兒童過敏性紫癜基因表達譜及腎損傷相關基因研究.pdf

1、目的：
　　 用Roche NimbleGen人基因表達譜芯片技術(shù)篩選過敏性紫癜(HenochSchonlein purpura，HSP)患兒疾病發(fā)生及腎損傷相關基因，以進一步從分子水平更全面、系統(tǒng)地分析兒童HSP發(fā)生發(fā)展及腎損傷發(fā)生機制。
　　 方法：
　　 利用Roche NimbleGen人基因表達譜芯片(約含有45033個基因)，分別檢測單純過敏性紫癜組外周血(HSP)、紫癜性腎炎組外周血(HSPN)、健

2、康對照組外周血(C)的基因表達譜，用相關生物信息學分析方法對不同實驗組間基因表達譜進行差異分析，最后應用實時定量PCR技術(shù)對部分差異表達基因進行驗證。
　　 結(jié)果：
　　 1、單純過敏性紫癜組與對照組間：共有1064條差異表達基因，其中2倍以上差異基因225條，2.5倍以上38條，3倍以上5條；其中225條2倍以上差異基因中146條表達上調(diào)，79條表達下調(diào)。紫癜性腎炎組與單純過敏性紫癜組：共有830條差異表達基因，其中2

3、倍以上差異基因283條，2.5倍以上118條，3倍以上51條；其中283條2倍以上差異基因中180條表達上調(diào)，103條表達下調(diào)。
　　 2、隨機選取其中3條差異基因進行Real.time PCR驗證，其結(jié)果與基因芯片篩查結(jié)果一致，結(jié)果充分證實表達譜芯片差異表達基因結(jié)果的可靠性。
　　 3、對單純過敏性紫癜組與對照組2倍以上差異基因進行GO生物學過程分析發(fā)現(xiàn)，已知功能分類的共119條，主要涉及：轉(zhuǎn)錄/翻譯、物質(zhì)合成/代謝過

4、程和信號轉(zhuǎn)導/通路相關基因，其次為分化/發(fā)育、免疫/炎癥和凋亡/抗凋亡相關基因；而在紫癜性腎炎組與單純過敏性紫癜組2倍以上差異基因中，我們發(fā)現(xiàn)已知功能分類的有201條，主要涉及：物質(zhì)合成/代謝過程相關基因，其次為轉(zhuǎn)錄/翻譯、免疫/炎癥、信號轉(zhuǎn)導/通路、分化/發(fā)育和細胞周期。
　　 4、初步篩選出免疫炎癥/細胞黏附/信號轉(zhuǎn)導通路相關基因AIF1、LAMC2、BCAM、CD209、MFAP4、ELMOD3、SCUBE1、ADAM33

5、、RET、CLEC7A、MASP2、TAPS、AOAH、MGST2、PSMA3、SP100，代謝/凋亡相關基因MUC3B、MUC1、HSD11B1、MTHFS、TNFAIP8及未知基因BM88、CEACAM3等可能在HSP發(fā)病中起重要作用，同樣也篩選出免疫炎癥/信號轉(zhuǎn)導通路相關基因KRT18、GRB10、VEGFB、HSP90AB1、HSPD1、F12、TGFBR2、TGM2、UBE2L6、CTSS、PXDN、GBP2、HLA-DRB1

6、、HLA-DMA、HLA-DPA1，代謝/分化發(fā)育/凋亡相關基因SORD、HSPE1、ARG2、HSP90AA2、PRAME、TNFAIP2、MMP19、ZFP36L1，細胞黏附相關基因CLDN4及未知基因CKMT1B等可能與HSP腎臟損傷的發(fā)生密切相關。
　　 結(jié)論：
　　 l、首次用快速高通量的表達譜芯片篩選出過敏性紫癜及紫癜性腎炎相關基因。
　　 2、初步篩選出(AIF1、BCAM、CLEC7A、CD209

7、、AOAH、MAPS2等)可能導致HSP發(fā)病的易感基因，進一步證實了免疫炎癥、細胞黏附相關基因的表達異?？赡茉贖SP發(fā)病過程中起到了主導作用，同時也發(fā)現(xiàn)了一些可能導致HSP發(fā)生的代謝/凋亡相關基因(如MUC3B、HSD11B1、MTHFS、TNFAIP8等)及未知基因。
　　 3、研究不僅證實了在HSP腎損傷過程中可能起重要作用的已被認識的基因如VEGFB、HLA-DRB1，也首次發(fā)現(xiàn)了一些以往在HSPN發(fā)病過程中未曾報道的已知