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文檔簡(jiǎn)介
1、依賴(lài)于RNA的RNA聚合酶(RNA-dependent RNA polymerase,RDRP)在真核生物中廣泛存在,植物中有四類(lèi)RDR酶,其成員參與了植物的生長(zhǎng)發(fā)育等,參與多種調(diào)控作用。為了確定黃瓜根結(jié)發(fā)育過(guò)程中表達(dá)的RDR酶基因及其表達(dá)特點(diǎn),從黃瓜cDNA中克隆了黃瓜到了5種與根結(jié)發(fā)育過(guò)程中表達(dá)的的CsRDR基因的編碼序列,對(duì)其進(jìn)行了序列分析;并且分析CsRDR基因在根結(jié)發(fā)育中的表達(dá)特性。主要研究結(jié)果如下:
1.以全基
2、因組測(cè)序的黃瓜(Cucumis sativus L.)品種9930為材料,接種南方根結(jié)線蟲(chóng)二齡幼蟲(chóng)(Meloidogvne incognita),利用所設(shè)計(jì)的引物,采用RT-PCR的方法獲得了5種與根結(jié)發(fā)育發(fā)育中表達(dá)的CsRDR基因(CsRDR1a、CsRDR1b,CsRDR1c、CsRDR2,CsRDR6)的編碼序列。在全基因組水平上,基因定位分析表明,CsRDR1a、CsRDR1b和CsRDR1c位于5號(hào)染色體;CsRDR2和CsR
3、DR6分別位于1號(hào)和2號(hào)染色體上。GenBank登錄號(hào)為HQ738485-HQ738489。
2.序列分析表明CsRDR基因編碼的蛋白序列均含有真核生物RDR酶的特征基序DbDGD(b在RDR3中為F,在RDR1、RDR2、RDR6中為L(zhǎng))。系統(tǒng)發(fā)育樹(shù)分析表明CsRDR1a、CsRDR1b,CsRDR1c編碼第一類(lèi)RDR,CsRDR2和CsRDR6分別編碼第二類(lèi)和第四類(lèi)RDR。
3.用qPCR的方法分析5種C
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