COI基因在魚類物種鑒定與分類中的應(yīng)用.pdf

1、我國魚類資源豐富，種類多達3000左右。為了有效地對魚類資源進行開發(fā)利用、最大程度地發(fā)揮魚類的經(jīng)濟價值以及加大對瀕危魚類資源的保護，因此，正確地對魚類進行鑒定、分類顯得尤為重要。傳統(tǒng)鑒定魚類的方法是以形態(tài)結(jié)構(gòu)為主，結(jié)合行為、生理、遺傳性狀、地理、生態(tài)等特征對魚類進行鑒定和分類。但是，由于魚類表型特征的可變性，以及有些相同物種的外部特征在不同的生長發(fā)育階段和不同的性別之間存在差異，單單根據(jù)魚類外部形態(tài)特征對魚類進行鑒定和分類的準(zhǔn)確性不高。

2、尤其是對于形態(tài)差異比較小、親緣關(guān)系比較近的的不同物種之間的鑒定存在困難。另外，由于傳統(tǒng)的形態(tài)學(xué)鑒定方法存在的缺陷，要求鑒定者要有豐富的鑒定經(jīng)驗以及對物種分類鑒定的知識儲備。
　　DNA條形碼(DNA Barcoding)技術(shù)是指利用一段能夠代表物種的、短的、相對保守、容易擴增的標(biāo)準(zhǔn)目的基因片段實現(xiàn)物種快速、準(zhǔn)確的鑒定的技術(shù)。目前，線粒體細胞色素C氧化酶亞基(COI)基因被廣泛用作DNA條形碼的目的基因，從分子學(xué)角度為魚類的鑒定分類

3、和系統(tǒng)進化提供了可靠的依據(jù)。研究內(nèi)容如下:
　　1.線粒體COI基因在觀賞魚中物種鑒定與分類應(yīng)用
　　觀賞魚種類繁多，形態(tài)各異，市場上多是以商品名命名，在物種鑒定分類上存在一定的難度。本研究基于線粒體COI基因，探討其在觀賞魚中物種鑒定與分類應(yīng)用的可行性。通過PCR擴增，獲取18種觀賞魚249個個體的COI基因序列。基于Kimura雙參數(shù)模型，利用MEGA軟件計算18種觀賞魚種間和種內(nèi)遺傳距離，并構(gòu)建系統(tǒng)進化樹。結(jié)果顯示，觀

4、賞魚類的種間遺傳距離明顯大于種內(nèi)遺傳距離，線粒體COI基因序列可以用于物種鑒定。在系統(tǒng)進化樹中，系統(tǒng)進化關(guān)系跟傳統(tǒng)分類方法所得數(shù)據(jù)一致性高。研究表明，觀賞魚線粒體COI基因序列，在物種鑒定與進化分類上具有一定的應(yīng)用價值。
　　2.COI基因DNA條形碼在云南瀾滄江魚類物種中的鑒定與分類的應(yīng)用
　　云南瀾滄江魚類資源豐富，有許多特有種類，在幼魚階段、或形體不全的情況下以及一些相近種形態(tài)相似的情況下，僅僅依據(jù)傳統(tǒng)的形態(tài)學(xué)鑒定方法

5、，很難完全滿足物種鑒定和分類的需求。本文從分子學(xué)角度，探討了線粒體COI基因在瀾滄江云南段魚類中物種鑒定與分類應(yīng)用的適用性。采用PCR技術(shù)，對采自瀾滄江云南段的18種魚共162個個體的COI基因片段進行了擴增和測序。利用MEGA軟件，基于K2P模型計算18種魚類的種間和種內(nèi)遺傳距離，并構(gòu)建系統(tǒng)進化樹。結(jié)果表明，種間遺傳距離顯著大于種內(nèi)遺傳距離，符合Hebert等人提出的COI基因能有效進行鑒定的前提;由系統(tǒng)進化樹得知，COI基因在種屬水