玉米果穗不同部位種子的全基因組DNA甲基化研究.pdf

1、DNA甲基化作為表觀遺傳的主要修飾方式之一，參與細(xì)胞的許多生物學(xué)過(guò)程，在植物生長(zhǎng)發(fā)育、基因組印記和對(duì)逆境脅迫的應(yīng)答等方面發(fā)揮重要作用。本試驗(yàn)利用玉米甲基化免疫共沉淀（MeDIP-seq）技術(shù)對(duì)玉米雜交種鄭單958吸脹0h和24h果穗上部、中部種子全基因組DNA甲基化進(jìn)行了研究，利用 McrBC-PCR對(duì)部分差異甲基化基因進(jìn)行驗(yàn)證，將MeDIP-seq數(shù)據(jù)和RNA-seq數(shù)據(jù)結(jié)合，對(duì)部分差異甲基化基因的表達(dá)水平進(jìn)行檢測(cè)，從DNA甲基化角度

2、研究影響玉米果穗不同部位種子萌發(fā)的調(diào)控機(jī)理。主要研究結(jié)果如下：
　　1．通過(guò)MeDIP-seq技術(shù)對(duì)玉米果穗不同吸脹時(shí)間、不同部位種子的全基因組DNA甲基化進(jìn)行分析，吸脹0h種子的差異甲基化基因數(shù)量遠(yuǎn)多于吸脹24h種子；吸脹0h中部與上部種子相比，甲基化上調(diào)基因的數(shù)量多于下調(diào)基因的數(shù)量，而吸脹24h中部與上部的種子比較，甲基化下調(diào)基因的數(shù)量多于上調(diào)基因的數(shù)量。
　　2．MeDIP-seq結(jié)果分析發(fā)現(xiàn)啟動(dòng)子區(qū)的甲基化修飾要多于

3、基因區(qū)，基因區(qū)內(nèi)含子的甲基化修飾多于外顯子。通過(guò)對(duì)吸脹0h和24h中部和上部種子的差異甲基化基因進(jìn)行分析，在吸脹0h種子中共檢測(cè)到7264個(gè)差異甲基化基因，在吸脹24h種子中共檢測(cè)到3047個(gè)差異甲基化基因。這些差異甲基化基因編碼的蛋白參與染色質(zhì)和染色體結(jié)構(gòu)、DNA修復(fù)、能量代謝、N代謝、淀粉和蔗糖代謝、DNA損傷修復(fù)和復(fù)制、翻譯起始、信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)等過(guò)程。
　　3．對(duì)玉米果穗不同吸脹時(shí)間、不同部位種子的全基因組 DNA甲基化數(shù)據(jù)和RN