hPER1相互作用蛋白的篩選及與近日節(jié)律關系的研究.pdf_第1頁
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文檔簡介

1、本研究的主要目的是尋找人腦組織cDNA文庫中與hPER1蛋白相互作用的新蛋白,完善Perl相關的近日節(jié)律鐘控系統(tǒng)的詳細機制和信號傳導通路。研究分為三個部分:1、人腦組織中與hPER1相互作用新蛋白的篩選與鑒定;2、新蛋白與hPER1相互作用的關鍵結構域的確定;3、新蛋白與hPER1的功能聯(lián)系的研究。 方法與結果: 第一部分:人腦cDNA文庫中與hPER1相互作用蛋白的篩選 方法:采用BD Clontech公司提供

2、的文庫構建試劑盒(BD Matchmaker<'TM>Library Construction & Screening Kits)構建人腦cDNA文庫。通過RT-PCR擴增hPER1-PAS結構域的編碼序列,獲得的片斷與質(zhì)粒載體pGBKT7連接重組為誘餌質(zhì)粒pGBKT7/hPer1<,PAS>。采用順序轉染法構建酵母雙雜交系統(tǒng)(MATCHMAKER GAL4 Two-Hybrid System,BD Clontech),篩選人腦cDNA

3、文庫中能與誘餌蛋白hPER1-PAS結構域相互作用的蛋白。并且采用營養(yǎng)缺陷培養(yǎng)基、β-半乳糖苷酶印膜法檢測報告基因的表達;免疫共沉淀實驗確證蛋白間的相互作用。陽性克隆子經(jīng)PCR擴增,進行測序和比對分析。 結果:成功構建以pGBKT7/hPer1<,PAS>為誘餌蛋白的表達質(zhì)粒;構建人腦cDNA文庫;成功構建pGBKT7/hPer1<,PAS>和pGADT7-Rec/cDNA的酵母雙雜交系統(tǒng),并經(jīng)過營養(yǎng)缺陷篩選、β-半乳糖苷酶印膜

4、法檢測以及免疫共沉淀實驗,總共篩選到28個陽性克隆子。其中一個經(jīng)過測序和序列比對,證實為RACK1<,131-306>片段。 第二部分 RACK1與PER1相互作用關鍵WD40結構域的研究 方法:構建5種含RACK1不同WD結構域的重組質(zhì)粒:pGADT7-Rec/WD1-7;pGADT7-Rec/WD4-7;pGADT7-Rec/WD5-7;pGADT7-Rec/WD6-7;pGADT7-Rec/WDI-5,并鑒定。采

5、用共轉染法將構建成功的重組質(zhì)粒分別與誘餌質(zhì)粒pGBKT7/hPERl<,PAS>共轉染酵母AH109,轉化子依次在SD/-Leu/-Trp;SD/-His/-Leu/-Trp;SD/-Ade/-His/-Leu/-Trp營養(yǎng)缺陷平板上鋪板生長。β-半乳糖苷酶印膜法檢測報告基因LacZ的表達。結果呈陽性的克隆子進一步采用免疫共沉淀實驗證實與PER1的相互作用。 結果:成功構建5種含RACK1不同WD結構域的靶質(zhì)粒。雜交后結果顯示,

6、RACK1全長WD1-7(1-317aa)、C-端WD4-7(138-317aa)以及WD5-7(180-317aa)雜交后能在SD/-Ade/-His/-Leu/-Trp四缺營養(yǎng)缺陷培養(yǎng)基上生長,并能激活報告基因LacZ的表達。而N-端WD1-5(1-224aa)和C-端WD6-7(219-317aa)與PER1PAS結構域的雜交信號為陰性。表明RACK1的C端3個WD40結構域為兩種蛋白結合所必需的位點。免疫共沉淀實驗進一步證實,全

7、長WD1-7、WD4-7和WD5-7蛋白片段能與誘餌蛋白hPER1-PAS結合,結合的關鍵部位位于第5至7WD40結構域,即WD5-7才是RACK1與PER1相互作用的最小WD40結構域片段。 第三部分 RACK1與PER1功能聯(lián)系的研究 方法:半定量RT-PCR檢測RACK1在人胎兒各組織中的表達。免疫組化法檢測RACK1在NIH3T3細胞內(nèi)的表達。將pcDNA3.1-mPer1轉染NIH3T3細胞后,通過RT-PC

8、R檢測RACK1表達量的改變;同時通過免疫組化法檢測轉染細胞中RACK1分布的改變。四種hPER1干擾質(zhì)粒:pTER/hPER1-I(hper1:2155-2173);pTER/hPER1-II(hper1:398-416);pTER/hPER1-III(hper1:1653-1671);pTER/hPER1-IV(hper1:3785-3803)分別轉染SH-YSY細胞后,檢測轉染效率。采用效率最高的干擾質(zhì)粒轉染SH-Y5Y細胞,檢測

9、其對RACK1表達的影響。 結果:RACK1廣泛分布在人心、腦、肝、肺、腎、脾、小腸、骨骼、肌肉組織中,在各種組織中均有較高的表達,尤其以心臟中的表達量最高,而腦中的表達量相對其它組織較低。在細胞中,RACK1主要在細胞漿內(nèi)高表達,在細胞核中有一定量的表達。轉染pcDNA3.1-mPer1的NIH3T3細胞中RACK1的表達未見明顯改變,說明RACK1的表達量不受PER1過表達的影響。但PER1的高表達伴隨RACK1的細胞分布改

10、變,即從散布胞漿到聚集于核周。四種hPer1干擾質(zhì)粒中,pTER/hPER1-II的干擾效率最高,達到了84.9%。將pTER/hPER1-II干擾質(zhì)粒轉染SH-Y5Y細胞后,能有效抑制hPer1的表達,但不能抑制Rack1的表達。 結論:RACK1是新的hPER1-PAS結構域相互作用蛋白,RACK1的WD5-7是與hPER1-PAS相互作用的最小結構域。RACK1與PER1存在一定的功能聯(lián)系,PER1過表達能引起細胞內(nèi)RAC

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