胚胎干細胞中RNAs與microRNAs相互作用網(wǎng)絡研究.pdf

1、胚胎干細胞(embryonic stem cells，簡稱ES細胞)是一種高度未分化細胞，具備發(fā)育成各種組織和器官的潛力，具有多能性(分化)和自我更新能力(增殖)。最近的實驗[Nature463，(2010)621]研究表明：在敲掉DGCR8基因后的胚胎干細胞中，microRNAs能調節(jié)干細胞的自我更新或者促進分化。
　　 本文以胚胎干細胞中ESCCmiRNA、Lin28、c-Myc、Myc Targets、Oct4、Pluri

2、potency target、Let-7、DGCR8之間相互作用為研究對象，研究了胚胎干細胞中這八種生物分子之間相互作用的網(wǎng)絡結構與胚胎干細胞功能之間的內在關系。主要研究工作和成果如下：
　　 首先，重構了干細胞中ESCCmiRNA、Lin28、c-Myc、Myc targets、Oct4、Pluripotency target、Let-7、DGCR8之間相互作用布爾網(wǎng)絡結構，研究了該網(wǎng)絡結構的動力學行為，發(fā)現(xiàn)該相互作用網(wǎng)絡結構

3、具有兩個穩(wěn)定的狀態(tài)，分別對應著胚胎干細胞的分化和增殖功能。并與隨機網(wǎng)絡結構進行了比較，發(fā)現(xiàn)隨機網(wǎng)絡大部分不穩(wěn)定，而小部分穩(wěn)定的隨機網(wǎng)絡可能對研究網(wǎng)絡的演化有預示作用。
　　 其次，利用已有的實驗數(shù)據(jù)和可能的生物學演化路徑，采用基于過程的網(wǎng)絡分解(process-based network decomposition)方法，給出了能保持生物學功能的最小網(wǎng)絡結構，發(fā)現(xiàn)剩余網(wǎng)絡對胚胎干細胞保持功能上的穩(wěn)定性具有十分重要的作用。