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文檔簡介
1、本研究根據(jù)鱸魚抗菌肽Hepcidin基因(GenBank登錄號AY5472821)的cDNA序列設(shè)計(jì)了一對特異引物,利用RT-PCR技術(shù)從石斑魚肝臟中擴(kuò)增到一條基因片段,并采用RACE技術(shù),獲得了該基因的全長592bp的cDNA序列(GenBank登錄號:DQ177321)。該基因含有一個(gè)261bp堿基的閱讀框(ORF),可編碼87個(gè)氨基酸的多肽,包括24個(gè)氨基酸的信號肽、40個(gè)氨基酸的優(yōu)勢域和23個(gè)氨基酸的成熟肽(內(nèi)含4個(gè)半胱氨酸);
2、預(yù)測成熟肽分子量約為2465.8Da,等電點(diǎn)PI為5.97,是一種陰離子肽。BLAST檢索表明,該多肽與其他肽類的同源性較低,但與多種魚類來源的Hepcidin抗菌肽的同源性較高,推測是魚類Hepcidin抗菌肽家族的一個(gè)新成員。 運(yùn)用PCR和反向PCR技術(shù)擴(kuò)增獲得其基因組DNA序列,與已知Hepcidin基因的結(jié)構(gòu)組成相同,均由3個(gè)外顯子和2個(gè)內(nèi)含子組成。第一個(gè)外顯子包含5′ UTR、信號肽和部分優(yōu)勢域編碼序列,第二個(gè)外顯子僅
3、編碼部分優(yōu)勢域,而第三個(gè)外顯子編碼部分的優(yōu)勢域和成熟肽序列以及3′ UTR。分析基因組DNA上游區(qū)域,發(fā)現(xiàn)含有多個(gè)調(diào)控序列,包括TATA框和cap帽子結(jié)構(gòu),確認(rèn)的轉(zhuǎn)錄起始位點(diǎn)與擴(kuò)增得到的Hepcidin cDNA的5′端起始序列一致;另外還發(fā)現(xiàn)了上游調(diào)控區(qū)內(nèi)多種轉(zhuǎn)錄因子的結(jié)合位點(diǎn)。 將不含信號肽的該基因cDNA編碼序列與融合表達(dá)載體pTrc-CKS連接,轉(zhuǎn)化入E.coli TOP10F′表達(dá)菌株,IPTG誘導(dǎo)后得到的表達(dá)產(chǎn)物主要
4、以包涵體為主,上清中的部分可溶性蛋白經(jīng)過金屬鏊合層析純化后,得到較高純度的融合蛋白,經(jīng)重組人鼻病毒14亞型P3C蛋白酶酶切,獲得了分子量約為14 kDa的融合表達(dá)目的蛋白的酶切產(chǎn)物。 研究了融合表達(dá)蛋白酶切產(chǎn)物對4種細(xì)菌的抗菌作用,發(fā)現(xiàn)該蛋白能夠選擇性抑制部分革蘭氏陽性菌(如金黃色葡萄球菌、溶壁微球菌)和革蘭氏陰性菌(如大腸桿菌)的生長,但對表皮葡萄球菌無抗菌活性:65℃水浴60 min后仍對溶壁微球菌具有抗菌活性,表明該蛋白具
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