先天性耳前瘺管基因定位及中國(guó)回、黎、漢族STR位點(diǎn)遺傳多態(tài)性的研究.pdf

1、本論文主要包括兩部分工作，第一部分工作是利用基因分型和連鎖分析方法去定位一個(gè)家系的先天性耳前瘺管(CongenitalPreauricularFistula，CPF)的致病位點(diǎn)，第二部分工作是利用基因掃描和基因分型方法去進(jìn)行中國(guó)黎、回、漢三民族遺傳多態(tài)性研究。 先天性耳前瘺管(OMIM＃128700)為常見(jiàn)的先天性外耳畸形，主要表現(xiàn)為耳廓前上方耳瘺或凹陷。中國(guó)人發(fā)病率為1.2％，匈牙利白人中發(fā)病率為0.47％，黑人中的發(fā)病率更高

2、。先天性耳前瘺管的形成與耳廓的胚胎發(fā)育有密切的關(guān)系。胚胎的第1鰓弓和第2鰓弓共同成耳廓。家系分析表明本病是一種常染色體顯性遺傳病，外顯率約為85％。2003年鄒方庚等首次將先天性耳前瘺管的致病位點(diǎn)定位于8q11.1-q13.3區(qū)域。 本論文應(yīng)用連鎖分析方法對(duì)CPF家系致病基因進(jìn)行定位研究，將一個(gè)CPF家系的致病基因定位在1p32-p34.3，在D1S2713和D1S2797得到了最大LOD值為2.02(重組率θ=0.00)。遺憾

3、的是LOD值均不高，沒(méi)有達(dá)到有顯著性意義的LOD＞3，從而不能得出肯定連鎖的結(jié)論。對(duì)染色體的8q11.1-q13.3區(qū)域與CPF連鎖關(guān)系的研究顯示微衛(wèi)星標(biāo)記的兩點(diǎn)LOD值均小于-2，未發(fā)現(xiàn)在這些微衛(wèi)星的附近存在與CPF相連鎖位點(diǎn)的證據(jù)，提示CPF具有遺傳異質(zhì)性，存在另外的致病基因位點(diǎn)。 短串聯(lián)重復(fù)序列(shorttandemrepeats，STR)是廣泛存在于人類(lèi)基因組的一類(lèi)具有長(zhǎng)度多態(tài)性的DNA序列。一般由2～6個(gè)堿基構(gòu)成一個(gè)

4、核心序列，核心序列在長(zhǎng)度上呈串聯(lián)重復(fù)排列，重復(fù)次數(shù)通常在15～30次，核心序列拷貝數(shù)目的變化可產(chǎn)生長(zhǎng)度多態(tài)性。一般認(rèn)為，人類(lèi)基因組平均每6～10kb就有一個(gè)STR基因座，并具有分布廣泛，信息量大，有高度多態(tài)性并遵循孟德?tīng)柟诧@性遺傳等優(yōu)點(diǎn)，因此成為基因組物理圖譜繪制、遺傳連鎖分析、腫瘤生化研究、法醫(yī)學(xué)個(gè)體識(shí)別、親權(quán)鑒定、組織移植評(píng)價(jià)的理想標(biāo)記。 通過(guò)基因掃描和基因分型方法，研究了中國(guó)回黎漢3個(gè)民族人群15個(gè)STR位點(diǎn)D3S1358

5、、TH01、D21S11、D18S51、VWA、CSF1PO、D8S1179、TPOX、FGA、D5S818、D13S317、D7S820、D16S539、D19S433、D2S1338的遺傳多態(tài)性。研究結(jié)果表明在15個(gè)STR位點(diǎn)上回族有150種等位基因，313種基因型；黎族有149種等位基因，308種基因型；漢族有148種等位基因，319種基因型；中國(guó)3個(gè)民族的數(shù)據(jù)與文獻(xiàn)報(bào)道中的美國(guó)黑人、高加索人、西班牙人相比較發(fā)現(xiàn)彼此有顯著的差異，