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文檔簡介
1、豬細小病毒(porcineparvovirus,PPV)能夠?qū)е履肛i的繁殖障礙,給世界各國養(yǎng)豬業(yè)帶來了巨大的經(jīng)濟損失。目前,針對PPV主要結(jié)構(gòu)蛋白VP2和非結(jié)構(gòu)蛋白NS1的研究很多,但針對PPV全基因組的研究很少,GenBank中收錄的完整的PPV全基因組序列只有兩條(GenBankno.U44978和NC_001718),因此,本論文對實驗室分離的兩株豬細小病毒(LXB-PPV-20-06和LXB-PPV-16-06)進行全基因組序列
2、測定,以分析這兩株豬細小病毒基因組的分子特征,并結(jié)合GenBank中收錄的我國及國外的豬細小病毒序列,對豬細小病毒的遺傳變異做一分析,并對LXB-PPV-20-06株主要的非結(jié)構(gòu)蛋白NS1蛋白和結(jié)構(gòu)蛋白VP2進行原核表達。 通過設(shè)計涵蓋PPV全基因組的7對引物,分段克隆PPV的基因組片段,將PCR鑒定為陽性的重組質(zhì)粒送大連寶生物工程公司測序。結(jié)果表明LXB-PPV-20-06株和LXB-PPV-16-06株基因組全長分別為501
3、3nt和5031nt,其編碼區(qū)均不存在堿基的插入與缺失,但在VP1/VP2終止密碼子處的非編碼區(qū)存在不同程度的堿基缺失,分別缺少63nt和45nt,推測可能與毒力變化有關(guān)。NS1基因及編碼蛋白的多序列比對表明LXB-PPV-20-06株與美國Kresse株和我國的NJ株同源性最高,均為99.4%,PPV-16-06株與我國的SY-99株同源性最高。只有一個氨基酸位點的差異;VP2基因及編碼蛋白的多序列比對表明PPV-20-06株與Kre
4、sse株同源性最高,其編碼氨基酸序列完全一致,LXB-PPV-16-06株與LJL-12株同源性最高。根據(jù)VP2蛋白的多序列比對結(jié)果以及VP2蛋白215位、378位、383位、436位和565位氨基酸位點的變異情況,發(fā)現(xiàn)PPV感染的臨床病理型與VP2蛋白這些位點的變異情況密切相關(guān)。遺傳進化分析表明,我國的豬細小病毒流行毒株在進化樹上比較接近。 通過PCR擴增LXB-PPV-20-06株NS1基因和VP2基因全序列,經(jīng)酶切之后,克
5、隆至pET-32a(+)載體上,經(jīng)PCR、酶切鑒定,篩選重組表達質(zhì)粒pET-NS1和pET-VP2,將陽性重組子送公司測序,經(jīng)序列分析進一步驗證重組子構(gòu)建。將重組質(zhì)粒轉(zhuǎn)化至大腸桿菌Rosetta(DE3)中,經(jīng)總濃度為1mmol/LIPTG誘導(dǎo),表達產(chǎn)物經(jīng)SDS-PAGE分析,結(jié)果顯示PPV-LXB-20-06株NS1基因和VP2基因均獲得了良好的表達,用鎳柱對融合蛋白進行純化,融合表達的NS1蛋白的分子量接近97kDa,融合表達的VP
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