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文檔簡介
1、褐牙鲆(Paralichthys olivaceus)是一種非常珍貴的經(jīng)濟(jì)魚類,隨著養(yǎng)殖規(guī)模的擴(kuò)大化,養(yǎng)殖中面臨的魚類疾病感染問題愈發(fā)嚴(yán)峻。為了更好地找到解決問題的辦法,了解魚類的免疫機制是很必要的。本文主要是研究了三個褐牙鲆抗氧化相關(guān)基因硫氧還蛋白1基因(thioredoxin1,PoTrx1)、硫氧還蛋白相關(guān)蛋白14(thioredoxin related protein14,PoTRP14)和過氧化物酶基因1(Peroxidase
2、1,PoPrx1)基因的基因序列信息和各組織、不同發(fā)育時期的表達(dá)差異,以及在接受免疫刺激的條件下,表達(dá)模式會有何變化。本研究采用RACE(Rapid amplificationof cDNA ends,RACE)技術(shù)克隆得到PoTrx1、PoTRP14基因的cDNA全長,并運用各種生物信息學(xué)軟件對序列信息進(jìn)行分析和預(yù)測,預(yù)測了所編碼相關(guān)蛋白的基本信息、進(jìn)行了物種間同源性的分析,并構(gòu)建了各物種間的進(jìn)化樹。RT-PCR法分析了PoTrx1、
3、PoTRP14基因在成體魚八個不同組織和十四個不同胚胎發(fā)育時期的表達(dá)差異。同時建立了褐牙鲆肝臟細(xì)胞原代培養(yǎng)系統(tǒng),分別用LPS、CuSO4和H2O2刺激肝臟細(xì)胞,然后用RT-PCR法分析免疫刺激前后PoTrx1、PoTRP14和PoPrx1基因的表達(dá)模式有何變化。研究成果作如下分述:
1、PoTrx1基因全長cDNA的克隆和表達(dá)分析
運用RACE技術(shù)克隆得到PoTrx1基因cDNA全長為723bp,其中包括366bp的
4、開放閱讀框(ORF)、324bp的3'-UTR和33bp的5'-UTR。預(yù)測該基因可編碼121個氨基酸,理論分子量為15.90kDa,理論等電點為5.39。ORF中具有Trx1基因典型的保守區(qū)CGPC。同時分析了Trx1在不同物種之間的相似性,其中PoTrx1同半滑舌鰨(Cynoglossus semilaevis)、條石鯛(Oplegnathus fasciatus)和松江鱸(Trachidermus fasciatus)的一致度分別
5、為:60%、67%和61%。RT-PCR法檢測顯示PoTrx1在成體魚八個組織中都有表達(dá),尤其在小腸中的表達(dá)量最高,其次為腎臟、心臟、肝臟、腦和鰓,在肌肉組織中的表達(dá)量最低。組織表達(dá)的差異中,PoTrx1基因在免疫相關(guān)器官中的表達(dá)較高,這與Trx1執(zhí)行的免疫功能相關(guān)。同時檢測了PoTrx1基因在14個胚胎不同發(fā)育時期的表達(dá)情況,各發(fā)育時期的表達(dá)量有顯著的差異,PoTrx1在未受精卵時期就已經(jīng)開始表達(dá),然而從1細(xì)胞期開始直到囊胚期的表達(dá)量
6、都是相對穩(wěn)定的低表達(dá)量,從神經(jīng)胚期開始,表達(dá)量劇增,在體節(jié)期達(dá)到高峰,出膜期以及出膜一天表達(dá)量開始下降。建立褐牙鲆肝臟細(xì)胞原代培養(yǎng)系統(tǒng),選用LPS、CuSO4和H2O2三組刺激物刺激肝臟細(xì)胞,PoTrx1的表達(dá)出現(xiàn)了顯著的上調(diào)。LPS刺激之后,6h之后達(dá)到一個表達(dá)的高峰,隨后在24h之后又出現(xiàn)的新的表達(dá)高峰;CuSO4刺激之后2h后迅速達(dá)到高峰,隨后降低,維持一個較低的表達(dá)水平,在48h又出現(xiàn)了新的表達(dá)高峰;H2O2刺激組則是在12h和
7、24h出現(xiàn)了明顯的表達(dá)高峰。免疫刺激之后,PoTrx1表達(dá)量的上調(diào)說明Trx1基因功能同機體的免疫和抗氧化密不可分。
2、PoTRP14基因全長cDNA的克隆和表達(dá)分析
PoTRP14基因cDNA序列全長為909bp,其中包括58bp的5'-UTR區(qū)和479bp的3'-UTR區(qū),預(yù)測372bp的ORF區(qū)可編碼123個氨基酸,理論分子量和理論等電點分別為14.01kDa和5.70。ORF區(qū)具有TRP14基因共有的CPD
8、C保守序列。PoTRP14同裸蓋魚(Anoplopoma fimbria)、大西洋鮭(Salmo salar)和點帶石斑魚(Epinephelus coioides)的一致度均為87%,同松江鱸(Trachidermus fasciatus)的一致度為86%。經(jīng)RT-PCR檢測分析,PoTRP14在各組織中都有表達(dá),小腸中的表達(dá)量最高,其次為腎臟、心臟、肝臟、腦和鰓,在脾臟組織中的表達(dá)量最低。Po TRP14基因在不同胚胎發(fā)育時期的表達(dá)
9、總體維持著較高的表達(dá)量,在未受精卵中有較高的表達(dá)量,隨后的幾個時期表達(dá)量相對穩(wěn)定,高囊胚期相對低,在出膜前表達(dá)量出現(xiàn)一個急劇增長的表達(dá)高峰,隨后急劇下降。PoTRP14基因在免疫刺激后肝臟細(xì)胞中的表達(dá)亦出現(xiàn)明顯的上調(diào),PoTRP14基因在LPS刺激后的6h和48h分別出現(xiàn)表達(dá)高峰;CuSO4刺激的2h和48h出現(xiàn)表達(dá)高峰,明顯高于其他實驗組;H2O2刺激后的12h和48h有表達(dá)高峰。
3、PoPrx1基因全長cDNA的克隆和表
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