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文檔簡介
1、木霉菌(Trichoderma)是半知真菌,具有極強(qiáng)的生命力,可以適應(yīng)多種生活環(huán)境。木霉菌在和病原菌發(fā)生競爭時可以取得競爭優(yōu)勢,抑制病原菌的生長,被廣泛應(yīng)用于各種生物防治制劑。因此,尋找在生長和生物防治特性上有競爭力的木霉菌菌株具有重要經(jīng)濟(jì)意義。
YYH13和YYH16是在湖南省土壤中發(fā)現(xiàn)的兩株鉤狀木霉菌菌株。實(shí)驗(yàn)表明兩個菌株在生物防治能力上存在顯著差異。我們假設(shè)兩個菌株生物防治能力上的差異是由于相關(guān)基因的數(shù)目差異導(dǎo)致的,所以
2、針對碳水化合物相關(guān)水解酶(CAZymes)、蛋白酶(Peptidases)、次生代謝基因簇等生防能力相關(guān)家族對兩個菌株進(jìn)行了比較分析。
通過對兩個菌株的重要基因家族進(jìn)行比較分析,我們發(fā)現(xiàn)YYH13菌株在某些基因家族中存在基因數(shù)目上的優(yōu)勢。在CAZyme家族中,YYH13具有更多基因編碼參與細(xì)胞壁降解的幾丁質(zhì)酶和β-1,3-葡聚糖。在蛋白酶家族中,YYH13具有更多參與生物防治的基因(家族S08和S10家族)。通過對次生代謝基因
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