常見致病菌通用芯片檢測方法的研究.pdf_第1頁
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文檔簡介

1、目的:利用生物芯片進行細菌的高通量檢測和鑒定已成為很多人的共識,但至今為之還未真正實現(xiàn).為建立細菌性生物恐怖劑和重要醫(yī)學細菌的篩查方法,該研究旨在建立一種基于16S rDNA寡核苷酸芯片的檢測和鑒定常見致病菌的技術(shù).方法:以16S rDNA為靶標,針對待檢細菌設(shè)計合成一系列寡核苷酸探針,制備寡核苷酸芯片.由于16S rDNA的保守性,針對每個細菌的四個可變區(qū)設(shè)計出4條探針.對該室保存的包括近緣和遠緣細菌在內(nèi)的135種共計300多株細菌對

2、探針進行了驗證和篩選.根據(jù)一種含26條種特異性探針的試驗芯片,對芯片的雜交和洗滌條件等進行了摸索,并確立了新的數(shù)據(jù)分析方法.以篩選得到的探針,重新制備新的寡核苷酸芯片.待檢細菌DNA經(jīng)通用引物擴增標記后,與芯片雜交,對雜交圖譜分析歸納,得到一套種/屬特異的檢測模式.待檢樣本與芯片雜交后,結(jié)果與種/屬特異的檢測模式相比,根據(jù)相似性大小判斷樣本的種類.以該室保存的部分樣品對其進行了特異性驗證.最后進行了混合樣品檢測試驗及靈敏度試驗.結(jié)論:該

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