從轉(zhuǎn)錄水平研究5種新基因在大鼠肝再生中的作用.pdf

1、肝臟具有很強(qiáng)的再生能力。當(dāng)肝臟因創(chuàng)傷、手術(shù)、感染壞死、中毒等原因造成肝損傷后，殘存的肝臟細(xì)胞在生長(zhǎng)因子、激素、信號(hào)通路等多種因素的調(diào)控下由G0期迅速進(jìn)入G1期，并通過有絲分裂和細(xì)胞增殖迅速再生恢復(fù)至原有的體積和重量，最終達(dá)到肝組織結(jié)構(gòu)的重建及肝功能恢復(fù)，這一過程被稱為肝再生。肝再生是一個(gè)相當(dāng)復(fù)雜的生理過程，涉及多種基因/蛋白的參與調(diào)控，了解相關(guān)基因/蛋白在肝再生中的作用是揭示肝再生分子機(jī)制的必要環(huán)節(jié)。為此，本研究建立2/3肝切除誘導(dǎo)的大

2、鼠肝再生模型(PH)，并用大鼠基因表達(dá)譜芯片Rat Genome2302.0檢測(cè)PH后10個(gè)恢復(fù)點(diǎn)的基因表達(dá)變化，結(jié)果發(fā)現(xiàn)，在檢出的13922個(gè)基因中，3886個(gè)基因至少在大鼠肝再生中的一個(gè)時(shí)間點(diǎn)的表達(dá)豐度大于等于對(duì)照3倍或小于等于對(duì)照0.33倍，稱為有意義表達(dá)變化基因。其中，C5ORF45、C11ORF96、C7ORF42、CXORF23、C3ORF43分別和254、9、85、10、18個(gè)已知基因的表達(dá)變化趨勢(shì)一致，稱為共表達(dá)基因。進(jìn)

3、一步分析上述共表達(dá)基因參與的信號(hào)通路與生理活動(dòng)發(fā)現(xiàn)，C5ORF45的254個(gè)共表達(dá)基因共參與93種信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)和37種生理活動(dòng);C11ORF96的9個(gè)共表達(dá)基因共參與65種信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)和21種生理活動(dòng);C7ORF42的85個(gè)共表達(dá)基因共參與67種信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)和35種生理活動(dòng);CXORF23的10個(gè)共表達(dá)基因共參與7種信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)和13種生理活動(dòng);C3ORF43的18個(gè)共表達(dá)基因共參與9種信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)和20種生理活動(dòng)。然后，分別按共表達(dá)基因數(shù)和共表達(dá)基因比例

4、計(jì)算上述信號(hào)通路和生理活動(dòng)的綜合排名，將排名前四初步確定為新基因C5ORF45、C11ORF96、C7ORF42、CXORF23、C3ORF43可能參與的信號(hào)通路/生理活動(dòng)，再比對(duì)兩種方法得到的前四名信號(hào)通路/生理活動(dòng)，最終將兩種方法中均出現(xiàn)者確認(rèn)為新基因C5ORF45、C11ORF96、C7ORF42、CXORF23、C3ORF43在大鼠肝再生中可能參與的信號(hào)通路/生理活動(dòng)。結(jié)果表明，新基因C5ORF45在大鼠肝再生中可能通過參與Te

5、c激酶信號(hào)通路和eNOS信號(hào)通路來發(fā)揮作用;新基因C11ORF96在大鼠肝再生中可能通過參與PPAR信號(hào)通路和細(xì)胞分化、細(xì)胞存活、氨基酸代謝、血管生成4種生理活動(dòng)來發(fā)揮作用;新基因C7ORF42在大鼠肝再生中可能通過參與Tec激酶信號(hào)通路、p38MAPK信號(hào)通路、STAT3信號(hào)通路3種信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)和細(xì)胞內(nèi)環(huán)境的穩(wěn)定、凝集2種生理活動(dòng)來發(fā)揮作用;新基因CXORF23在大鼠肝再生中可能通過參與樁蛋白信號(hào)通路和細(xì)胞發(fā)育、細(xì)胞生長(zhǎng)、細(xì)胞分化和細(xì)胞運(yùn)