版權(quán)說明:本文檔由用戶提供并上傳,收益歸屬內(nèi)容提供方,若內(nèi)容存在侵權(quán),請進行舉報或認(rèn)領(lǐng)
文檔簡介
1、本文以中國沿海雙帶縞蝦虎(Tridentiger bifasciatus)為研究對象,采用線粒體基因分子標(biāo)記和核基因分子標(biāo)記技術(shù)對雙帶縞蝦虎的分子系統(tǒng)地理學(xué)進行了研究,系統(tǒng)研究了中國沿海雙帶縞蝦虎魚的分子系統(tǒng)地理分布模式,闡述了雙帶縞蝦虎魚的遺傳多樣性水平和遺傳結(jié)構(gòu)現(xiàn)狀,探討了其種群歷史動態(tài)的演化過程,揭示歷史因素(更新世冰期等)和當(dāng)前環(huán)境因素(洋流等)對塑造江河入海口魚類種群遺傳結(jié)構(gòu)和分子系統(tǒng)地理分布模式的重要作用。以期了解中國沿海特
2、殊的地理位置和海洋環(huán)境對該海區(qū)魚類種群遺傳進化的影響,為保護魚類多樣性提供理論依據(jù)。主要研究成果:
1、基于線粒體基因分子標(biāo)記的雙帶縞蝦虎魚的親緣地理
分析用數(shù)據(jù)為15個地理種群200個雙帶縞蝦虎魚個體的線粒體控制區(qū)和細胞色素b聯(lián)合基因序列。
1)序列的分析結(jié)果顯示:雙帶縞蝦虎魚線粒體控制區(qū)和細胞色素 b具有明顯的AT偏向性(A+T=59.6%)和反G偏倚性。
2)雙帶縞蝦虎種群多樣性:利用Dna
3、sp5.0軟件對雙帶縞蝦虎魚進行多樣性計算,得到核苷酸多樣性的范圍是在0.00091-0.00908之間,其平均核苷酸多樣性為0.00748,單倍型多樣性的范圍是在0.757-1.000之間,其平均單倍型多樣性為0.988,說明雙帶縞蝦虎魚具有高單倍型多樣性,低核苷酸多樣性。
3)基于線粒體基因的親緣關(guān)系、遺傳結(jié)構(gòu)、種群歷史動態(tài)
基于實驗數(shù)據(jù)構(gòu)建了NJ個體樹、單倍型ML樹和一個單倍型網(wǎng)絡(luò)圖來分析雙帶縞蝦虎魚的親緣關(guān)系
4、,我們得知15個地理種群大致可以分為A和B兩大類群,從單倍型網(wǎng)絡(luò)圖我們可以推測較為原始的單倍型分別屬于YT種群和FD、DT種群,進而推測,在冰川期可能存在南北兩個“避難所”,末次盛冰期之后,這兩個區(qū)域的種群分別迅速擴張。
SAMOVA分析分為四大類群,其中I類群中的5個種群之間有著較強的基因流,即地區(qū)間遺傳分化極其微弱,推測這一現(xiàn)象主要原因是受到當(dāng)前洋流(黑潮)的影響,黑潮進入渤海灣,之后南下,增強了丹東、天津、秦皇島、青島、
5、煙臺地區(qū)種群的基因交流。研究區(qū)域雙帶縞蝦虎魚的遺傳結(jié)構(gòu)、遺傳多樣性即受到歷史原因的影響同時也受到了海洋環(huán)境(洋流)的影響。
2、基于核基因RYR3分子標(biāo)記的雙帶縞蝦虎種群親原地理
分析用數(shù)據(jù)為15個地理種群120個雙帶縞蝦虎魚個體的核基因RYR3序列。
1)序列分析
分析用序列長度為896bp,一共有24個變異位點(variable sites),總變異率2.68%,包括簡約信息位點(parsim
6、-infosites)22個占2.46%,單變異位點(singleton sites)2個占0.22%,共定義單倍型24個。各堿基平均含量為腺嘌呤(Adenine)A26.6%、胸腺嘧啶(Thymine)T24.7%、胞嘧啶(Cytosine)C20.5%、鳥嘌呤(Guanine) G28.2%。A+T的含量為51.3%略大于G+C的含量48.7%。
2)雙帶縞蝦虎魚的種群多樣性
同樣適用 Dnasp5.0對雙帶縞蝦
7、虎魚的遺傳多樣性進行計算,得出結(jié)果為:核苷酸多樣性的范圍是在0.00000-0.00774±0.00191之間,其平均核苷酸多樣性為0.00329±0.00051,單被型多樣性的范圍是在0.000-0.956±0.059之間,其平均單倍型多樣性為0.689±0.04,整體來看雙帶縞蝦虎魚的遺傳多樣性具有單倍型多樣性高核苷酸多樣性低的特性。
3)基于RYR3基因序列的親緣地理、遺傳結(jié)構(gòu)、種群歷史動態(tài)
基于雙帶縞蝦虎魚R
8、YR3序列數(shù)據(jù)構(gòu)建的NJ個體樹,單倍型ML樹以及單倍型網(wǎng)絡(luò)圖均顯示15個地理種群個體交織在一起,沒有明顯的地理差異性,表3-4顯示15個地理種群除了QHD、YT、QD三個種群之外的其他種群兩兩之間的分化指數(shù)為小于0.15處于中度分化水平以下,其中ZZ、RP種群與其他11個種群遺傳分化指數(shù)小于0,遺傳分化不顯著,存在著較強的基因流,可能是核基因進化較慢,在末次冰期擴張之后,不同地理種群之間還沒有形成顯著分化,煙臺、秦皇島、青島與其他種群之
溫馨提示
- 1. 本站所有資源如無特殊說明,都需要本地電腦安裝OFFICE2007和PDF閱讀器。圖紙軟件為CAD,CAXA,PROE,UG,SolidWorks等.壓縮文件請下載最新的WinRAR軟件解壓。
- 2. 本站的文檔不包含任何第三方提供的附件圖紙等,如果需要附件,請聯(lián)系上傳者。文件的所有權(quán)益歸上傳用戶所有。
- 3. 本站RAR壓縮包中若帶圖紙,網(wǎng)頁內(nèi)容里面會有圖紙預(yù)覽,若沒有圖紙預(yù)覽就沒有圖紙。
- 4. 未經(jīng)權(quán)益所有人同意不得將文件中的內(nèi)容挪作商業(yè)或盈利用途。
- 5. 眾賞文庫僅提供信息存儲空間,僅對用戶上傳內(nèi)容的表現(xiàn)方式做保護處理,對用戶上傳分享的文檔內(nèi)容本身不做任何修改或編輯,并不能對任何下載內(nèi)容負責(zé)。
- 6. 下載文件中如有侵權(quán)或不適當(dāng)內(nèi)容,請與我們聯(lián)系,我們立即糾正。
- 7. 本站不保證下載資源的準(zhǔn)確性、安全性和完整性, 同時也不承擔(dān)用戶因使用這些下載資源對自己和他人造成任何形式的傷害或損失。
最新文檔
- 浙江沿海刺蝦虎魚屬(Acanthogobius)和縞蝦虎魚屬(Tridentiger)分子分類研究.pdf
- 錢塘江流域的吻蝦虎魚屬(鱸形目:蝦虎魚科)物種的分類與分布研究.pdf
- 14156.中國沿海大彈涂魚群體的親緣地理與種群遺傳結(jié)構(gòu)分析
- 中國黃渤海區(qū)蝦虎魚類.pdf
- 銅對黃顙魚和矛尾復(fù)蝦虎魚脂類代謝的影響及機理研究.pdf
- 蝦虎魚和黃顙魚CPT I的克隆、表達、動力學(xué)性質(zhì)及對鋅的影響研究.pdf
- 長江口蝦虎魚科魚類早期資源的種類鑒定與系統(tǒng)分類研究.pdf
- 鐵對銅誘導(dǎo)矛尾復(fù)蝦虎魚脂肪沉積及其離子轉(zhuǎn)運的影響.pdf
- 長江口斑尾刺蝦虎魚攝食習(xí)性及濁度對其攝食影響的研究.pdf
- 54913.中國縞蠅科分類初步研究雙翅目:縞蠅總科
- 膠州灣主要蝦虎魚類攝食生態(tài)的研究.pdf
- 內(nèi)質(zhì)網(wǎng)應(yīng)激在銅差異性影響黃顙魚和蝦虎魚脂代謝中的作用及其機制.pdf
- 生物科學(xué)畢業(yè)論文兩種蝦虎魚cytb基因序列分析
- 基于形態(tài)學(xué)和分子生物學(xué)資料探討中國沿海10種蝦虎魚類的系統(tǒng)發(fā)育關(guān)系.pdf
- 生態(tài)淡水蝦虎養(yǎng)殖論文
- 25964.華南沿海地區(qū)寬鰭鱲(zaccoplatypus)種群變異與親緣地理
- 孑遺植物銀杏的分子親緣地理學(xué)研究.pdf
- 蝦青素對血鸚鵡魚體色變化的研究.pdf
- 我國沿海文昌魚的遺傳多態(tài)性研究.pdf
- 中國沿海5個地理群體長蛸的遺傳多樣性研究.pdf
評論
0/150
提交評論