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文檔簡介
1、目的:
通過對確診為青少年肌陣攣癲癇(juvenile myoclonic epilepsy,JME)的患者進行全外顯子組測序(whole-exome sequencing,W ES),明確JM E患者的基因診斷,為JM E的發(fā)病機制及診療提供依據。
方法:
對2015年6月-2016年12月就診于第四軍醫(yī)大學西京醫(yī)院神經內科癲癇??崎T診的確診為JM E的29例患者進行WES,通過與數(shù)據庫比對及生物信息學分
2、析初步篩選基因突變位點,對該位點進行一代驗證和相關親屬驗證,依據2015年美國醫(yī)學遺傳學與基因組學學會(ACM G)聯(lián)合分子病理學學會發(fā)布的《序列變異解讀標準和指南》篩選出致病或可能致病的突變,明確這些JM E患者的基因診斷,并結合臨床用藥療效分析不同變異的治療效果。
結果:
在29例行W ES的JM E患者中,發(fā)現(xiàn)23例患者存在致病或可能致病的基因突變,共檢出21個突變位點(其中3例患者為同一位點突變),包括20個
3、單基因錯義突變和1個單基因移碼突變。在20個單基因錯義突變中,CLCN2突變位點6個:c.1834G>Ap.R612C,c.1991A>T p.E664V,c.1141C>G p.P381A,c.2006G>A p.A669V, c.1141G>C p.P381A,c.1705G>A p.G569S;CACNA1H突變位點3個:c.1735G>A p.D579N,c.5468G>A p.R1823H,c.3646G>A p.D1216N
4、;CHD2突變位點2個:c.927C>G p.I309M,c.2291A>C p.H764P;以下突變位點各1個:SCN2A c.1571G>A p.R524Q, LAMC3 c.1675A>G p.I559V, GRIN2A c.2636A>G p.K879R, EFHC1 c.268A>G p.M90V,CHRNA2 c.1073G>T p.S358I,GABRA1 c.116C>T p.T39I,CACNB4 c.1550C>T
5、p+R5UQ, K C N n c.3317G>Ap.R1106Q,CACNA1D c.2206A>G p.M736V)。1個單基因移碼突變?yōu)镈 E P D C5 c.3225_c.3226insG p.V1076Gfs*85。發(fā)現(xiàn)6例患者基因突變的位點尚未見既往文獻報道,包括5例單基因錯義突變(CZCN2 c.1834G>A p.R612C,EFHC1 c.268A>G p.M90V,GABRA1 c.116C>T p.T39I,CA
6、CNB4 c.1550C>T p.R517Q, CHD2 c.2291A>C p.H764P)和1例單基因移碼突變(DEPDC5 c.3225_c.3226insG p.V1076Gfs*85),5例單基因錯義突變經軟件預測結果顯示突變導致的蛋白質翻譯的變化對蛋白功能均有影響,1例單基因移碼突變因導致DEPDC5基因編碼的蛋白從第1076位氨基酸開始算起,后面再翻譯85個氨基酸即終止,且這85個氨基酸是移碼的,序列和原來的序列完全不同,
7、因此該位點突變風險較高,致病可能性較大。另有8例患者的突變基因為目前研究報道中與其他類型癲癇相關的基因,尚未見這些基因與JME發(fā)病相關的報道。6例 CLCN2基因突變的患者中,3例為肌陣攣發(fā)作(myoclonic seizures,M S)伴全面強直-陣攣發(fā)作(generalized tonic-clonic seizures,GTCS),2例為 MS伴GTCS和失神發(fā)作(absence seizures, AS),1例患者為單純MS。
8、這6例患者中,有4例患者接受丙戊酸治療,3例總發(fā)作減少100%,1例總發(fā)作減少75%-99%;2例患者接受左乙拉西坦治療,總發(fā)作減少均在50%-74%。發(fā)現(xiàn)5例患者存在CACNA1H基因突變,其發(fā)作類型均為M S伴GTCS,其中有2例患者接受丙戊酸單藥治療,3例接受雙藥聯(lián)合治療,所有患者的G T C S均減少100%,M S減少均在75%-99%,其中有2例患者曾在M S未得到控制時嘗試減藥,但均在減藥過程中(未完全停藥)出現(xiàn)GTCS。
9、
結論:
本研究在29例行W ES的JM E患者中發(fā)現(xiàn)23例患者存在致病或可能致病的基因突變,其中6例為新發(fā)現(xiàn)的突變,突變位點尚未見相關文獻報道。另有8例患者的突變基因為目前研究報道的與其他類型癲癇(非JM E)相關的基因,推測JME可能和其他類型癲癇擁有共同的基因基礎。CACNA1H突變的JM E患者的表型可能多為M S合并GTCS,抗癲癇治療后G T C S較M S易得到控制,同時該類患者須慎重減停藥??傊?,W
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