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1、目的:當(dāng)前,微生物與疾病,尤其是與腫瘤的發(fā)生發(fā)展越來越受到科研工作者的重視和研究。卵巢癌的起源目前仍沒有得到一致的結(jié)論,而且卵巢癌組織中的微生物組分目前幾乎沒有研究報(bào)道。本研究擬對(duì)高級(jí)別漿液性卵巢癌組織和正常輸卵管組織中微生物群落組成和多樣性進(jìn)行研究。
方法:收集來自武漢同濟(jì)醫(yī)院婦產(chǎn)科2013年10月到2015年10月71例新鮮高級(jí)別漿液性卵巢癌組織和66例新鮮正常輸卵管傘端組織標(biāo)本,利用16S rRNA高通量測(cè)序的方法對(duì)其中
2、25例卵巢癌組織和25例正常輸卵管組織進(jìn)行測(cè)序。另外,利用實(shí)時(shí)熒光定量PCR方法46例新鮮卵巢癌組織和41例新鮮正常輸卵管組織的部分差異微生物進(jìn)行獨(dú)立樣本的驗(yàn)證以及受試者工作特征曲線分析。最后,通過人抗細(xì)菌反應(yīng)的高通量PCR芯片檢測(cè)抗細(xì)菌反應(yīng)的相關(guān)基因和信號(hào)通路的表達(dá)情況。
結(jié)果:(一)對(duì)新鮮組織樣本16S rRNA高通量測(cè)序顯示了人體卵巢癌組織和輸卵管組織中微生物的組成的變化;(二)基于可操作的分類學(xué)單元(OTUs)卵巢癌組
3、織中微生物數(shù)量相對(duì)正常輸卵管組織微生物數(shù)量減少;(三)通過LEfSe聯(lián)合統(tǒng)計(jì)學(xué)分析,采用實(shí)時(shí)熒光定量PCR證實(shí)部分顯著差異微生物的豐富度和16S高通量測(cè)序結(jié)果相吻合。在門的水平上,變形菌門Proteobacteria的豐度在卵巢癌組織中相對(duì)正常輸卵管組織增加,而厚壁菌門Firmicutes的豐度在卵巢癌組織中相對(duì)正常輸卵管組織中下降,具有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義,且與16S測(cè)序數(shù)據(jù)一致;在屬的水平上,不動(dòng)桿菌屬Acinetobacter的豐度在卵巢癌
4、組織中較高,具有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義,乳球菌屬 Lactococcus的豐度在卵巢癌組織中減少,與16S測(cè)序結(jié)果相符合;在種的水平上,魯菲不動(dòng)桿菌種Acinetobacter_lwoffii的豐度在卵巢癌組織中增加,具有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義且與16S測(cè)序結(jié)果一致,而 Lactococcus_psicium在卵巢癌組織中明顯下降,具有明顯的統(tǒng)計(jì)學(xué)意義,與16S測(cè)序結(jié)果吻合;(四)基于人抗細(xì)菌反應(yīng)的PCR芯片顯示,相對(duì)于正常輸卵管組織中的微生物的基因表達(dá),卵巢
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