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文檔簡介
1、目的:分析GII-4型諾如病毒廣州株GZ20133135全基因組序列,了解其基因結構的特點以及基因組類型。應用分子生物學手段制備GII-4型NoV P粒子,通過酶免疫分析試驗(Enzyme immune assays,EIA)為基礎的唾液結合實驗和寡糖結合實驗分析我國主要基因型95/96 US株、2006b株、Sydney株等3種毒株與組織血型抗原(Histo-blood group antigens,HBGAs)的相關性,以獲得我國N
2、oV流行株與HBGAs的結合模式,從而確定諾如病毒流行株感染的宿主范圍,為進一步研究NoV與宿主受體之間的關系及NoV疫苗和防治藥物的研發(fā)提供實驗基礎和理論依據。
方法:1、諾如病毒廣州株GZ20133135全基因組序列測定及分析:依據Sydney2012全基因組參考株進行引物的設計,用RT-PCR分段的方式對諾如病毒全基因組進行擴增,經過分子克隆的手段、測序以后再進行系統的進化分析。2、制備GII-4型諾如病毒P粒子:選擇S
3、ydney2012代表株3135,通過基因工程方法構建表達質粒pGEX4T1-P,將鑒定正確的pGEX4T1-P質粒轉化BL21(DE3)感受態(tài)菌,挑選單克隆菌落小量表達,SDS-PAGE鑒定是否有融合蛋白產生。隨后將保存菌種活化進行目的蛋白的大量表達,利用瓊脂糖-4B柱對P蛋白進行純化并通過凝血酶除去GST融合蛋白標簽以形成二十四聚體的P粒子。3、分析不同型別諾如病毒株與組織血型抗原的親和性:利用ELISA唾液結合實驗分析3個型別的諾
4、如病毒流行株與唾液中的HBGAs受體相結合的情況。利用HBGAs表型已明確的54份唾液樣本包被96孔酶標板,加純化的NoV P粒子與之反應,以相應的鼠抗GII-4 NoV P血清為一抗,二抗為HRP標記的山羊抗鼠IgG,加入TMB顯色液,在酶標儀上的450nm波長處顯示的OD值。通過3個毒株的P蛋白對lea、leb、lex、ley、A、B、H1和H2型寡糖進行EIA為基礎的寡糖結合實驗。綜合唾液結合及寡糖結合的實驗分析三個諾如病毒流行株
5、與HBGAs受體的結合方式。
結果:1、諾如病毒廣州株GZ20133135全基因組序列測定及分析:GII-4型諾如病毒廣州株GZ20133135病毒基因組全長7566bp,其病毒基因組分為三個開放閱讀框(ORFs),ORF1、ORF2及 ORF3長度分別為5100bp、1623bp和807bp,ORF1與ORF2之間有19個核苷酸重疊。廣州株GZ20133135全基因組的序列與參考株GII-4型Sydney2012變異株序列的
6、同源性最高,全長同源性為99.07%。通過系統的進化分析表明,廣州株GZ20133135株屬于GII-4 Sydney2012的變異株。通過對衣殼區(qū)541個氨基酸比對,Sydney2012變異株位點變化情況為:aa294 V或A或P→T,aa296 S或T→S,aa297H或Q→R,aa298D或N或T→N,aa368 T或N或S或A→E,aa372 N或S→D,aa393 N或D或S,aa394 T或G或S→T,aa395 T或A→T
7、,aa407 N或D→S,aa412 T或D→N,aa413 G或I→T。2、制備GII-4型諾如病毒P粒子:PCR擴增得到3135 P區(qū)序列,大小都為991bp。成功構建表達質粒4T1-3135 P,測序結果證實連接的表達片段長為972個核苷酸,編碼324個氨基酸。SDS-PAGE電泳分析證實成功表達了分子量約62kDa的可溶性的GST-P融合蛋白和分子量為36kDa的目的蛋白P蛋白。3、分析不同型別諾如病毒株與組織血型抗原的親和性:
8、通過P蛋白的唾液結合實驗分析得到3135-P、9711-P和55019-P諾如病毒與唾液HBGAs的結合模式。9711及55019株的P粒子與A、B、AB、O+型唾液能夠結合,而與O-型唾液則均不結合。3135株P粒子與A、B、AB、O+、O-型唾液均結合。通過寡糖結合實驗發(fā)現3135與lea、leb、A、B、H2型結合;55019與leb、ley、A、B、H2型寡糖結合;9711與leb、ley、A、B型寡糖結合。
結論:1
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