中國(guó)南部?jī)煞N同域分布的鯉科魚(yú)類比較親緣地理研究.pdf

1、本論文采用線粒體分子標(biāo)記（控制區(qū)和Cyt b基因）和核基因組分子標(biāo)記（微衛(wèi)星），分析了8個(gè)東方墨頭魚(yú)種群和12個(gè)紋唇魚(yú)種群的親緣地理關(guān)系及種群遺傳結(jié)構(gòu)。
　　主要結(jié)果如下：
　　1.基于線粒體分子標(biāo)記的東方墨頭魚(yú)與紋唇魚(yú)比較親緣地理研究
　　通過(guò)分析東方墨頭魚(yú)和紋唇魚(yú)線粒體控制區(qū)部分序列和Cytb基因全序列，研究?jī)晌锓N的種群遺傳變異及親緣地理格局。東方墨頭魚(yú)共分析7個(gè)河系8個(gè)種群共157個(gè)個(gè)體的線粒體序列1,887bp

2、，包括控制區(qū)5’端部分片段750bp和完整的Cyt b片段1,137bp；紋唇魚(yú)共分析10個(gè)河系12個(gè)種群共236個(gè)個(gè)體的線粒體序列1,888bp，包括控制區(qū)5’端部分片段751bp和完整的Cyt b片段1,137bp。結(jié)果為：
　?。?）遺傳多樣性方面，在東方墨頭魚(yú)所分析的1887bp序列中，有110個(gè)變異位點(diǎn)（5.82％），包括60個(gè)簡(jiǎn)約信息位點(diǎn)（3.17%）和50個(gè)單變異位點(diǎn)（2.64%），110個(gè)變異位點(diǎn)共定義了88個(gè)單倍

3、型，各種群?jiǎn)伪缎投鄻有约昂塑账岫鄻有苑謩e為0.801-1.000（平均0.981）、0.00075-0.00468（平均0.00744）；在紋唇魚(yú)所分析的1888bp序列中，有59個(gè)變異位點(diǎn)（3.12%），包括39個(gè)簡(jiǎn)約信息位點(diǎn)（2.06%）和20個(gè)單變異位點(diǎn)（1.05%），59個(gè)變異位點(diǎn)共定義了44個(gè)單倍型，各種群間單倍型多樣性及核苷酸多樣性分別為0.000-0.918（平均0.833）、0.000-0.00191（平均0.00233

4、）。
　?。?）親緣地理關(guān)系上，東方墨頭魚(yú)個(gè)體NJ樹(shù)分為3支，海南島的昌化江種群?jiǎn)为?dú)聚為一支，紋唇魚(yú)個(gè)體NJ樹(shù)分為4支，昌化江種群的部分個(gè)體單獨(dú)聚為一支，均顯示出昌化江種群與其他種群親緣關(guān)系較遠(yuǎn)。
　?。?）種群分化及遺傳結(jié)構(gòu)方面，東方墨頭魚(yú)和紋唇魚(yú)的遺傳分化指數(shù)分別為0.649和0.428，均屬于高度分化。AMOVA分析和SAMOVA分析顯示兩物種均具有顯著的遺傳結(jié)構(gòu)，瓊州海峽和五指山是東方墨頭魚(yú)的地理屏障，而紋唇魚(yú)的地理

5、屏障是云開(kāi)大山。
　?。?）種群歷史動(dòng)態(tài)上，中性檢測(cè)與錯(cuò)配分析兩種檢測(cè)方法均顯示兩物種都經(jīng)歷過(guò)種群擴(kuò)張，繪制貝氏天際線點(diǎn)圖估算種群擴(kuò)張時(shí)間，顯示東方墨頭魚(yú)和紋唇魚(yú)發(fā)生種群擴(kuò)張的時(shí)間大約在1.8萬(wàn)年前和1.1萬(wàn)年前。
　　2.東方墨頭魚(yú)和紋唇魚(yú)微衛(wèi)星引物的篩選及種群遺傳結(jié)構(gòu)研究
　?。?）用生物素-磁珠富集法篩選兩物種的微衛(wèi)星分子標(biāo)記。東方墨頭魚(yú)篩選出14對(duì)引物，用海南萬(wàn)泉河瓊海（QH）種群23個(gè)個(gè)體進(jìn)行多態(tài)性檢測(cè)；紋唇

6、魚(yú)篩選出13對(duì)引物，同樣用QH種群20個(gè)個(gè)體進(jìn)行多態(tài)性檢測(cè)。結(jié)果顯示：東方墨頭魚(yú)，等位基因數(shù)目（NA）、多態(tài)信息含量（PIC）、觀測(cè)和期望雜合度（HO和HE）分別為8-25、0.6788-0.9342、0.5652-1.0000和0.7179-0.9585，有4個(gè)位點(diǎn)顯著偏離哈溫平衡（HWE），經(jīng)Bonferroni校正后各位點(diǎn)間未發(fā)現(xiàn)連鎖不平衡；紋唇魚(yú)，NA、PIC、HO和HE分別為10-21、0.8020-0.9354、0.7500

7、-1.0000和0.8436-0.9628，偏離哈-溫平衡及連鎖不平衡現(xiàn)象均無(wú)發(fā)現(xiàn)。
　?。?）各用13對(duì)引物對(duì)兩物種種群進(jìn)行遺傳多樣性及遺傳結(jié)構(gòu)分析，結(jié)果顯示：
　?、龠z傳多樣性方面，東方墨頭魚(yú)，種群中平均等位基因數(shù)為11.923，平均等位基因豐度為10.001，所有種群的期望及觀測(cè)雜合度分別是0.8581和0.8477；紋唇魚(yú)，種群中平均等位基因數(shù)和平均等位基因豐度分別為12.090和14.385，所有種群的期望及觀測(cè)雜