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1、目的:使用大鼠表達(dá)譜芯片篩查肺纖維化以及應(yīng)用黃芪甲甙干預(yù)治療后不同時(shí)空點(diǎn)異常表達(dá)的基因,闡明肺纖維化的致病機(jī)制和藥物作用的靶基因.
方法:用博萊霉素模型組7天和28天及應(yīng)用黃芪甲甙干預(yù)28天的大鼠肺部標(biāo)本,與安捷倫46000+大鼠基因芯片雜交。雜交后進(jìn)行圖像掃描和數(shù)據(jù)分析。并使用real-time PCR對(duì)篩選的基因結(jié)果進(jìn)行驗(yàn)證。
結(jié)果:模型組28天對(duì)比7天共有2063個(gè)基因表達(dá)差異,篩選109個(gè)基因,43個(gè)上調(diào),6
2、6個(gè)下調(diào)。黃芪甲甙28天組對(duì)比模型28天組4269個(gè)基因表達(dá)差異,篩選68個(gè)基因,45個(gè)上調(diào),23個(gè)下調(diào),應(yīng)用GO分析和PATHEWAY分析顯示篩選出的基因涉及肺纖維化發(fā)生發(fā)展的各個(gè)方面。并選取其中的Timp1、Ltbp2、Fgf183個(gè)基因利用real-time PCR進(jìn)行驗(yàn)證,結(jié)果顯示這3個(gè)基因在3個(gè)標(biāo)本中均有異常表達(dá),驗(yàn)證了基因芯片的結(jié)果。
結(jié)論:
1.博萊霉素致肺纖維化第7天主要為炎性和致纖維化基因的高表達(dá),
3、第28天炎性和纖維化基因較第7天表達(dá)量減少。
2.病理切片和基因芯片結(jié)果顯示,黃芪甲甙對(duì)肺纖維化有明顯干預(yù)作用,其主要機(jī)制在于抗炎和減少致纖維化基因的表達(dá)。
3.選取Timp1(基質(zhì)金屬蛋白酶抑制劑-1),F(xiàn)gf18(纖維生長(zhǎng)因子-18),Ltbp2(轉(zhuǎn)化生長(zhǎng)因子結(jié)合蛋白-2),3條基因進(jìn)行Real-time PCR驗(yàn)證,結(jié)果與基因芯片篩查結(jié)果一致,而且其表達(dá)量與芯片的ratio值顯著相關(guān)。表明利用基因芯片進(jìn)行肺纖維
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