基于iTRAQ技術(shù)對玉米K305ms育性差異表達(dá)蛋白的分析.pdf_第1頁
已閱讀1頁,還剩75頁未讀, 繼續(xù)免費(fèi)閱讀

下載本文檔

版權(quán)說明:本文檔由用戶提供并上傳,收益歸屬內(nèi)容提供方,若內(nèi)容存在侵權(quán),請進(jìn)行舉報或認(rèn)領(lǐng)

文檔簡介

1、玉米是最早利用雜種優(yōu)勢的作物,利用雄性不育系生產(chǎn)雜交種子,可以提高種子純度和降低生產(chǎn)成本。但是,目前對玉米細(xì)胞核雄性不育的敗育機(jī)制還不十分清楚,從而限制了其生產(chǎn)應(yīng)用。本研究以玉米K305ms為材料,利用iTRAQ技術(shù)構(gòu)建花藥發(fā)育3個不同時期的可育和不育花藥蛋白質(zhì)表達(dá)譜,并對差異表達(dá)蛋白進(jìn)行比較分析。通過GO、COG和Pathway注釋和富集分析,挖掘與育性相關(guān)的功能蛋白和關(guān)鍵代謝途徑。結(jié)合蛋白免疫技術(shù)、熒光定量技術(shù)和氣相-質(zhì)譜聯(lián)用技術(shù)驗(yàn)

2、證,探討K305ms的敗育機(jī)制,為進(jìn)一步研究利用奠定基礎(chǔ)。主要結(jié)果如下:
  1.利用iTRAQ技術(shù)共鑒定到肽段27607個,蛋白質(zhì)6606個。GO分析表明這些蛋白主要分布于細(xì)胞和細(xì)胞內(nèi)器官上,以結(jié)合活性和催化活性蛋白為主,主要參與細(xì)胞的代謝過程和細(xì)胞過程;COG功能分類顯示除通用功能外,大多數(shù)為翻譯后修飾、分子伴侶、蛋白質(zhì)轉(zhuǎn)換、翻譯、核糖體結(jié)構(gòu)和生物合成蛋白;pathway代謝途徑注釋發(fā)現(xiàn)304條代謝通路,主要集中在碳水化合物代

3、謝、脂肪酸代謝、氨基酸代謝、細(xì)胞物質(zhì)的跨膜運(yùn)輸與信號傳遞及次生代謝物代謝途徑。聚類分析顯示,在花藥發(fā)育早期和后期,不育和可育花藥蛋白表達(dá)模式相似,而中期表達(dá)模式則不同,暗示中期(減數(shù)分裂期)可能是敗育關(guān)鍵時期。
  2.比較篩選結(jié)果,在可育和不育花藥3個發(fā)育時期分別鑒定出175、215和426個,共721個顯著的差異表達(dá)蛋白。這些蛋白在早期可育比不育上調(diào)表達(dá)23個,下調(diào)表達(dá)24個;中期上調(diào)16個,下調(diào)49個;后期上調(diào)59個,下調(diào)1

4、2個。 GO富集分析表明,主要包括轉(zhuǎn)運(yùn)活性和電子載體活性蛋白等,參與細(xì)胞的代謝過程、生長發(fā)育和信號轉(zhuǎn)導(dǎo)。COG功能分類顯示翻譯后修飾、分子伴侶和蛋白質(zhì)轉(zhuǎn)換差異表達(dá)蛋白居多。pathway富集分析表明,差異表達(dá)蛋白涉及198條代謝途徑,根據(jù)相關(guān)蛋白富集和差異表達(dá)的持續(xù)性,推測碳水化合物和能量代謝、脂肪酸代謝、脂肪酸鏈延長等途徑可能是導(dǎo)致敗育的通路之一。
  3.篩選出Hsp70、ADGP和ATPβ三個蛋白作為一抗,以β-Actin為

5、內(nèi)參抗體采用Western blot免疫表達(dá)分析結(jié)果顯示,Hsp70在花藥發(fā)育過程中表達(dá)量差異不顯著,ADGP在花藥發(fā)育后期表達(dá)量差異顯著,ATPβ在花藥發(fā)育中期表達(dá)量差異顯著,與iTRAQ結(jié)果趨勢一致。ATPβ在能量代謝中具有重要的作用,在發(fā)育中期不育花藥幾乎是痕量。不育花藥發(fā)育中期ATPβ含量低于可育花藥,可能導(dǎo)致中期能量供應(yīng)不足,影響正常減數(shù)分裂。
  4.選取7個相關(guān)差異表達(dá)蛋白對應(yīng)的基因設(shè)計(jì)特異引物,通過qRT-PCR反

6、應(yīng)檢測3個時期可育和不育花藥的轉(zhuǎn)錄水平表達(dá)。結(jié)果表明,轉(zhuǎn)錄本水平與其對應(yīng)的蛋白質(zhì)表達(dá)水平基本一致。代謝通路分析發(fā)現(xiàn),這些蛋白主要功能是在脂肪酸生物合成和脂質(zhì)代謝途徑中發(fā)揮重要作用,通過影響脂肪酸鏈延長和降解影響脂類物質(zhì)合成。脂類物質(zhì)的減少可能會造成外壁的降解,花粉粒無法形成導(dǎo)致敗育。
  5.通過氣相-質(zhì)譜聯(lián)用分析技術(shù),測定3個時期可育和不育花藥的蠟質(zhì)和角質(zhì)含量,發(fā)現(xiàn)3個時期不育花藥蠟質(zhì)含量略低于可育花藥,差異均不顯著;角質(zhì)含量前

7、期和后期不育花藥低于可育花藥,而中期可育花藥低于不育花藥,差異均達(dá)極顯著水平。部分長鏈角質(zhì)單體的含量不育花藥極顯著低于可育花藥。進(jìn)一步驗(yàn)證了脂肪酸鏈延長和脂質(zhì)代謝異??赡軐?dǎo)致玉米雄性不育。
  6.推測玉米K305ms敗育原因可能是由于前期和中期碳水化合物和能量供應(yīng)不足,導(dǎo)致花藥發(fā)育早期相關(guān)基因轉(zhuǎn)錄、翻譯及核糖體合成受到抑制,造成花粉母細(xì)胞減數(shù)分裂異常;中后期相關(guān)代謝通路受阻,尤其是脂肪酸合成和脂質(zhì)代謝中脂肪酸鏈的延長不能正常進(jìn)行

溫馨提示

  • 1. 本站所有資源如無特殊說明,都需要本地電腦安裝OFFICE2007和PDF閱讀器。圖紙軟件為CAD,CAXA,PROE,UG,SolidWorks等.壓縮文件請下載最新的WinRAR軟件解壓。
  • 2. 本站的文檔不包含任何第三方提供的附件圖紙等,如果需要附件,請聯(lián)系上傳者。文件的所有權(quán)益歸上傳用戶所有。
  • 3. 本站RAR壓縮包中若帶圖紙,網(wǎng)頁內(nèi)容里面會有圖紙預(yù)覽,若沒有圖紙預(yù)覽就沒有圖紙。
  • 4. 未經(jīng)權(quán)益所有人同意不得將文件中的內(nèi)容挪作商業(yè)或盈利用途。
  • 5. 眾賞文庫僅提供信息存儲空間,僅對用戶上傳內(nèi)容的表現(xiàn)方式做保護(hù)處理,對用戶上傳分享的文檔內(nèi)容本身不做任何修改或編輯,并不能對任何下載內(nèi)容負(fù)責(zé)。
  • 6. 下載文件中如有侵權(quán)或不適當(dāng)內(nèi)容,請與我們聯(lián)系,我們立即糾正。
  • 7. 本站不保證下載資源的準(zhǔn)確性、安全性和完整性, 同時也不承擔(dān)用戶因使用這些下載資源對自己和他人造成任何形式的傷害或損失。

最新文檔

評論

0/150

提交評論