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文檔簡介
1、實驗目的
1.在實驗研究過程中我們對家蠅抗菌肽防御素(defensin)基因進行生物信息學的分析;并應用分子生物學方法從家蠅幼蟲體內提取抗菌肽防御素(defensin)基因,并對該基因進行克隆、表達與純化。
2.鑒定已純化的家蠅幼蟲抗菌肽防御素成熟肽(MD)部分對大腸桿菌E.coliK12D31的抑制作用;觀察抗菌肽防御素成熟肽(MD)對腫瘤細胞HepG2,SIHA,SW480和對人正常心肌細胞H9C2的抑制及殺傷作
2、用;比較該防御素成熟肽(MD)與羥基脲分別對肝癌細胞HepG2的作用效果。
3.觀察家蠅幼蟲抗菌肽防御素成熟肽(MD)對肝癌細胞HepG2細胞周期的影響;觀察家蠅幼蟲抗菌肽防御素成熟肽(MD)對肝癌細胞HepG2細胞凋亡的影響;觀察家蠅幼蟲抗菌肽防御素成熟肽(MD)對肝癌細胞HepG2凋亡蛋白半胱天冬氨酸蛋白酶-3(caspase-3)的影響,從而探究抗菌肽防御素成熟肽(MD)殺傷肝癌細胞HepG2的作用機制與原理。
3、 實驗方法
我們對家蠅抗菌肽防御素(defensin)基因的主要特性進行生物信息學的分析。應用蛋白質分析專家系統(ExPASy)上的SOSUI、ProtParam、HNN、TMHMM、MotifScan和NCBI上的ORFfinder、Bcepred等生物信息學在線分析軟件進行分析,并結合DNAman、GeneRunner等生物信息學分析軟件進行分析、預測家蠅抗菌肽防御素defensin蛋白的可溶性及理化性質、翻譯后修飾位點、
4、跨膜區(qū)、親(疏)水性、二級結構、三級結構及同源性分析,以及遺傳關系的比對等。
在Genbank中檢索家蠅defensin基因,根據其設計特異性引物,我們在家蠅幼蟲組織中提取RNA,并通過PCR聚合酶鏈反應擴增defensin基因成熟肽部分(Maturedefensin,MD),并將該基因與原核質粒表達載體pGEX-6P-1進行質粒重組,構建家蠅抗菌肽重組蛋白pGEX-6P-1/MD。通過雙酶切鑒定證明目的片段已穩(wěn)定融合到載體p
5、GEX-6P-1中并將其轉化至BL21(DE3)感受態(tài)細胞中,經25℃IPTG誘導在大腸桿菌E.ColiDH5ɑ中表達,用GST-Sefinose親和層析純化蛋白,表達產物經15%SDS-PAGE分析鑒定。
應用四甲基偶氮噻唑藍(MTT)法求出不同濃度抗菌肽MD對SW480,SIHA,HepG2腫瘤細胞的抑制率及對人心肌細胞H9C2的抑制作用。用MTT法對不同濃度抗菌肽防御素作腫瘤細胞的生長曲線。采用MTT比色法分別求出不同濃
6、度抗菌肽防御素與羥基脲對肝癌細胞HepG2的抑制率,依據藥物濃度和抑制率用SPSS軟件求出防御素和羥基脲的半數抑制率(medianinhibitoryconcentration,IC50)和回歸方程。我們采用AnnexinV-Fitc-PI雙染凋亡檢測試劑盒檢測抗菌肽防御素MD,檢測它能否引起肝癌細胞HepG2的細胞凋亡。我們用流式細胞儀檢測抗菌肽防御素MD,觀察它對肝癌細胞HepG2細胞周期及凋亡的影響。本實驗室應用caspase-3
7、檢測試劑盒與酶標測定儀檢測該蛋白caspase-3酶的活性。
實驗結果
我們通過生物信息學分析defensin蛋白由92個氨基酸組成,該蛋白的分子式為C435H670N126O124S9,它的分子質量單位為9.9374ku,計算它的等電點理論值為8.75,檢測波長280nm時的吸光度(A)值為0.637,半衰期為30h,該蛋白具有4個翻譯后修飾位點。家蠅防御素與其他三種蠅科昆蟲防御素同源性較近。
以家蠅幼蟲
8、抗菌肽防御素成熟肽MD的cDNA為摸板進行擴增后獲得的堿基長度為142bp的defensin基因片段,本實驗成功構建重組質粒pGEX-6P-1/MD;之后菌液通過IPTG誘導后進行SDS-PAGE膠進行分析,實驗結果顯示了在大腸桿菌BL21(DE3)中防御素成熟肽MD基因片段高效表達,它的相對分子量(Mr)約30kDa。
本實驗抑菌實驗結果顯示家蠅幼蟲抗菌肽防御素對大腸桿菌E.coliK12D31有抑殺作用;我們用MTT法檢測
9、顯示六種不同濃度(30μg/ml,60μg/ml,120μg/ml,360μg/ml,680μg/ml,1000μg/ml)抗菌肽防御素MD對SW480,SIHA,HepG2腫瘤細胞均有不同程度的抑制作用,實驗結果與正常對照組比較結果具有統計學意義(p<0.05);這六種不同濃度抗菌肽防御素對人心肌細胞H9C2均無較明顯抑制作用,其實驗結果與正常對照組相比較無統計學意義(p>0.05);三種腫瘤細胞SW480,SIHA,HepG2在不同
10、濃度抗菌肽防御素MD作用下生長受到明顯抑制,防御素濃度和作用時間對細胞的抑制作用呈劑量反應關系;經計算防御素與羥基脲的回歸方程分別為=-1.566+0.529x和=-2.342+0.597x,它們的IC50半數抑制率分別是909μg/ml和8416μg/ml,結果顯示兩者的IC50相差較大,那么表明防御素的細胞增殖抑制作用比羥基脲高。
用流式細胞儀檢測抗菌肽防御素MD對人肝癌細胞HepG2細胞周期的影響結果:結果顯示GI期與M
11、期的細胞比例有所增加,而S期細胞比例反而下降。顯示結果中只有GI期和S期與PBS對照組相比具有統計學意義(p<0.01),說明抗菌肽防御素MD使HepG2細胞周期在GI期停滯致使S期DNA的合成受到抑制。SW480,SIHA,HepG2這幾種腫瘤細胞之間的增殖抑制率在不同濃度組抗菌肽防御素MD作用下均無統計學意義(p>0.05)??咕姆烙豈D對HepG2細胞caspase-3含量的影響結果:防御素組caspase-3的含量高于PBS
12、對照組,兩者比較差異具有統計學意義。
結論
通過生物信息學發(fā)現家蠅幼蟲抗菌肽防御素defensin基因具有其特定的結構,可能具有抗菌活性及其他生物學活性;家蠅抗菌肽融合蛋白pGEX-6P-1/MD被成功克隆和表達,證明這三種腫瘤細胞SW480,SIHA,HepG2都能被純化蛋白MD抑制殺傷,這為以后研發(fā)家蠅抗菌肽防御素類藥物提供了依據。
抗菌肽防御素MD能夠抑制大腸桿菌生長繁殖活性;SW480,SIHA,H
13、epG2三種腫瘤細胞均能被抗菌肽MD所抑制,但正常人體心肌細胞H9C2不能被其抑制;抗菌肽防御素比羥基脲對HepG2細胞具有更好的增殖抑制作用;SW480,SIHA,HepG2腫瘤細胞的抑制作用與抗菌肽MD呈劑量效應關系;將傳統抗腫瘤藥物與家蠅抗菌肽防御素MD比較,家蠅抗菌肽MD既能有效殺傷腫瘤細胞,又不損傷正常人體心肌細胞H9C2;家蠅抗菌肽MD可能通過兩種途徑發(fā)揮抑制腫瘤作用:肝癌細胞HepG2細胞周期受到抑制S期DNA的合成的影響
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