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1、目的:探討放、化療作用相關(guān)通路基因多態(tài)性與初治局部區(qū)域晚期鼻咽癌患者預(yù)后的關(guān)系。
方法:入組203例局部區(qū)域晚期鼻咽癌患者。檢測(cè)屬于放療通路或順鉑/氟尿嘧啶通路的13個(gè)基因、18個(gè)位點(diǎn)的單核苷酸多態(tài)性(SNPs),采用Kaplan-Meier法進(jìn)行生存分析,采用Cox回歸模型進(jìn)行多因素分析。SHEsis軟件進(jìn)行基因連鎖不平衡分析和單體型遺傳關(guān)聯(lián)分析。支持向量機(jī)(SVM)構(gòu)建局部區(qū)域晚期鼻咽癌患者五年生存情況預(yù)測(cè)模型。
2、> 結(jié)果:
⑴Kaplan-Meier分析顯示,攜帶rs25487(XRCC1 G>A Arg399Gln)AA、rs1136410(PARP1 T>C Val762Ala)CC+TT基因型的患者總生存率(OS)降低;攜帶rs2032582(ABCB12677 G>T>A)AT基因型的患者無局部區(qū)域復(fù)發(fā)生存率(LRFS)降低;攜帶rs25487(XRCC1 G>AArg399Gln)AA、rs2010963(VEGF
3、405G>C)CC、rs833061(VEGF-460 C>T)CT+TT基因型的患者無遠(yuǎn)處轉(zhuǎn)移生存率(DMFS)降低;攜帶rs3212986(ERCC18092 G>T)GG、rs25487(XRCC1 G>AArg399Gln)AA、rs2032582(ABCB12677 G>T>A)AT、rs2279744(MDM2 SNP309T>G)GG+GT基因型的患者無進(jìn)展生存率(PFS)降低。
⑵經(jīng)Cox比例風(fēng)險(xiǎn)模型對(duì)年齡
4、、性別、T分期、N分期、總分期、是否化療及血漿EBV DNA水平等預(yù)后因素進(jìn)行校正后,上述位點(diǎn)除rs833061(VEGF-460C>T)CT+TT基因型外,均為預(yù)后的獨(dú)立危險(xiǎn)因素(P<0.05)。
⑶單體型分析顯示,在rs1045642(ABCB13435 C>T)和rs2032582(ABCB12677 G>T>A)的聯(lián)合分析中,C-G型(P=0.0286)與C-T型(P=0.0129)單體型在死亡組和生存組分布具有顯
5、著差異。在rs2010963(VEGF405 G>C)和rs833061(VEGF-460 T>C)的聯(lián)合分析中,C-T型單體型在轉(zhuǎn)移組和非轉(zhuǎn)移組分布具有顯著差異(P=0.017)。
⑷SVM構(gòu)建預(yù)測(cè)模型,對(duì)于局部晚期鼻咽癌患者的5年生存情況預(yù)測(cè),準(zhǔn)確率為81.0%,敏感性和特異性分別為80.0%和81.3%。
結(jié)論:放化療相關(guān)通路中的多個(gè)基因SNPs是影響局部區(qū)域晚期鼻咽癌的獨(dú)立預(yù)后因素,為鼻咽癌的個(gè)體化治
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