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文檔簡介
1、沙門氏菌、大腸桿菌、奇異變形桿菌均是雞主要垂直傳播細菌病的病原。為了更好的對三種疾病致病原進行鑒別診斷,本研究對三種病原菌進行分離培養(yǎng)和鑒定,單一熒光定量PCR檢測方法以及多重熒光定量PCR檢測方法的研究,并組裝了檢測試劑盒,旨在為沙門氏菌、大腸桿菌、奇異變形桿菌的鑒別診斷提供一種簡單、用時少、敏感、特異的檢測試劑盒。
1.經培養(yǎng)分離獲得沙門氏菌流行菌株。分離菌株16S rRNA部分堿基序列之間同源性為99.7%,與GenBa
2、nk中AB594754、AB594759、AB594763、EU118085等腸道沙門氏菌處于同一個分支,同源性最高達99.8%。根據(jù)沙門氏菌invA基因設計引物,所建立的熒光定量PCR檢測方法,對沙門氏菌的檢測最低濃度可達101cfu/mL,敏感性比常規(guī)PCR方法高100倍,重復性試驗的變異系數(shù)為3.74%和0.10%。
2.經培養(yǎng)分離獲得大腸桿菌流行菌株。分離菌株16S rRNA部分堿基序列彼此之間序列同源性在99.3%~
3、100%之間,與GenBank中AY098487(雞源丹麥分離株)、NZ_CP015855(人源韓國分離株)、NZ_CP015995(雞源中國分離株)的同源性均較高。根據(jù)大腸桿菌FimH基因設計引物,所建立的熒光定量PCR檢測方法,對大腸桿菌的檢測最低濃度101cfu/mL,敏感性比常規(guī)PCR方法高100倍,重復性試驗的變異系數(shù)為0.91%和1.59%。
3.經培養(yǎng)分離獲得奇異變形桿菌流行菌株。分離16S rRNA部分堿基序列
4、彼此之間序列同源性為99.7%~100%,與AB272366(禽源雞源日本分離株)處于同一個分支,同源性最高達100%。根據(jù)奇異變形桿菌ureR基因設計引物,所建立的熒光定量PCR方法,對奇異變形桿菌的檢測最低限度可達101cfu/mL,敏感性比常規(guī)PCR方法高100倍,重復性試驗的變異系數(shù)為2.23%和1.68%。
4.建立了檢測沙門氏菌、大腸桿菌、奇異變形桿菌的三重熒光定量PCR方法,該方法對沙門氏菌、大腸桿菌、奇異變形桿
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