肉牛PPARG基因單核苷酸多態(tài)性的研究.pdf

1、本研究采用PCR-SSCP技術(shù)與DNA測序相結(jié)合的方法對延邊黃牛和紅安格斯×西門塔爾(安格斯)、德國黃?！廖鏖T塔爾(德國黃)、利木贊×西門塔爾(利木贊)、夏洛萊×西門塔爾(夏洛萊)4個二元雜交牛群體PPARG基因全部外顯子及部分內(nèi)含子進(jìn)行SNP檢測，分析PPARG基因的遺傳特性，以期找到與延邊黃牛肉質(zhì)性狀相關(guān)的SNPs位點，并對其關(guān)聯(lián)性進(jìn)行分析，結(jié)果如下：
　　1．PPARG基因第1內(nèi)含子發(fā)現(xiàn)1個突變位點：g.26106 A→G；

2、第2外顯子發(fā)現(xiàn)1個突變位點：g.26760 T→C；第3外顯子發(fā)現(xiàn)1個突變位點：g.28735T→C；第5外顯子發(fā)現(xiàn)2個突變位點：分別為g.42945 A→G、g.43043 T→A；第6外顯子發(fā)現(xiàn)2個突變位點：分別為g.54266 A→G、g.54359 T→A；第1、4和7外顯子不存在突變位點。
　　2．對存在多態(tài)的intron1、exon3、exon5和exon6進(jìn)行遺傳變異分析，分析了各多態(tài)位點在延邊黃牛和紅安格斯×西門塔

3、爾(安格斯)、德國黃?！廖鏖T塔爾(德國黃)、利木贊×西門塔爾(利木贊)、夏洛萊×西門塔爾(夏洛萊)4個二元雜交牛群體中的多態(tài)信息含量(PIC)、純合度(Ho)、雜合度(He)、均質(zhì)度(H.I)和有效等位基因數(shù)(Ne)。結(jié)果發(fā)現(xiàn)4個多態(tài)位點均處于Hardy-Weinberg平衡狀態(tài)。intron1多態(tài)位點中延邊黃牛和安格斯、德國黃、利木贊3個二元雜交牛群體的多態(tài)信息含量(PIC)均處于中度多態(tài)，夏洛萊牛群體的多態(tài)信息含量(PIC)處于低度

4、多態(tài)；在exon3、exon5和exon6三個多態(tài)位點中延邊黃牛和4個二元雜交牛群體的多態(tài)信息含量(PIC)均處于中度多態(tài)。
　　3．采用一般線性模型進(jìn)行了PPARG基因多態(tài)性與延邊黃牛肉用性狀的關(guān)聯(lián)分析，結(jié)果顯示：intron1多態(tài)位點中的TT基因型在降低牛肉蒸煮損失和提高花生四烯酸含量上有一定的正效應(yīng)(P＜0.05)；CT基因型在提高組氨酸含量上有一定的正效應(yīng)(P＜0.01)。exon3多態(tài)位點中CC基因型對提高蘇氨酸、谷氨酸