copd患者外周骨骼肌萎縮中的功能性蛋白組學(xué)的研究_第1頁
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文檔簡介

1、<p>  COPD患者外周骨骼肌萎縮中的功能性蛋白組學(xué)的研究</p><p>  摘要:目的 對正常老年人、COPD患者無外周骨骼肌萎縮、COPD患者合并外周骨骼肌萎縮的蛋白電泳圖譜進行配對分析比較,尋找差異蛋白質(zhì)點。方法 應(yīng)用質(zhì)譜鑒定技術(shù),對差異蛋白質(zhì)點進行鑒定。結(jié)論 經(jīng)相關(guān)文獻檢索,分析所鑒定的蛋白質(zhì)在COPD患者外周骨骼肌萎縮的關(guān)系,為今后新的治療靶點的研究奠定基礎(chǔ)。 </p>&

2、lt;p>  關(guān)鍵詞:慢性阻塞性肺疾病;骨骼肌萎縮;蛋白質(zhì) </p><p>  近年來,慢性阻塞性肺疾病(chronic obstructive pulmonary disease,COPD)的發(fā)病率和病死率正逐年增加,不是一種單純的肺部疾病,而是可以累及引起全身炎癥、心血管系統(tǒng)、消化系統(tǒng)、骨骼肌萎縮、骨質(zhì)疏松等具有廣泛的肺外損傷的全身疾病,尤其是不明原因的骨骼肌萎縮和體重減輕及功能障礙[1]。分析與肌肉

3、萎縮相關(guān)的關(guān)鍵蛋白質(zhì)及其功能可能對治療具有重要的臨床指導(dǎo)意義。 </p><p><b>  1 資料與方法 </b></p><p>  1.1蛋白質(zhì)取材 30例老年人,年齡均在70~90歲,無COPD組(正常組)10例,COPD患者無外周骨骼肌萎縮組(無萎縮組)10例,COPD患者存在外周骨骼肌萎縮組(萎縮組)10例,分別取髕骨上15cm股四頭肌的外側(cè)?。凰屑∪?/p>

4、樣品,在切取后立刻用冰的PBS沖洗,去掉組織中殘留的血液等,剪成碎片置于1.5ml Eppenderf管中,并儲存于-80℃。 </p><p><b>  1.2方法 </b></p><p>  1.2.1蛋白質(zhì)的制備:將收集完的樣品,用電子天平稱取等重量樣品(50mg)用預(yù)冷的0.01 mol?L-1PBS:(磷酸鹽緩沖液)洗滌3次,預(yù)冷的蒸餾水洗滌1次,出去渣

5、滓,在液氮中制動研磨至粉末狀,加適量裂解液充分混勻,在4℃冰浴靜置15min,冰浴超聲、離心,后取上清,用bradford法測其標本的濃度,分別取樣本量1000μg均于-80℃冰箱中保存?zhèn)溆谩?</p><p>  1.2.2雙向凝膠電泳、染色劑脫色:第一向等點聚焦:從冰箱中取出IPG(17mm PH3-10)預(yù)制膠條分成三組,經(jīng)過與溶脹緩沖液充分混合、稀釋、過濾、蒸發(fā)制成膠條立即進行平衡、第二向SDS-PAGE

6、電泳。第二向SDS-PAGE電泳:拿出膠條放在平衡緩沖液Ⅰ中水平緩慢搖動平衡,再轉(zhuǎn)移至平衡緩沖液Ⅱ中水平緩慢搖動平衡等一系列處理后凝膠,進行染色、脫色。 </p><p>  1.2.3蛋白圖象采集與分析:染色、脫色完成后的雙向電泳凝膠,用凝膠圖像掃描儀透射掃描獲得圖像,發(fā)送圖象至ImageMaster的軟件分析程序進行下一步凝膠圖象的分析。蛋白質(zhì)斑點檢測,調(diào)整峰值、邊緣以及利用子模式中的增刪、分割等找出代表同一

7、蛋白質(zhì)的點,以比較不同凝膠中的蛋白表達情況。 </p><p>  1.2.4膠內(nèi)酶切和質(zhì)譜分析:選擇雙向凝膠電泳匹配后找到的差異非常顯著的蛋白點自動匹配,將電泳后凝膠中差異非常顯著的蛋白點切出,反復(fù)清洗,脫色后的膠塊在真空離心干燥機內(nèi)干燥,使膠塊完全脫水體積縮小成近似球狀,離心干燥。所有的PMF質(zhì)譜圖MALDI-TOF-MS分析,通過PMF鑒定蛋白質(zhì)可以根據(jù)分子量、等電點、肽段匹配數(shù)、尋找匹配的相關(guān)蛋白質(zhì)。 &

8、lt;/p><p>  1.3統(tǒng)計學(xué)方法 應(yīng)用SPSS11.5統(tǒng)計軟件包方差分析及顯著性t 檢驗。進行統(tǒng)計學(xué)處理,數(shù)據(jù)均用(x±s)表示,P值<0.05為有統(tǒng)計學(xué)意義。 </p><p><b>  2 結(jié)果 </b></p><p>  2.1蛋白質(zhì)的濃度測定結(jié)果 經(jīng)過Bradford法測得樣本蛋白質(zhì)的濃度為,正常組8.31μg/

9、μl,非萎縮組:10.61μg/μl,萎縮組9.54μg/μl。 </p><p>  2.2雙向凝膠電泳圖 見圖1。 </p><p>  2.3差異表達蛋白 根據(jù)蛋白點的面積、灰度值及光密度值等參數(shù),用ImageMaster2D Platinum Software軟件對正常組、萎縮組、非萎縮組蛋白圖譜進行分析比較,發(fā)現(xiàn)COPD患者蛋白圖譜中有17個蛋白斑點表達量與正常組有顯著差異(差異

10、為Vol%值上調(diào)或下調(diào)2倍以上),用胰蛋白酶消化后,進行MALDI-TOF-MS檢測,得到肽質(zhì)量指紋譜。徑Mascot查詢SWISSPROT數(shù)據(jù)庫,結(jié)合2-DE凝膠上蛋白點的分子量和等電點,得分超過66分(P<0.05)將被認為是可靠鑒定的結(jié)果,其中有10個超過66分,推測功能性蛋白可能為烯醇酶-1,碳酸脫水酶(碳酸脫水酶Ⅲ),肌鈣蛋白T和幾種血紅蛋白。 </p><p><b>  3 討論 &

11、lt;/b></p><p>  通過蛋白組學(xué)的方法比較正常組、非萎縮組、萎縮組的蛋白表達量的差異,本實驗研究結(jié)果發(fā)現(xiàn)幾個功能性蛋白表達量在三組中有著明顯的差異。以下將逐一詳細討論。 </p><p>  3.1烯醇酶-1(ENO1) 烯醇酶-1,是一種存在于肌肉等組織里的酶,在碳水化合物的新陳代謝中起著重要作用。在糖類的發(fā)酵、酵解中,此能量通過丙酮酸激酶的作用用于ATP的生成;還能

12、與細胞骨架蛋白和多聚核苷酸結(jié)合[1-2],是纖溶酶原、層粘連蛋白的受體等[3],ENO1作為纖維蛋白溶酶原受體、纖維蛋白溶酶原結(jié)合蛋白,將纖維蛋白溶酶原結(jié)合于細胞周圍并促其活化,活化的纖維蛋白溶酶原發(fā)揮其蛋白水解酶的作用,激活纖溶酶其表達增加將使成肌細胞表面纖溶酶的產(chǎn)生增加。在本研實驗究中,我們發(fā)現(xiàn)無論是非萎縮組還是萎縮組表達量都是上調(diào)的;推測可能在患者在長期慢性缺氧時,出現(xiàn)有氧呼吸的ATP能量生成不足,使得烯醇酶-1表達量增加來促進A

13、TP生成,這是與COPD患者氧通氣不足引起的無氧呼吸糖酵解是相吻合的;當(dāng)缺氧進一步加重時,可能出現(xiàn)烯醇酶啟動纖溶酶系統(tǒng)開始分解骨骼肌肌纖維,來滿足能量的不足,進而引起骨骼肌纖維的減少,即發(fā)生骨骼肌的萎縮;國內(nèi)外并未見有關(guān)于COPD患者骨骼肌蛋白酶在調(diào)節(jié)骨骼肌萎縮上報道,可能還存在其他途徑能使該蛋白酶在表達量上的變化,其具體途徑仍需要進一步的研究,分析該蛋白酶在調(diào)節(jié)骨骼肌蛋白分解</p><p>  3.2碳酸脫水

14、酶Ⅲ(CAⅢ) 碳酸脫水酶Ⅲ是碳酸苷酶的一種,它們都具有共同的主要功能:①在血液及其他組織中維持酸堿平衡;②幫助體內(nèi)組織排除二氧化碳;③確保以CO2和HCO3-為催化底物的酶保持適度的底物濃度,參與體內(nèi)酸堿平衡調(diào)節(jié)及離子交換等過程起重要的作用;碳酸酐酶是紅細胞的主要蛋白質(zhì)成分之一,在紅細胞中的地位僅次于血紅蛋白;本實驗結(jié)果分析發(fā)現(xiàn),存在有兩種形式碳酸脫水酶同工酶,根據(jù)肽段的匹配更接近與碳酸酐酶Ⅲ(CAⅢ)的結(jié)構(gòu),CAⅢ肽鏈均由259個氨

15、基酸組成;就目前的了解,CAⅢ除上述功能外,可能存在的生理作用主要有3點:①由于CAⅢ具有水化酶的功能,因此可以促進將I型肌纖維代謝過程中產(chǎn)生的CO2運送出細胞;②由于CAⅢ具有磷酸酶活性,它可能參與細胞內(nèi)的信號轉(zhuǎn)導(dǎo);③由于肝臟,脂肪細胞和骨骼肌的功能均與能量代謝有關(guān)。研究還發(fā)現(xiàn),在重癥肌無力患者的骨骼肌上測得CAⅢ蛋白的表達水平明顯減少[4]。對于重癥肌無力骨骼肌中CAⅢ蛋白缺乏的認識,其可能與骨骼肌的易疲勞和收縮無力有關(guān)[5]。本研

16、究結(jié)果分析,CAⅢ均在非萎縮組及萎縮組都明顯的升高,當(dāng)在copd患者中,推測原因有兩種,①由于CO2的儲留</p><p>  總之,目前工作證明了使用蛋白質(zhì)組學(xué)分析骨骼肌萎縮相關(guān)蛋白質(zhì)的可行性和有效性。本研究方法及結(jié)果將給人的骨骼肌肌肉萎縮原因帶來的可能理解,并能對臨床診斷或者藥物發(fā)現(xiàn)的潛在目的,篩選一些"疾病特異蛋白"提供幫助。 </p><p><b>

17、  參考文獻: </b></p><p>  [1]Sousa L P,Brasil B S,Silva BdeM,et al.Characterization of alpha-enolase as an interferon alpha alpha 1 regulated gene [J].Front Biosci,2012,10 (5):2534-2547. </p><p&

18、gt;  [2]Ghosh A K,Steele R,Ray R B.C2myc p romoter binding p rotein1(MBP-1) regulates p rostate cancer cell growth by inhibitingMAPK pathway[J].JBiol Chem,2005,280(14):14325-14330. </p><p>  [3] Lopez Aleman

19、y R,SuelvesM,Diaz Ramos A,et al.Alpha-enolase plasminogen recep tor in myogenesis [J].Front Biosci,2005,10(1):30-36. </p><p>  [4]都愛蓮,任惠民,呂傳真,等.P25蛋白在重癥肌無力患者中的低表達及組織和種屬特異性的研究[J].中華醫(yī)學(xué)雜志,2004,84:103-106. </

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