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文檔簡介
1、背景:丙型肝炎病毒(hepatitis C virus,HCV)感染是引起慢性肝炎,肝硬化和肝癌的主要原因之一。宿主免疫系統(tǒng)在HCV病毒的感染及清除中起到重要作用,正確的抗原呈遞能夠誘導(dǎo)有效的細(xì)胞免疫和體液免疫應(yīng)答,同時(shí)細(xì)胞因子的適量表達(dá)也是機(jī)體有效應(yīng)答的重要保障。研究表明:作為MHC-Ⅰ類抗原呈遞通路基因的一部分,抗原加工相關(guān)轉(zhuǎn)運(yùn)體(Transporter associated with antigen presentation,TA
2、P1and TAP2 subunits)能夠?qū)⒖乖膹募?xì)胞質(zhì)轉(zhuǎn)運(yùn)到內(nèi)質(zhì)網(wǎng),保證MHC抗原復(fù)合體的正確呈遞,誘導(dǎo)有效的細(xì)胞免疫應(yīng)答。而TAP1和TAP2基因序列的差異可能導(dǎo)致蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)的不同,進(jìn)而改變其功能,最終影響抗原呈遞過程。此外,細(xì)胞因子在病原感染和清除中的作用也不容忽視。研究證實(shí),宿主免疫系統(tǒng)中的白介素10(interleukin10,IL-10)在調(diào)節(jié)細(xì)胞免疫和致炎細(xì)胞因子方面起重要作用;白介素4(interleukin4,IL
3、-4)可促進(jìn)MHC-Ⅱ類抗原、FcεRⅡ/CD23和CD40的表達(dá),并增強(qiáng)B細(xì)胞提呈抗原的能力,在體液免疫應(yīng)答中發(fā)揮作用。目前,國內(nèi)外已報(bào)道了IL-10、IL-4以及TAP基因多態(tài)性分別與HCV慢性感染的關(guān)聯(lián)研究結(jié)果,但由于人種以及研究方法等因素的差異,結(jié)果并不完全一致。本研究旨在探討中國漢族人群中,IL-10、IL-4以及TAP基因多態(tài)性與HCV慢性感染的相關(guān)性,為丙肝的診治提供基礎(chǔ)數(shù)據(jù)。
方法:本研究分以云南漢族人群HCV
4、慢性感染組和健康正常對(duì)照為研究對(duì)象,TaqMan探針基因分型方法對(duì)IL-10,IL-4和TAP基因多個(gè)SNPs進(jìn)行基因分型,分別從等位基因、基因型以及單倍型水平分析以上免疫基因與HCV慢性感染的相關(guān)性。研究包括3部分:第一部分對(duì)IL-10基因啟動(dòng)子SNPs-rs1800896、rs1800871和rs1800872的3個(gè)位點(diǎn)進(jìn)行基因分型;第二部分對(duì)IL-4基因5'和3'非編碼區(qū)域6個(gè)SNPs-rs2243247、rs2243248、rs
5、2243250、rs2070874、rs2227284和 rs2243292進(jìn)行基因分型;第三部分對(duì)7個(gè)TAP1SNPs-rs9276811、rs41555220、 rs17879632、rs1057141、rs1135216、rs1057149和rs41551515以及3個(gè)TAP2SNPs-rs1042116、rs2228396和rs4148876進(jìn)行基因分型,分別構(gòu)建單倍型,比較等位基因、基因型及單倍型頻率在病例組和對(duì)照組中的差異,
6、評(píng)估以上免疫基因與HCV慢性感染的相關(guān)性。
結(jié)果:(1) IL-10基因SNPs-rs1800896、rs1800871和rs1800872基因型頻率和等位基因頻率差異在病例組和正常對(duì)照組中無統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P>0.05),SNPs-rs1800896、rs1800871和rs1800872構(gòu)建的單倍型頻率差異在病例組和對(duì)照組中無統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P>0.05)。(2) IL-4基因SNPs-rs2243247、rs2243292在病例
7、組和對(duì)照組中無多態(tài)性, SNPs-rs2243248、rs2243250、rs2070874和rs2227284的基因型頻率和等位基因頻率在病例組和對(duì)照組中差異無統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P>0.05),SNPs-rs2243248、rs2243250、rs2070874和rs2227284構(gòu)建的單倍型頻率在病例組和對(duì)照組中差異無統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P>0.05)。(3) TAP1中的rs1057141在病例組和對(duì)照組中有顯著性差異,基因型GG純合子在病例組
8、中高于對(duì)照組(P=0.009,OR=2.617,95%CI1.238~5.530)。并且,單倍型TAP1*03∶01-TAP2*01∶01在病例組中的頻率高于對(duì)照組,TAP1*03∶01-TAP2*01∶02/01∶04頻率在病例組中的頻率低于對(duì)照組。
結(jié)論:雖然本研究中未觀察到IL-10基因啟動(dòng)子區(qū)以及IL-4基因5'和3'非編碼區(qū)域SNP位點(diǎn)在HCV慢性感染組和健康對(duì)照組中的顯著差異,但兩組中TAP1及TAP2基因則顯示出
9、顯著差異。結(jié)果提示TAP1 rs1057141基因型GG以及單倍型TAP1*03∶01-TAP2*01∶01可能是云南漢族人群中HCV慢性感染的易感性因素,單倍型TAP1*03∶01-TAP2*01∶02/01∶04可能是HCV慢性感染的保護(hù)性因素;而IL-10基因啟動(dòng)子SNP-rs1800896、rs1800871和rs1800872及IL-4基因5'和3'非編碼區(qū)域SNP-rs2243247、rs2243248、rs2243250、
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