CDH17基因單核苷酸多態(tài)性與胃癌的相關(guān)性.pdf

1、背景與目的:在當(dāng)今世界,惡性腫瘤已經(jīng)成為了威脅人類健康疾病之一,其嚴(yán)重影響了患者的生命質(zhì)量。尤其是對(duì)早期診斷困難、侵襲轉(zhuǎn)移速度快、5年生存率低的惡性腫瘤來說,更是加重了人類的負(fù)擔(dān)。胃癌是威脅人類生命健康最常見的惡性腫瘤之一,每年大約有70萬的人口死于胃癌。在全球最常見的惡性腫瘤中胃癌排第4位,僅次于肺癌、腸癌和乳腺癌。胃癌癌變的遺傳機(jī)制很復(fù)雜,目前尚沒有將基因檢測(cè)應(yīng)用在胃癌的臨床實(shí)踐中,但是隨著胃癌分子病理學(xué)的進(jìn)步,人們對(duì)胃癌的認(rèn)識(shí)有了

2、顯著的提高。開展遺傳檢測(cè),基于遺傳學(xué)研究的新型生物標(biāo)記物已廣泛應(yīng)用于科研領(lǐng)域。
　　 單核苷酸多態(tài)性(簡(jiǎn)稱SNPs)是第三代遺傳標(biāo)記,是個(gè)體基因變化最重要的形式之一。單核苷酸多態(tài)性具有分布廣泛、遺傳穩(wěn)定性和易于快速、規(guī)模化篩查等優(yōu)點(diǎn)。目前,基因的單核苷酸多態(tài)性與疾病的遺傳易感性、患者對(duì)臨床藥物治療的敏感性、預(yù)后等領(lǐng)域得到重視和研究,將對(duì)與基因相關(guān)疾病(如腫瘤)的預(yù)防、早期診斷及臨床個(gè)體化治療方案的選擇發(fā)揮積極的作用。
　　

3、 CDH17基因即cadherin17,又稱為L(zhǎng)I-cadherin或liver-intestine cadherin,位于8q22.1,是鈣黏蛋白超家族中特殊的一員,是與胃癌相關(guān)的粘附分子基因,在介導(dǎo)細(xì)胞連接等方面有其自身特點(diǎn)。本實(shí)驗(yàn)分析CDH17基因外顯子6A58G位點(diǎn)和外顯子17A49C位點(diǎn)基因型分布頻率與等位基因型分布頻率,旨在探討該兩個(gè)位點(diǎn)的單核苷酸多態(tài)性與胃癌人群的遺傳易感性、臨床病理因素之間是否有關(guān),以期為胃癌發(fā)生發(fā)展的

4、分子機(jī)制提供理論依據(jù)。
　　 材料與方法:
　　 1.采集68例中國(guó)河南省漢族胃癌患者外周靜脈血標(biāo)本,采集時(shí)間為2009年12月至2010年4月。68例胃癌患者均在鄭州大學(xué)第一附屬醫(yī)院住院治療,于患者術(shù)前采血1ml保存?zhèn)溆谩?br>　　 2.采用離心柱法、溶液法對(duì)68例中國(guó)河南省漢族胃癌患者的外周靜脈血基因組DNA進(jìn)行提取。
　　 3.采用聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)-單鏈構(gòu)象多態(tài)性(PCR-SSCP)法對(duì)68例中國(guó)河南省漢

5、族胃癌患者的CDH17基因外顯子6A58G位點(diǎn)和外顯子17A49C位點(diǎn)進(jìn)行基因分型的篩選,并使用DNA直接測(cè)序法對(duì)基因分型結(jié)果進(jìn)行驗(yàn)證。
　　 4.統(tǒng)計(jì)學(xué)處理:采用SPSS17.0統(tǒng)計(jì)軟件,對(duì)無序分類資料采用x2檢驗(yàn),以優(yōu)勢(shì)比(OR)及其95％可信區(qū)間(95％CI)表示相對(duì)風(fēng)險(xiǎn)度,運(yùn)用Logistic回歸模型計(jì)算OR及其95％CI；對(duì)有序分類資料采用秩和檢驗(yàn),通過比較平均秩次判斷風(fēng)險(xiǎn)度大小。統(tǒng)計(jì)檢驗(yàn)中涉及單雙側(cè)概率時(shí),采用雙側(cè)概

6、率檢驗(yàn),取檢驗(yàn)水準(zhǔn)α=0.05,對(duì)于多分類樣本中每?jī)深愰g的比較采用Bonferroni法。
　　 結(jié)果:
　　 1.CDH17基因外顯子6A58G位點(diǎn)基因型A／G型有52例(76.47％),G／G型有11例(16.18％),A／A型有5例(7.35％)。等位基因G的頻率為54.41％,等位基因A的頻率為45.59％。
　　 2.CDH17基因外顯子6A58G位點(diǎn)基因型分布頻率與胃癌患者的性別、年齡、腫瘤直徑、大體

7、形態(tài)、組織學(xué)類型、浸潤(rùn)深度、分化程度無關(guān),與淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移、TNM分期有關(guān)。
　　 3.CDH17基因外顯子17A49C位點(diǎn)基因型A／C26例(38.24％),基因型A／A17例(25.00％),基因型C／C25例(36.76％)。等位基因A頻率為44.12％,等位基因C頻率為55.88％。
　　 4.CDH17基因外顯子17A49C位點(diǎn)基因型分布頻率與胃癌患者的性別、年齡、腫瘤直徑、大體形態(tài)、組織學(xué)類型、浸潤(rùn)深度、分化程度

8、、淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移和TNM分期均無關(guān)。
　　 結(jié)論:
　　 (1)CDH17基因外顯子6A58G位點(diǎn)的單核苷酸多態(tài)性與胃癌的淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移、TNM分期有關(guān),可能基因改變影響胃癌轉(zhuǎn)移相關(guān)蛋白功能改變。
　　 (2)CDH17基因外顯子17A49C位點(diǎn)的單核苷酸多態(tài)性與胃癌人群的性別、年齡、腫瘤直徑、大體形態(tài)、組織學(xué)類型、浸潤(rùn)深度、分化程度、淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移、TNM分期無關(guān)。
　　 (3)CDH17基因外顯子6A58G位點(diǎn)的