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文檔簡介
1、雞和鵪鶉為家禽生產(chǎn)中的常見物種,雞與鵪鶉同種不同屬,其間雜交屬于禽類中的典型屬間遠緣雜交,是基因功能研究和比較基因組學的良好資源;而雞與鵪鶉雜交種在孵化過程中大量死亡,已有研究表明雜交種胚胎的死亡與胚胎組織器官發(fā)育不完全和性分化相關(guān),而在胚胎發(fā)育、性別分化過程中參與的基因和信號通路眾多。本研究對雌、雄雞和雌、雄雜交種數(shù)字基因表達譜進行生物信息學分析篩選出與胚胎發(fā)育、性別分化相關(guān)基因,構(gòu)建基因過表達載體和 RNA干擾載體,以雞胚細胞為實驗
2、材料,調(diào)控目標基因表達量,利用實時熒光定量技術(shù)檢測相關(guān)基因表達變化,探索目標基因在表達異常時對胚胎發(fā)育的影響,為進一步研究雌性雜交種胚胎早期死亡的原因奠定基礎(chǔ)。
1.對雌雄雞與雌雄雜交種 DGE庫通過生物信息學分析篩選與胚胎發(fā)育、性分化相關(guān)顯著富集的信號通路,如 MPKA、Hedgehog、Wnt、Notch等;表達差異顯著的相關(guān)基因 FGF8、DACH、LFNG、SOX1、SOX2、SHH、FOXL2、GPR149、CCND
3、1。
2.差異基因 FGF8、SHH、FOXL2過表達載體和干擾載體的構(gòu)建,參照 NCBI上公布的原雞 FGF8、SHH基因 mRNA序列,在基因編碼區(qū)分別設(shè)計擴增全長引物,以 pEGFP-C2為載體,構(gòu)建雞 FGF8和 SHH基因過表達載體;經(jīng)菌液 PCR、酶切鑒定和測序驗證,過表達載體構(gòu)建成功。根據(jù) NCBI上公布的原雞 FGF8、SHH和 Foxl2基因的 mRNA序列,分別依據(jù)基因編碼區(qū)特點設(shè)計3對 shRNA干擾引物
4、,以 pmiRZip為載體,構(gòu)建靶向 FGF8、SHH、Foxl2基因干擾載體;經(jīng)測序驗證,干擾載體構(gòu)建成功。
構(gòu)建成功的 FGF8、SHH過表達載體和 FGF8、SHH、Foxl2干擾載體轉(zhuǎn)染雞胚細胞,驗證表達載體和干擾載體效果。
3.分析 FGF8、SHH、Foxl2基因?qū)ε咛グl(fā)育的影響,分別將 FGF8、SHH、FOXL2基因表達和干擾載體轉(zhuǎn)染雞胚細胞,檢測相關(guān)基因表達,實驗結(jié)果得出:當 FGF8基因表達量發(fā)生
5、變化時,在 MAPK信號通路中,細胞間的鏈接蛋白 Grb2表達水平降低,進而影響后續(xù)一系列信號傳遞與通路的激活,使胚胎不能正常生長發(fā)育。在 Hedgehog信號通路中,干擾 SHH基因的表達時 Hedgehog信號通路不能夠被激活而處于抑制狀態(tài),使胚胎早期不能夠正常發(fā)育,當 SHH基因過表達時,能夠成功激活 Hedgehog信號通路,并且過度激活,同樣對胚胎產(chǎn)生負面影響,例如胚胎出現(xiàn)畸形。干擾 Foxl2基因使其表達量降低,造成胚胎發(fā)育
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