜種優(yōu)勢。經過統(tǒng)計發(fā)現，雜交組合的相對電導率的超親優(yōu)勢值為負數，中親優(yōu)勢值在-37.27％～+21.02％之間，成苗率的中親優(yōu)勢值在-30.80％～+7.20％之間，雜種優(yōu)勢表現為中親優(yōu)勢。并且可以看出粳稻在抗寒性上優(yōu)于秈稻。
　　 2四種水稻材料冷處理（4℃、3天）前后的表達譜的原始數據經過格式轉換、去除雜質序列后得到的數據量都大約有600萬個reads。通過比較不同樣本間的數據

3、發(fā)現這四種水稻響應冷處理均發(fā)生廣泛的基因表達調控變化，響應冷刺激上調的基因數均顯著大于下調的基因數，93-11、東鄉(xiāng)野生稻、茶陵野生稻和越冬混合池上調的基因數依次為2691、2322、2372和1836，下調的基因數依次為1652、1503、1553和1501。
　　 通過將東鄉(xiāng)野生稻、茶陵野生稻以及越冬混合池分別與93-11進行差異表達基因比較，它們下調基因依次相差了799個、894個和778個，上調基因依次相差了775個、9