中國漢族人群中STK39基因、MCCC1-LAMP3基因與散發(fā)性帕金森病的相關性研究.pdf

1、背景：
　　隨著人類基因組計劃的完成,GWAS廣泛應用于探索復雜性疾病的遺傳學研究,到目前為止,在各種人群的帕金森病(Parkinson’s disease,PD)的GWAS研究中已發(fā)現(xiàn)了數(shù)十種基因的多態(tài)與PD相關。最近國際帕金森病遺傳協(xié)會(Intemational Parkinson Disease Genomics Consortium)對5個美國人群和歐洲人群的PD的GWAS研究進行meta分析,除了發(fā)現(xiàn)既往報道的位點外,還

2、發(fā)現(xiàn)了5個新的位點:ACMSD、STK39(rs2102808)、MCCC1/LAMP3(rs11711441)、SYT11和CCDC62/HIP1R基因。而后在一組猶太人群的GWAS研究中發(fā)現(xiàn)了更多的SNPs與PD相關,包括之前報道的位點,也有STK39(rs3754775)、LAMP3(rs12493050)基因。因此,不同的GWAS研究同時發(fā)現(xiàn)STK39基因、MCCC1/LAMP3基因與PD發(fā)病相關,我們推測這兩個基因很有可能為:

3、PD發(fā)病的易感基因。
　　目的：
　　通過對中國漢族人群散發(fā)PD患者及對照組的研究分析STK39基因的rs2102808、rs3754775位點,MCCC1/LAMP3基因的rs11711441、rs12493050位點與PD的相關性。
　　方法：
　　本研究擬采用聚合酶鏈式反應和DNA直接測序法檢測501例散發(fā)性PD及492例正常對照的基因型,分析STK39、MCCC1/LAMP3基因相應位點是否與PD相關。<

4、br>　　結(jié)果：
　　1)在rs2102808、rs3754775、rs12493050位點的的檢測結(jié)果中,發(fā)現(xiàn)基因型和等位基因在未分組人群、早發(fā)性PD、遲發(fā)性PD、男性PD、女性PD與相關對照組人群間均無顯著性差異性(P＞0.0125);
　　2)在rs11711441的檢測結(jié)果中,發(fā)現(xiàn)基因型和等位基因未分組人群、早發(fā)性PD、遲發(fā)性PD、男性PD、女性PD與相關對照組人群間均有顯著性差異性(P＜0.001,OR＜1);

5、r>　　3)STK39基因的rs2102808、rs3754775位點及MCCC1/LAMP3基因的rs11711441、rs12493050位點間相互獨立(r2＜0.5)。
　　結(jié)論：
　　1)MCCC1/LAMP3基因的rs11711441位點等位基因A可降低PD的發(fā)病風險,具有保護作用。
　　2)STK39基因的rs2102808和rs3754775位點,MCCC1/LAMP3基因的rs12493050位點與PD