小葉楊抗逆相關(guān)基因的克隆及單核苷酸多態(tài)性分析.pdf

1、小葉楊(Populus simonii Carr)是我國重要的鄉(xiāng)土林木資源，具有優(yōu)良的抗逆基因資源，但很少有人對影響這些抗逆性狀的分子遺傳學(xué)機(jī)制進(jìn)行深入研究，因此，探明影響這些性狀的分子遺傳學(xué)基礎(chǔ)，尤其是分離控制它們的基因并對其進(jìn)行核苷酸多樣性分析就顯得尤為必要。本論文以小葉楊為材料，分別對BREB1D基因、熱激轉(zhuǎn)錄因子基因進(jìn)行了克隆、回收、純化、連接、轉(zhuǎn)化和測序。分析基因的序列，得到如下研究結(jié)果: 1.PsHSFB基因長度為2

2、884bp基因內(nèi)部含有完整的編碼閱讀框架，可編碼466個氨基酸殘基，所推導(dǎo)的蛋白質(zhì)序列與擬南芥和葡萄HSF蛋白的同源性分別為63％和78％。在此基礎(chǔ)上，組合利用MEGA3.1和DNASP4.0軟件對小葉楊16株基因型個體的HSFB序列進(jìn)行了比對和分析，共檢測到107個SNPs位點，多態(tài)性頻率為1/27bp。其中常見SNPs為42個，而罕見SNPs為65個。在PsHSFB基因內(nèi)部發(fā)生的單核苷酸變異中，有71個屬于轉(zhuǎn)換，有36個屬于顛換。在

3、外顯子區(qū)域，共檢測到52個SNPs位點，其中有15個為同義突變，37個為錯義突變。 2.PsDREB1D基因長度為800bp，基因內(nèi)部含有完整的開放閱讀框，可以編碼長度為240個氨基酸殘基的蛋白質(zhì)，蛋白質(zhì)的Mw約為33kDa，等電點為4.85，并分析了該基因蛋白質(zhì)在16個物種中的系統(tǒng)進(jìn)化關(guān)系，以及該基因內(nèi)部的單核苷酸多態(tài)性和連鎖不平衡關(guān)系。經(jīng)過分析，小葉楊DREB1D與毛果楊該基因的序列同源關(guān)系最近。小葉楊該基因的SNP頻率是0