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文檔簡介
1、目的:建立和評價一個新的多重PCR-反向線點(diǎn)雜交技術(shù)(mPCR/RLB)檢測常見性傳播疾病(STD)病原體的方法。 方法: 1.利用http://www.angis.org.au網(wǎng)站,在NCBI的GenBank數(shù)據(jù)庫中獲得試驗菌株沙眼衣原體(CT)隱蔽質(zhì)?;?、淋病奈瑟菌(NG)的16S rRNA和Opa基因、3種支原體(人型支原體(Mh),解脲脲原體(Uu),微小脲原體(Up))的16S-23S rDNA間隔序列和6種
2、念珠菌(白色念珠菌、熱帶念珠菌、克柔念珠菌、光滑念珠菌、近平滑念珠菌、都柏林念珠菌)的5.8S-28S rDNA間隔序列的核苷核酸序列。分別設(shè)計CT和NG的特異性引物及檢測探針。并用Pretty將6種念珠菌以及3種支原體的間隔序列分別進(jìn)行比對,設(shè)計其相應(yīng)屬通用引物和各菌種的特異性寡核苷酸探針,使各引物及探針的Tm值等參數(shù)盡量一致。 2.建立PCR/RLB檢測6種常見念珠菌,對其進(jìn)行方法學(xué)評價(包括特異性、敏感性等),并與涂片法、
3、培養(yǎng)法鑒定結(jié)果(Merieux Vitek)進(jìn)行比較。 3.建立mPCR/RLB同時檢測CT、NG、Uu、Up和Mh等5種性病病原菌,并與熒光定量PCR(FQ-PCR)和支原體液體培養(yǎng)法進(jìn)行比較。 結(jié)果: 1.PCR/RLB檢測上述6種念珠菌的敏感性為10 CFU/ml。通過對100株念珠菌分離株的檢測,與培養(yǎng)法(Merieux Vitek)比較表明,有97株與培養(yǎng)法鑒定結(jié)果一致,另外3株通過DNA測序證實與PC
4、R/RLB檢測結(jié)果一致。通過對200例女性陰道試子標(biāo)本進(jìn)行檢測,PCRfRLB的陽性率為49%,而涂片法和培養(yǎng)法的陽性率分別為27%和39%,明顯高于涂片法和培養(yǎng)法(P<0.05)。 2.mPCR可同時擴(kuò)增CT、NG、Uu、Up和Mh標(biāo)準(zhǔn)菌株DNA,其PCR產(chǎn)物的片段長度為208bp~414bp。97份FQ-PCR CT陽性標(biāo)本中有93份經(jīng)mPCR/RLB檢測為CT陽性,45份FQ-PCR CT陰性標(biāo)本中35份mPCR/RLB陰
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