2023年全國碩士研究生考試考研英語一試題真題(含答案詳解+作文范文)_第1頁
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文檔簡介

1、革蘭氏陰性(G-)菌感染引起的膿毒癥(sepsis)是重癥監(jiān)護(hù)病房(intensivecare unit,ICU)常見的致死原因。脂多糖(lipopolysaccharide,LPS)是G-菌細(xì)胞壁的主要成分,也是其致病的關(guān)鍵成分。由于LPS的識別和信號轉(zhuǎn)導(dǎo)是宿主對G-菌發(fā)生防御反應(yīng)的關(guān)鍵,所以對LPS信號轉(zhuǎn)導(dǎo)的研究一直是相關(guān)領(lǐng)域的熱點(diǎn)。研究發(fā)現(xiàn),血漿中的LPS首先和LPS結(jié)合蛋白(LPS binding protein,LBP)結(jié)合,

2、LBP募集并將LPS轉(zhuǎn)運(yùn)到CD14(cluster of differentiation-14)。CD14能結(jié)合并聚集LPS信號,但由于它缺乏跨膜區(qū)和胞漿內(nèi)段,不能將LPS信號轉(zhuǎn)導(dǎo)到細(xì)胞內(nèi),因此人們推測存在一個(gè)或多個(gè)跨膜受體轉(zhuǎn)導(dǎo)LPS信號。隨后的研究發(fā)現(xiàn)TLR4是跨膜轉(zhuǎn)導(dǎo)LPS信號的主要受體。目前已知TLR4介導(dǎo)的信號轉(zhuǎn)導(dǎo)包括髓樣細(xì)胞分化因子88(myeloid differentiation factor88,MyD88)依賴性和非依

3、賴性途徑。MyD88依賴性途徑主要介導(dǎo)NF-κB活化、細(xì)胞因子的產(chǎn)生,而MyD88非依賴性途徑主要負(fù)責(zé)LPS誘導(dǎo)的IFN誘導(dǎo)性蛋白10(IFN-inducible protein10)、糖皮質(zhì)激素終止反應(yīng)基因16(glucocorticoid attenuated respinse gene16,GARG-16)、IFN調(diào)節(jié)基因1(IFN-regulated genel,IRG-1)表達(dá)和樹突狀細(xì)胞成熟。
   雖然TLR4是L

4、PS跨膜信號轉(zhuǎn)導(dǎo)的主要受體,但在體外轉(zhuǎn)染了TLR4的人胚腎細(xì)胞(human embryonic kidney-derived293cell line,HEK293)和Ba/F3細(xì)胞(amouse IL-3-dependent pro-B cell line)不能轉(zhuǎn)導(dǎo)LPS信號。隨后的研究發(fā)現(xiàn)TLR4介導(dǎo)的LPS信號轉(zhuǎn)導(dǎo)需要一種稱為髓樣分化蛋白-2(myeloid differentiation-2,MD-2)的輔助。MD-2蛋白由160

5、個(gè)氨基酸組成,相對分子量為25-30kD,其N端有一段由16個(gè)氨基酸殘基組成的信號肽,使MD-2具有分泌性。MD-2廣泛分布于造血系統(tǒng)、神經(jīng)系統(tǒng)和生殖系統(tǒng),B細(xì)胞、樹突狀細(xì)胞、巨噬細(xì)胞、血管內(nèi)皮細(xì)胞等都有MD-2表達(dá)。
   研究發(fā)現(xiàn),MD-2合成后大部分在內(nèi)質(zhì)網(wǎng)/高爾基體與TLR4結(jié)合,然后以TLR4/MD-2復(fù)合物的形式在細(xì)胞表面表達(dá),參與LPS信號的識別和轉(zhuǎn)導(dǎo)。目前認(rèn)為,TLR4并不與LPS直接結(jié)合,而是通過MD-2的協(xié)助

6、將LPS的信號轉(zhuǎn)導(dǎo)到細(xì)胞內(nèi)。MD-2如何協(xié)助TLR4傳遞LPS信號,MD-2與TLR4相互作用的結(jié)構(gòu)域是什么一直是相關(guān)領(lǐng)域的研究熱點(diǎn)。早期研究認(rèn)為影響MD-2與TLR4結(jié)合的主要結(jié)構(gòu)是Cys95和Cys105兩個(gè)半胱氨酸殘基,但近年來研究發(fā)現(xiàn)MD-2的Cys37-Cys51袢環(huán)和Cys95-Cys105袢環(huán)及周圍一些位點(diǎn)都有可能參與TLR4的結(jié)合。同樣,對TLR4與MD-2作用的結(jié)構(gòu)域也尚不明確,最近有研究認(rèn)為TLR4N端的氨基酸可能是

7、結(jié)合MD-2的區(qū)域。由此可見,我們對細(xì)胞識別LPS信號的機(jī)制的認(rèn)識還十分有限,所獲得的結(jié)果尚存在爭議,這可能與不同實(shí)驗(yàn)室用不同的實(shí)驗(yàn)方法進(jìn)行研究有關(guān)。另外,由于這些研究采用的都是體外實(shí)驗(yàn),所以無法獲得MD-2與TLR4相互作用的直接證據(jù)。
   基于以上認(rèn)識,本課題采用熒光共振能量轉(zhuǎn)移技術(shù)(Fluorescence resonanceenergy transfer,F(xiàn)RET)在活體細(xì)胞研究TLR4與MD-2之間的關(guān)系,以期得到確

8、切的結(jié)果。
   FRET被認(rèn)為是研究活體細(xì)胞內(nèi)蛋白-蛋白相互作用最好的方法之一。相比于傳統(tǒng)研究蛋白質(zhì)相互作用的方法,例如免疫共沉淀(Co-Immunoprecipitation,Co-IP)和親和層析(affinity chromatography),F(xiàn)RET不需要破碎細(xì)胞,能保留蛋白質(zhì)在完整細(xì)胞中所具有的正常生理?xiàng)l件,并且能提供相互作用蛋白質(zhì)空間分布的信息;與免疫化學(xué)共定位相比,F(xiàn)RET能直接說明特定蛋白質(zhì)之間是否發(fā)生了相互

9、作用。由于這些特點(diǎn),F(xiàn)RET成為目前研究活體細(xì)胞內(nèi)蛋白質(zhì)相互作用最可靠的方法之一。
   FRET是指當(dāng)兩熒光分子距離足夠近時(shí)(通常在10nm以內(nèi)),激發(fā)供體分子受體分子發(fā)射出熒光。根據(jù)這一原理,我們可以用FRET來研究蛋白質(zhì)分子之間的相互作用。一對理想的FRET熒光基團(tuán),要求供體的發(fā)射光譜和受體的吸收光譜有明顯的重疊,同時(shí)供體的發(fā)射光譜和受體的發(fā)射光譜要完全分開。青色熒光蛋白(cyan flurescent protein,C

10、FP)和黃色熒光蛋白(yellow flurescent protein,YFP)是目前常用的一對熒光基團(tuán),完全滿足以上要求,并且其R0為4.9nm,可以在7.8nm范圍內(nèi)進(jìn)行FRET測定。
   目前,顯微鏡測定FRET的方法基本可以分為兩大類:一類是基于熒光強(qiáng)度的方法,另一類是基于熒光動(dòng)態(tài)衰減的方法。我們采用的是基于熒光強(qiáng)度的三通道FRET計(jì)算,這主要適用于活細(xì)胞的FRET研究。理論上,準(zhǔn)確進(jìn)行三通道FRET定量測量必須要進(jìn)

11、行一定的校正,主要包括三個(gè)方面:FRET濾光片檢測到的非FRET成分,熒光串色(用CFP濾光片檢測到受體熒光分子信號或YFP濾光片檢測到供體熒光分子信號)及供受體表達(dá)濃度的影響。
   針對這三個(gè)方面,我們采用以下方法進(jìn)行校正。在濾光片的選擇上,我們采用了德國Carl Zeiss公司的濾光片組:CFP、YFP、CFP-YFP-FRET,它們能有效削減光譜串色,提高FRET信號的信號噪聲比。由于熒光串色的量與熒光蛋白的表達(dá)濃度成正

12、比,而蛋白表達(dá)濃度又與最佳曝光時(shí)間成反比。為了消除熒光串色的影響,我們將CFP和YFP分別表達(dá),計(jì)算出供體/受體校正因子(Donor/Acceptor Correction Factor)。我們采集并計(jì)算了100個(gè)不同最佳曝光時(shí)間細(xì)胞的供體校正因子,運(yùn)用SPSS13.0軟件將得到的供體校正因子和曝光時(shí)間做曲線估計(jì)分析(Curver Estimation),得出供體校正因子和曝光時(shí)間的最佳計(jì)算方程為:供體校正因子=19.6766+0.02

13、5X曝光時(shí)間-0.00003X曝光時(shí)間2+0.000000012X曝光時(shí)間,相關(guān)系數(shù)為0.822。我們同時(shí)計(jì)算了數(shù)十個(gè)不同最佳曝光時(shí)間下的受體校正因子,結(jié)果均為0,說明我們選擇的濾光片能有效削減YFP和FRET通道的光譜串色。為了比較不同細(xì)胞間的FRET值,消除供受體表達(dá)濃度對FRET計(jì)算的影響,我們采用了Xia的方法進(jìn)行FRET標(biāo)準(zhǔn)化計(jì)算。Xia的方法將去除背景和串色得出的FRET灰度值除以供體和受體信號的平方根,能有效減少供體和受體

14、表達(dá)濃度對FRET值的影響。
   在此基礎(chǔ)上,我們將CFP和YFP以15個(gè)中性氨基酸相連的融合蛋白CY-15P作為檢測目標(biāo),將共同表達(dá)的CFP和YFP蛋白作為系統(tǒng)的陰性對照,各取二十個(gè)細(xì)胞,用AxioVisionFRET4.6軟件進(jìn)行數(shù)據(jù)采集和Xia的方法進(jìn)行FRET值計(jì)算,結(jié)果獲得了較高的FRET值,并且與陰性對照組相比有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義,證明FRET系統(tǒng)建立成功。
   為了研究MD-2與TLR4的相互作用結(jié)構(gòu)域,我們將

15、MD-2Cys95-Cys105袢環(huán)周圍5個(gè)可能與TLR4作用的氨基酸Arg90、Lys91、Asp99、Asp100和Tyr102分別突變?yōu)锳la。將5個(gè)MD-2的突變體在HEK293細(xì)胞分別表達(dá)或分別與TLR4共表達(dá),結(jié)果表明分別突變這5個(gè)氨基酸不影響MD-2和TLR4的表達(dá)。同時(shí)我們選取CFP-MD-2R90A與YFP-TLR4共表達(dá),研究突變對其結(jié)合TLR4的影響,F(xiàn)RET結(jié)果顯示MD-2R90A突變并不影響和TLR4的結(jié)合。<

16、br>   同時(shí)為了研究TLR4與MD-2作用的結(jié)構(gòu)域,本課題構(gòu)建了TLR4N端18個(gè)氨基酸(Glu24-Met41)缺失的突變體,在HEK293細(xì)胞上比較MD-2與野生型TLR4及MD-2與TLR4突變體間的FRET值。結(jié)果表明N端Glu24-Met41缺失的TLR4結(jié)合MD-2的能力明顯下降,Glu24-Met41很可能是TLR4結(jié)合MD-2的區(qū)域。為了進(jìn)一步研究N端Glu24-Met41缺失對TLR4聚合的影響,在Hela細(xì)胞,

17、我們將野生型TLR4和TLR4突變體各自與CFP和YFP融合表達(dá),檢測LPS刺激下TLR4間FRET值的變化。實(shí)驗(yàn)表明野生型TLR4在LPS刺激下,在1min到2min有一過性的FRET增強(qiáng),隨后這種結(jié)合迅速減弱,在5min左右消失;而N端Glu24-Met41缺失的TLR4突變體則沒有觀察到FRET現(xiàn)象。這說明TLR4N端的Glu24-Met41突變還可能影響TLR4的聚合,但這種作用是通過影響與MD-2的結(jié)合導(dǎo)致,還是直接由于這段區(qū)

18、域參與TLR4聚合,還需要進(jìn)一步的實(shí)驗(yàn)研究。
   綜上所述,我們利用Carl Zeiss活細(xì)胞影像系統(tǒng)成功建立了FRET技術(shù)平臺,并利用該系統(tǒng)發(fā)現(xiàn)TLR4N端的Glu24-Met41很可能是結(jié)合MD-2的區(qū)域。同時(shí)通過檢測LPS刺激下FRET值的變化,發(fā)現(xiàn)TLR4N端的Glu24-Met41還參與TLR4的聚合作用。另外我們發(fā)現(xiàn)MD-2的Arg90、Lys91、Asp99、Asp100和Tyr102五個(gè)位點(diǎn)突變不影響MD-2及

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