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文檔簡(jiǎn)介
1、目的:了解2014年重慶區(qū)域諾如病毒感染所致兒童急性腹瀉的感染現(xiàn)狀、臨床特征、流行基因型以及發(fā)生基因重組情況。
方法:2014年1月至12月在重慶醫(yī)科大學(xué)附屬兒童醫(yī)院門診檢驗(yàn)科收集符合納入條件的腹瀉標(biāo)本511例,同時(shí)記錄患兒的臨床資料,用RT-PCR法分別對(duì)諾如病毒GI和GII基因組的衣殼蛋白(Capsid)區(qū)進(jìn)行擴(kuò)增,再對(duì)陽(yáng)性PCR產(chǎn)物進(jìn)行測(cè)序,并對(duì)序列進(jìn)行基因分型及構(gòu)建進(jìn)化樹;為進(jìn)行重組分析,再次用RT-PCR法對(duì)NV陽(yáng)性
2、標(biāo)本的部分RdRp區(qū)和Capsid區(qū)同時(shí)進(jìn)行擴(kuò)增,然后基因分型,如果RdRp區(qū)和Capsid區(qū)分型不一致則考慮基因重組,然后選取重組代表株用SimPlot再次進(jìn)行鑒定。
結(jié)果:共收集到符合條件的標(biāo)本511例(男290例,女221例),未檢測(cè)出NV GI型,共檢出NV GII型67例,檢出率13.1%(67/511),男性38例,陽(yáng)性率為13.1%(38/290),女性29例,陽(yáng)性率為13.1%(29/221),男女NV檢出率差
3、異沒有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(χ2=0.000,P>0.05)。除4月份外,其余各月份均有NV陽(yáng)性,以8月至10月為檢出高峰,不同月份間NV檢出率差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(χ2=58.583,P<0.05)。NV陽(yáng)性率最高的年齡組為7到12月齡,2歲以下兒童占其總檢出例數(shù)的86.6%。NV陽(yáng)性患兒中有36例伴有嘔吐(36/67,53.7%),19例合并呼吸道癥狀(19/67,28.4%),此外還有7例患兒伴有發(fā)熱(7/67,10.5%)。67例NV陽(yáng)性標(biāo)本
4、在Capsid區(qū)測(cè)序成功,分型包括5種基因型,依次是GII.4 Sydney2012型42例(62.7%),GII.3型8例(11.9%)和GII.17型8例(11.9%),GII.6型7例(10.5%),GII.14型2例(3.0%)。59例NV病毒陽(yáng)性標(biāo)本同時(shí)在RdRp區(qū)和Capsid區(qū)測(cè)序成功,共檢測(cè)到52例重組株,4種重組型別,分別是GII.e/GII.4 Sydney2012型42株、GII.12/GII.3型6株、GII.7
5、/GII.6型2株、GII.7/GII.14型2株。
結(jié)論:諾如病毒是重慶區(qū)域小兒病毒性腹瀉的常見病原,2014年檢出率為13.1%,男女NV檢出率無(wú)統(tǒng)計(jì)學(xué)差異。諾如病毒在重慶地區(qū)的流行高峰主要集中在8月至10月,檢出率最高年齡組為7到12月齡,發(fā)病年齡以小于2歲的嬰幼兒為主,嘔吐為NV腹瀉最常見的伴隨癥狀。2014年重慶地區(qū)NV有5種流行基因型(按capsid區(qū)分型), GII.4 Sydney2012為最主要的流行株,其次
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