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1、目的:采用基因芯片技術(shù),對(duì)比鼻咽癌轉(zhuǎn)移組、非轉(zhuǎn)移組和鼻咽良性病變組鼻咽部組織之間的基因差異,篩選鼻咽癌轉(zhuǎn)移相關(guān)基因表達(dá)譜,探討鼻咽癌轉(zhuǎn)移機(jī)制。 方法:設(shè)立鼻咽癌轉(zhuǎn)移組為A組即實(shí)驗(yàn)組,鼻咽癌非轉(zhuǎn)移組為B組即對(duì)照組,鼻咽良性病變組織為C組。分別抽提各組中每個(gè)樣本的RNA,鑒定質(zhì)量后,各組中每個(gè)樣本取等量RNA混合為一個(gè)樣本池,采用逆轉(zhuǎn)錄的方法,制成cDNA鏈,以兩種熒光Cy3和Cy5標(biāo)記后作為探針,與SBC人16KcDNA表達(dá)譜芯片
2、進(jìn)行雜交。用生物統(tǒng)計(jì)學(xué)及生物信息學(xué)方法分析它們之間的基因差異表達(dá);并采用實(shí)時(shí)熒光定量PCR驗(yàn)證基因芯片篩選結(jié)果。 結(jié)果:三組數(shù)據(jù)分析后顯示鼻咽癌轉(zhuǎn)移組和非轉(zhuǎn)移組之間有2倍共同差異表達(dá)的基因134個(gè),其中上調(diào)基因107個(gè),下調(diào)基因27個(gè)。涉及基因包括細(xì)胞粘附基因、細(xì)胞外基質(zhì)蛋白、細(xì)胞周期基因、細(xì)胞生長(zhǎng)增殖基因、凋亡基因、轉(zhuǎn)錄因子及調(diào)控等。實(shí)時(shí)熒光定量PCR驗(yàn)證FN1等6個(gè)基因,結(jié)果與基因芯片一致。 結(jié)論:用基因芯片技術(shù)篩選
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