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文檔簡介
1、Pde4d基因位于小鼠13號染色體,該基因的編碼產(chǎn)物是磷酸二酯酶超家族(Phosphodiesterase, PDE)成員之一。因其專一性水解細胞內(nèi)的環(huán)腺苷酸(cAMP),可在cAMP/CREB和cAMP/EPAC細胞信號通路中發(fā)揮重要的作用。有研究指出,Pde4d是一個父本偏好的基因,并對遺傳疾病和腫瘤發(fā)生有重要的影響,但是此研究中的SNP位點不能準確反映Pde4d的印記特點,且該基因與胚胎發(fā)育的關(guān)系并不十分清楚。因此,本文通過PCR
2、產(chǎn)物直接測序法對Pde4d基因座在發(fā)育中的印記特點進行分析;通過了解Pde4d在胚胎發(fā)育中的表達模式與調(diào)控特點,揭示其在胚胎發(fā)育中的潛在功能;并以骨髓間充質(zhì)干細胞MS-K為研究模型,探討PDE4D對MS-K細胞增殖和遷移的影響,旨在揭示該基因可能在胚胎發(fā)育中具有的作用。
本研究為明確Pde4d在小鼠胚胎發(fā)育中的印記特點,首先利用生物信息學(xué)對Pde4d基因座進行分析。研究發(fā)現(xiàn),Pde4d印記報道中的SNP位于內(nèi)含子中的轉(zhuǎn)錄單元-
3、AK046832內(nèi)部,表明AK046832具有父本表達偏好的印記特點。同時分析發(fā)現(xiàn),基因座內(nèi)部存在兩個CpG島(CGI1和CGI2)在發(fā)育過程中甲基化狀態(tài)發(fā)生了明顯改變,暗示CGI1和CGI2對Pde4d基因座的印記表達具有潛在的調(diào)控作用;其次,印記分析發(fā)現(xiàn),Pde4d、AK046832和miR-1904具有不同的印記方式,Pde4d在E9.5天全胚胎及胎盤中具有父本偏好的表達特點,但在E15.5天的主要臟器及胎盤中呈現(xiàn)出雙等位表達,而
4、AK046832和miR-1904在發(fā)育過程中表現(xiàn)為雙等位表達。這些結(jié)果表明,Pde4d在胚胎發(fā)育過程中是一個印記模式動態(tài)變化的基因。
由于Pde4d在小鼠胚胎發(fā)育中的時空表達特點還不清楚,故本研究通過實時定量PCR(qRT-PCR)以及RNA原位雜交技術(shù)對該基因在胚胎和胎盤中的表達譜進行分析。qRT-PCR結(jié)果顯示,在胚胎早期發(fā)育中,Pde4d的表達水平從2-細胞到桑椹胚階段呈現(xiàn)下降趨勢,而在囊胚中顯著降低;在中后期(E9.
5、5-E18.5)胚胎內(nèi),該基因表達升高;Pde4d在胎盤中表達穩(wěn)定并且僅在發(fā)育后期表達上調(diào)。原位雜交分析發(fā)現(xiàn),Pde4d主要在中期(E9.5-E11.5)胚胎的神經(jīng)系統(tǒng)以及體節(jié)中高表達,在器官形成階段(E12.5-E15.5),表達信號廣泛存在于除心臟外的主要臟器內(nèi);在胎盤發(fā)育過程中,Pde4d的表達具有動態(tài)變化的特點,在 E11.5天胎盤中,Pde4d明顯表達在成膠質(zhì)細胞層以及迷路層,在E12.5-E15.5天,Pde4d在迷路層的表
6、達信號減弱,而在成膠質(zhì)細胞層內(nèi)表達增強。發(fā)育至 E16.5天,位于蛻膜層內(nèi) Pde4d的表達信號開始增強,隨著胎盤的進一步發(fā)育,在E17.5-E18.5天胎盤的三層結(jié)構(gòu)中能明顯檢測到Pde4d的表達信號。以上結(jié)果顯示,Pde4d在胚胎和胎盤發(fā)育中是一個動態(tài)變化且廣泛表達的基因。
根據(jù) Pde4d基因座啟動子和內(nèi)含子轉(zhuǎn)錄單元的特點,本研究主要對DNA甲基化及內(nèi)含子miRNA的調(diào)控方式進行分析。研究表明,Pde4d啟動子區(qū)內(nèi)的Cp
7、G位點以組織特異性甲基化的方式影響E15.5天臟器內(nèi)Pde4d的表達水平;同時,在肝臟組織內(nèi),啟動子區(qū)內(nèi)的CpG位點以發(fā)育階段特異性甲基化的方式影響基因的表達。通過5-aza-cdR對細胞進行去甲基化處理,進一步證明Pde4d啟動子區(qū)內(nèi)的DNA甲基化與基因的表達水平相關(guān);此外,通過生物信息學(xué)預(yù)測及熒光素酶報告基因系統(tǒng)驗證,內(nèi)含子中的miR-1904能夠靶向其宿主基因Pde4d,在細胞中過表達 miR-1904會抑制 Pde4d蛋白水平的
8、表達,故內(nèi)含子miR-1904能夠直接調(diào)控Pde4d的表達。因此,該結(jié)果表明基因啟動子的甲基化及內(nèi)含子miR-1904是調(diào)控Pde4d表達的重要因素。
為進一步解析Pde4d基因的功能,本研究分析了短亞型PDE4D1及長亞型PDE4D7對細胞增殖和遷移能力的影響。研究結(jié)果表明,過表達 PDE4D1和PDE4D7能顯著抑制MS-K細胞增殖及克隆形成,并引起細胞內(nèi)Cyclin D1的表達上調(diào),從而導(dǎo)致細胞 G1期縮短,提前進入 S
9、期;其次,兩個亞型均顯著降低MS-K細胞的遷移與鋪展能力,并且發(fā)現(xiàn)Vinculin基因表達上調(diào),Integrinβ1基因表達下調(diào);再次,兩個亞型引起了MS-K細胞與增殖和遷移相關(guān)基因表達的下調(diào);最后,體內(nèi)細胞移植實驗表明,PDE4D7的過表達對MS-K細胞的生長具有顯著的抑制作用。以上結(jié)果均表明,PDE4D1和PDE4D7在體內(nèi)和體外都能顯著抑制MS-K細胞的增殖和遷移能力。
綜上所述,Pde4d是一個在胚胎發(fā)育中印記模式動態(tài)
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