兩種麻蜥線粒體DNA序列變異及其在種群進(jìn)化研究中的應(yīng)用.pdf

1、為了探討麗斑麻蜥（Eremias argus）和山地麻蜥（E. brenchleyi）種群的遺傳結(jié)構(gòu)與地理分布的關(guān)系，作者對兩種麻蜥的線粒體細(xì)胞色素b基因（cyt b）和ND4基因序列的核苷酸變異進(jìn)行了分析。用于研究的麗斑麻蜥分別采自安徽滁州（CZ）、陜西長安（CA）、河南濟(jì)源（JY）、青海共和（GH）、河北邯鄲（HD）、山西陽泉（YQ）、內(nèi)蒙古鄂托克旗（ETK）、內(nèi)蒙古興和（XH）以及黑龍江哈爾濱（HRB），共9個(gè)地理種群；山地麻蜥分

2、別采自于江蘇徐州（XZ）、河南濟(jì)源（JY）、山東泰山（TS）、河北邯鄲（HD）和山西陽泉（YQ），共5個(gè)地理種群。利用PCR技術(shù)，用Clustal X（1.832）軟件對麗斑麻蜥種群的線粒體DNA cyt b、ND4和山地麻蜥種群的線粒體DNA cyt b的序列進(jìn)行同源序列比對與分析，為兩種麻蜥的遺傳多樣性提供了科學(xué)理論數(shù)據(jù)。實(shí)驗(yàn)結(jié)果如下：
　　1、所分析的101個(gè)麗斑麻蜥樣本cyt b部分序列長度是1045bp。A+T堿基含量較

3、高，平均為55.5％，共檢測到135個(gè)變異位點(diǎn)，占分析位點(diǎn)數(shù)的12.9%，52個(gè)單元型，在135個(gè)變異位點(diǎn)中，發(fā)生轉(zhuǎn)換突變的位點(diǎn)有116個(gè)，顛換突變位點(diǎn)12個(gè)，既有堿基轉(zhuǎn)換又有堿基顛換的位點(diǎn)有7個(gè)。9個(gè)種群單元型多樣性（Hd）為0.45455至0.96429，核苷酸多樣性（π）為0.00066至0.01732。其中，濟(jì)源種群、共和種群、鄂托克種群和興和種群的核苷酸多樣性（π）較低，分別為0.00452、0.00066、0.00907和0

4、.00547。而滁州種群、長安種群、邯鄲種群、陽泉種群和哈爾濱種群的核苷酸多樣性（π）很高，分別為0.01732、0.01616、0.01384、0.01450和0.01183。Fst值是0.597，基因流Nm的值是0.17。根據(jù)單元型構(gòu)建了9個(gè)麗斑麻蜥種群的NJ、ML和MP分子系統(tǒng)樹。系統(tǒng)發(fā)生樹和種群遺傳結(jié)構(gòu)分析表明，9個(gè)麗斑麻蜥種群未表現(xiàn)出明顯的系統(tǒng)地理格局。
　　2、對麗斑麻蜥9個(gè)不同種群的84個(gè)個(gè)體的ND4基因片斷進(jìn)行分析

5、，所分析的序列長度是801bp。A+T堿基含量較高，平均為57.6%，共檢測到103個(gè)變異位點(diǎn)，占分析位點(diǎn)數(shù)的12.9%，36個(gè)單元型，在103個(gè)變異位點(diǎn)中，發(fā)生轉(zhuǎn)換突變的位點(diǎn)有86個(gè)，顛換突變位點(diǎn)14個(gè)，既有堿基轉(zhuǎn)換又有堿基顛換的位點(diǎn)有3個(gè)。9個(gè)種群單元型多樣性（Hd）為0.54545至1.0000，核苷酸多樣性（π）為0.00068至0.01645。其中，共和種群、陽泉種群、鄂托克種群和興和種群的核苷酸多樣性（π）較低，分別為0.0

6、0068、0.00742、0.00200和0.00377。而滁州種群、長安種群、濟(jì)源種群、邯鄲種群和哈爾濱種群的核苷酸多樣性（π）很高，分別為0.01415、0.01626、0.01001、0.01645和0.01413。Fst值是0.613，基因流Nm的值是0.16。根據(jù)單元型構(gòu)建了9個(gè)麗斑麻蜥種群的NJ、ML和MP分子系統(tǒng)樹。系統(tǒng)發(fā)生樹和種群遺傳結(jié)構(gòu)分析表明，9個(gè)麗斑麻蜥種群未表現(xiàn)出明顯的系統(tǒng)地理格局。
　　3、對山地麻蜥5個(gè)

7、不同種群的45個(gè)個(gè)體的cyt b基因片斷進(jìn)行分析，所分析的序列長度是1043bp。A+T堿基含量較高，平均為53.5%，共檢測到835個(gè)保守位點(diǎn)，208個(gè)變異位點(diǎn)，占分析位點(diǎn)數(shù)的19.9%，27個(gè)單元型。在208個(gè)變異位點(diǎn)中，發(fā)生轉(zhuǎn)換突變的位點(diǎn)有163個(gè)，顛換突變位點(diǎn)36個(gè)，既有堿基轉(zhuǎn)換又有堿基顛換的位點(diǎn)有9個(gè)。5個(gè)種群單元型多樣性（Hd）為0.18182至1.0000，核苷酸多樣性（π）為0.00017至0.01366。其中，邯鄲種群