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文檔簡介
1、熱休克蛋白70(HSP70)作為分子伴侶在正常和應激條件下對機體的生理機能發(fā)揮重要作用,它能參與細胞損傷的修復,異常聚集蛋白的解聚,對抗應激引起的細胞凋亡等,對機體耐受各種不良環(huán)境因素有重要的作用。本研究以HSP70-1基因為候選基因,在全基因的編碼區(qū)尋找SNPs,并分析了SNPs與荷斯坦牛耐熱性及乳腺炎抗性的關系。主要研究內(nèi)容如下: ⑴根據(jù)NCBI登陸號為AY149618(19526bp)的HSP70-1基因序列設計九對引物并
2、用PCR-SSCP、PCR-RFLP和CRS-RFLP相結(jié)合的方法尋找中國荷斯坦牛HSP70-1基因編碼區(qū)的多態(tài)位點,結(jié)果發(fā)現(xiàn)1623bp處發(fā)生G-A-C的突變,2409bp處發(fā)生G-A的突變;兩個突變位點勻為沉默突變,沒有改變蛋白質(zhì)的氨基酸序列。X2檢驗結(jié)果表明兩位點均未達到Hardy-Weinberg平衡。2409位點多態(tài)信息含量為0.276,屬中度多態(tài);1623位點為0.554,屬高度多態(tài),兩位點多態(tài)信息含量較為豐富,具有作為分子
3、標記的潛力。 ⑵以直腸溫度和紅細胞鉀離子濃度為荷斯坦牛的耐熱指標,用SAS軟件最小二乘分析一般線性模型分析山東地區(qū)三個現(xiàn)代化牛場的127頭產(chǎn)奶牛HSP70-1基因型與耐熱指標的相關性,結(jié)果表明2409處基因型與耐熱指標相關性不顯著,1623bp處基因型與紅細胞鉀離子濃度相關性不顯著,而與熱應激時期中國荷斯坦牛的直腸溫度相關性顯著(P<0.05),GA基因型個體顯著低于CC和GG基因型個體,GA基因型為耐熱基因型。說明HSP70-
4、1基因的1623位點可用作中國荷斯坦牛選育耐熱牛群的分子遺傳標記。 ⑶隨機采取天津?qū)嶒炁龅?53個血樣,這些樣本有完整的DHI數(shù)據(jù)汜錄。其中SCC(Somaic Cell Count體細胞計數(shù))被證明和乳腺炎的發(fā)生有很高的相關性。由SCC轉(zhuǎn)化而來的SCS(Somatic Cell Score體細胞評分)因為數(shù)值符合正態(tài)分布,在統(tǒng)計應用中比SCC更有優(yōu)勢。采用SAS8.2軟件對各實驗牛群體的HSP70-1基因型與SCS的相關性進
5、行分析,結(jié)合本實驗實際建立最小二乘擬合線性模型,分析HSP70-1基因型、環(huán)境、胎次和季節(jié)等對SCS的影響;結(jié)果證明場次和胎次對SCS影響極顯著(P<0.01),產(chǎn)犢季節(jié)和1623位點基因型對SCS影響顯著(P<0.05),2409bp位點對SCS影響不顯著(P>0.05);1623bp位點不同基因型SCS差異顯著,CC基因型明顯低于GA、GG基因型,其它基因型之間差異不顯著,CC基因型可初步判定為乳房炎抗性基因型;1623位點可以作為
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