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文檔簡介
1、蛋白質(zhì)內(nèi)含子是位于蛋白質(zhì)前體內(nèi)的插入序列,其兩側(cè)的氨基酸序列稱為蛋白質(zhì)外顯子。在蛋白質(zhì)前體翻譯后成熟過程中,蛋白質(zhì)內(nèi)含子通過四個連續(xù)的親核置換反應(yīng)精確地從前體蛋白質(zhì)中自我切除,同時催化兩側(cè)蛋白質(zhì)外顯子以肽鍵相連產(chǎn)生成熟蛋白,這一過程稱為蛋白質(zhì)剪接。蛋白質(zhì)內(nèi)含子自主催化的反應(yīng)為蛋白質(zhì)合成和加工提供了新的途徑,因而在蛋白質(zhì)工程及其它領(lǐng)域具有廣泛的應(yīng)用前景。
但是,在目前的研究中,仍然存在著大量未解決的問題,如異源生物體內(nèi)剪接效
2、率低、蛋白質(zhì)內(nèi)含子純化系統(tǒng)效率低以及不能實現(xiàn)蛋白質(zhì)剪接人為控制等。針對以上問題,本研究對蛋白質(zhì)內(nèi)含子進(jìn)行了如下改造:
將卡那霉素抗性和蛋白質(zhì)剪接活性相結(jié)合,成功的在異源生物體內(nèi)構(gòu)建了依賴卡那霉素抗性的蛋白質(zhì)內(nèi)含子篩選系統(tǒng)。選擇TerThyX和Ssp DnaX兩個微小蛋白質(zhì)內(nèi)含子對該篩選系統(tǒng)的可行性進(jìn)行檢驗,結(jié)果顯示:含有卡那霉素的平板上的菌落生長情況與western blot檢測結(jié)果一致,證明本篩選系統(tǒng)完全可行。進(jìn)一步結(jié)合
3、定向進(jìn)化的策略,利用易錯PCR,構(gòu)建菌落數(shù)超過106的突變庫,在抗性平板上獲得了4個高剪接活性的突變蛋白質(zhì)內(nèi)含子。Westernblot顯示:改造后的Ssp DnaX微小蛋白質(zhì)內(nèi)含子在E.coli細(xì)胞內(nèi)剪接活性高于90%,真正解決了異源生物體內(nèi)剪接活性低的問題。
利用已獲得的高剪接活性的S1和S11型斷裂蛋白質(zhì)內(nèi)含子Rma DnaB和Ssp GyrB,成功定點突變了N端或C端與剪接直接有關(guān)的保守位點的氨基酸,在E.coli
4、體內(nèi)將其改造為只有一端可發(fā)生斷裂,不能進(jìn)行完整的剪接作用的N端和C端切割元件。檢測改造后的斷裂蛋白質(zhì)內(nèi)含子一端切割的效率,篩選具高效切割活性的蛋白質(zhì)內(nèi)含子,以用于深入研究蛋白質(zhì)剪接機制,以及進(jìn)一步構(gòu)建高效的蛋白純化系統(tǒng)。
將斷裂蛋白內(nèi)含子的N端和C端一小段多肽共同表達(dá)形成一個融合蛋白(NC蛋白),同時在另一系統(tǒng)中表達(dá)intein中間片段(IM蛋白),成功構(gòu)建了Rma DnaB和Ssp GyrB的NC融合蛋白和IM蛋白。分別
5、純化NC和IM蛋白后,在16℃,25℃,37℃條件下進(jìn)行體外剪接反應(yīng),從而達(dá)到輔助斷裂蛋白質(zhì)內(nèi)含子兩端二聚化的目的。通過檢測反應(yīng)結(jié)果,解開IN和IC特異性結(jié)合之謎。
通過本論文的研究,在蛋白質(zhì)內(nèi)含子高級結(jié)構(gòu)未知的情況下,篩選獲得高剪接活性的蛋白質(zhì)內(nèi)含子,完成了對蛋白質(zhì)內(nèi)含子功能的進(jìn)化。并實現(xiàn)了斷裂蛋白質(zhì)內(nèi)含子的空間隔離,這對多個蛋白質(zhì)片段的體外連接具有重要的指導(dǎo)作用,并為研究蛋白質(zhì)內(nèi)含子剪接過程的可控性奠定理論基礎(chǔ)。隨著對
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