云南傣族人G6PD-L1CAM基因位點LD Block的研究.pdf

1、G6PD基因位于Xq28，由13個外顯子和12個內(nèi)含子及一個GC含量很高(＞70％)的啟動子區(qū)域組成，全長20,114bp，編碼515個氨基酸。G6PD作為存在于所有細(xì)胞及組織中的一種看家酶，其基因突變導(dǎo)致酶活性改變而引起G6PD缺乏癥。G6PD缺乏癥[MIM:+305900]是一種常見的人類遺傳性酶缺乏病，迄今全球約有四億人受累，其發(fā)病率各地區(qū)和民族差異很大，該疾病的全球性分布與瘧疾的分布顯著相似，在非洲、南部歐洲、地中海沿岸、東南亞

2、、亞洲西南部的發(fā)生率較高，我國南方也處于本缺乏癥的高發(fā)區(qū)。G6PD缺乏癥屬X連鎖不完全顯性遺傳，男女均可發(fā)病，攜帶致病墓因的男性半合子多顯示酶活性顯著缺乏，女性雜合子酶活性變異范圍較大。
　　 單核苷酸多態(tài)性是人類基因組中最常見的基因多態(tài)性，一個染色體區(qū)域中所有相關(guān)聯(lián)的SNP等位基因的集合稱為單體型，若干個相鄰SNPs組成的具有高連鎖不平衡(LD)的染色體區(qū)段即LDblock(D'＞0.8)，一個LDblock中只有少數(shù)幾種單體

3、型。只有突變和重組才能打破始祖LDblock的結(jié)構(gòu)。
　　 我們聯(lián)合應(yīng)用聚合酶鏈反應(yīng)(PCR)和變性高效液相色譜(DHPLC)及DNA測序技術(shù)對195例云南西雙版納傣族人群進(jìn)行G6PD基因分型。傣族人中G6PD基因共發(fā)現(xiàn)SNPs12種，其中有10種在數(shù)據(jù)庫中已見報道；1種g.14256C＞T曾在客家人中發(fā)現(xiàn)過，但數(shù)據(jù)庫中未見報道；還有1種g.13349T＞C是首次在中國人中發(fā)現(xiàn)的變異型，引起第3外顯子c.143T＞C(g.133

4、49)改變，使第48位密碼子所編碼的氨基酸由原來非極性疏水性的異亮氨酸(Ile)變成了極性中性的蘇氨酸(Thr)(48Ile＞Thr)。經(jīng)過蛋白質(zhì)二級結(jié)構(gòu)分析(HNN-Hierarchical Neural Network method)顯示這種突變并末導(dǎo)致蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)的明顯變化，但該突變是否具有致病性還需要我們進(jìn)一步研究。
　　 云南西雙版納是G6PD缺乏癥高發(fā)的地區(qū)，對傣族LDblock的構(gòu)建研究可以為該疾病與優(yōu)勢選擇的關(guān)系及

5、人類進(jìn)化起源的研究提供有效地信息。我們對傣族G6PD正常組構(gòu)建了一個由7個SNPs位點組成的長達(dá)11kb的LDblock，這是首次構(gòu)建傣族人群G6PD基因的單體型。對傣族G6PD缺乏組構(gòu)建了一個由5個SNPs位點組成的長達(dá)13kb的LDblock。傣族G6PD缺乏組顯示出長的連鎖不平衡趨勢提示其可能受到優(yōu)勢選擇的作用。我們還分析比較了傣族G6PD正常組、客家正常組、河南和山東組等四組人群的G6PD基因LDblock的長度、次要等位基因頻