快和慢骨骼肌差異表達(dá)基因的研究.pdf

1、骨骼肌分為快肌和慢肌2種肌纖維類(lèi)型，這2種肌纖維類(lèi)型在結(jié)構(gòu)和功能上有很大的差異。本試驗(yàn)利用Affymetrix公司的編號(hào)為AFF-900623的豬基因組mRNA表達(dá)譜芯片檢測(cè)快肌(背最長(zhǎng)肌)和慢肌(比目魚(yú)肌)2種極端類(lèi)型肌肉中基因的差異表達(dá)，希望以此來(lái)更深入的了解導(dǎo)致肌纖維類(lèi)型差異的分子機(jī)制。AFF-900623芯片：包含23937個(gè)探針組，可以檢測(cè)在豬中表達(dá)的20201個(gè)基因。分別取3頭5月齡梅山母豬的背最長(zhǎng)肌和比目魚(yú)肌，即3個(gè)生物學(xué)

2、重復(fù)共6個(gè)肌肉組織樣品。分別用3個(gè)背最長(zhǎng)肌和3個(gè)比目魚(yú)肌的總cDNA與6個(gè)芯片雜交，然后用Genespring10.0軟件分析芯片雜交數(shù)據(jù)。結(jié)果顯示：在背最長(zhǎng)肌和比目魚(yú)肌中差異表達(dá)倍數(shù)(foldchange)大于1.5倍，p＜0.05的差異基因共有550個(gè)。其中，在比目魚(yú)中上調(diào)表達(dá)的基因較多，共323個(gè)，在背最長(zhǎng)肌中上調(diào)表達(dá)的基因較少，共227個(gè)。在背最長(zhǎng)肌和比目魚(yú)肌中差異表達(dá)倍數(shù)(foldchange)大于2倍，p＜0.05的差異基因

3、共有159個(gè)。其中，在比目魚(yú)中上調(diào)表達(dá)的基因共107個(gè)，在背最長(zhǎng)肌中上調(diào)表達(dá)的基因共52個(gè)。利用熒光實(shí)時(shí)定量PCR(QRT-PCR)對(duì)其中的12個(gè)基因(α-Actin、ART3、FHL1C、GATA-6、HMOX1、HSP、MYBPH、OCA2、SLC12A4、TGFβ1、TGFβ3和TNX)進(jìn)行了驗(yàn)證，證實(shí)12個(gè)基因在芯片結(jié)果和QRT-PCR結(jié)果中的表達(dá)趨勢(shì)是完全一致的，2種結(jié)果的相關(guān)性是顯著的，說(shuō)明芯片的結(jié)果是可信的。利用MAS3.