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文檔簡介
1、目的:
采用基因芯片技術(shù)研究絕經(jīng)后骨質(zhì)疏松癥腎陰虛證的基因表達譜特征,篩選出與其相關(guān)的差異表達基因,分析絕經(jīng)后骨質(zhì)疏松癥腎陰虛證相關(guān)基因的生物信息特征。
方法:
隨機選擇絕經(jīng)后骨質(zhì)疏松癥患者10例,分為腎陰虛證組(4例)、腎陽虛證組(3例)和非腎虛證組(3例),另選3例健康絕經(jīng)后婦女為正常組。運用人全基因組表達譜芯片檢測4組的基因表達譜,篩選出腎陰虛證組與其他3組共同的差異表達基因,進行GO和P
2、athway分析。對絕經(jīng)后骨質(zhì)疏松癥腎陰虛證的部分差異表達基因進行實時熒光定量PCR驗證。
結(jié)果:
1、腎陰虛證組與其他3組的差異表達基因。腎陰虛證組與正常組相比,共有197條差異表達基因,其中103條表達上調(diào),94條表達下調(diào):腎陰虛證組與腎陽虛證組相比,共有354條差異表達基因,其中79條表達上調(diào),275條表達下調(diào);腎陰虛證組與非。腎虛證組相比,共有54條差異表達基因,其中13條表達上調(diào),41條表達下調(diào)。腎
3、陰虛證組與其他3組比較,有9條共同的差異表達基因:PROK2、ASB1、MUC12、GSTM5、CLCF1、GPR27、C3orf35和未知基因(chr3:113822408-113822347、chr18:34851804-34851745)。與正常組相比,GSTM5和MUC12表達上調(diào),GPR27、C3orf35、ASB1、CLCF1和PROK2表達下調(diào)。
2、PROK2、ASB1、MUC12、GSTM5、CLCF1、
4、GPR27和C3orf35按GO功能分析進行大體分類,主要涉及到生物學過程的調(diào)節(jié)、細胞代謝途徑、生物合成過程、信號轉(zhuǎn)導通路,細胞凋亡、磷代謝過程、JAK-STAT級聯(lián)反應的調(diào)節(jié)、免疫系統(tǒng)發(fā)育及炎癥反應等。
3、Pathway分析表明,GSTM5參與谷胱甘肽代謝通路、細胞色素P450代謝通路和細胞色素P450藥物代謝通路,CLCF1參與細胞因子與受體之間干擾通路和JAK-STAT信號轉(zhuǎn)導通路。
4、實時熒光定量
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