楊樹LRR-RLK基因家族的生物信息學(xué)分析及木材發(fā)育相關(guān)基因的克隆.pdf

1、富含亮氨酸重復(fù)序列的類受體蛋白激酶(LRR-RLKs)參與植物生長發(fā)育及對環(huán)境刺激應(yīng)答反應(yīng)的多種信號傳導(dǎo)過程,在植物生命活動中發(fā)揮著重要功能。最新研究表明,LRR-RLKs在植物多種分生組織的形態(tài)建成及細胞分化過程中也承擔(dān)著關(guān)鍵的調(diào)控作用。
　　本論文使用生物信息學(xué)研究手段,通過與擬南芥的LRR-RLKs遺傳資源相整合,在木本模式植物毛果楊中分離PtLRR-RLK基因家族,挖掘與木本植物楊樹中與次生維管組織形態(tài)建成及形成層分化相關(guān)

2、的PtLRR-RLK基因,掌握其時空變化規(guī)律與表達調(diào)控機制。具體的方法是:在實驗過程中,通過242個擬南芥基因在楊樹數(shù)據(jù)庫中blastp查找出384個楊樹LRR-RLK基因,通過分析這個基因家族的遺傳進化樹特征,用不同表達數(shù)據(jù)庫中的數(shù)據(jù)繪制表達圖譜,整個在形成層、發(fā)育木質(zhì)部、發(fā)育韌皮部等特異部位高表達的基因共115個,并結(jié)合擬南芥中與發(fā)育功能相關(guān)的基因構(gòu)建系統(tǒng)進化樹,預(yù)測楊樹基因的功能,并篩選出17個高表達,且都在形成層和木質(zhì)部、韌皮部