2010~2011年深圳市諾如病毒的分子流行病學(xué)研究.pdf

1、研究目的:諾如病毒是常見的腹瀉病毒,廣泛存在于環(huán)境中,是引起非細(xì)菌性急性腸胃炎的主要病原之一。諾如病毒流行范圍廣,傳播方式多樣,遺傳信息變化大。本研究將2010-2011年收集的腹瀉樣品進(jìn)行檢測,并結(jié)合前期的資料,從諾如病毒的感染情況及分子流行病學(xué)兩方面進(jìn)行判斷分析,為諾如病毒的檢測及預(yù)防提供基礎(chǔ)資料。
　　研究方法:將2010-2011年收集的樣品經(jīng)過前處理后,提取核酸。一部分核酸用作Real-time PCR的模板,并結(jié)合調(diào)查

2、的資料從時間(月份)、年齡和性別等方面對這兩年諾如病毒的感染情況進(jìn)行分析。另一部分采用RT-PCR的方法,分別用NVG1和NVGⅡ特異性引物對其進(jìn)行擴(kuò)增,從分子水平分析近兩年諾如GⅠ和諾如GⅡ基因組的流行趨勢,并著重分析GⅡ.4型的流行狀況。
　　研究結(jié)果:1、2010年收集的925份標(biāo)本中,有506份標(biāo)本來自男性,419份標(biāo)本來自女性,三歲及三歲以下的有480份,所占比例達(dá)52％。經(jīng)過Real-time PCR檢測,共鑒定出陽性

3、標(biāo)本186份,陽性率為20.10%,其中有96份來自男性,90份標(biāo)本來自女性,三歲及三歲以下兒童感染諾如病毒的陽性數(shù)為104份,所占比例高達(dá)56%(104/186);2011年收集的983份樣品中,有573份標(biāo)本來自男性,410份標(biāo)本來自女性,其中571名患者的年齡小于3歲,所占比例達(dá)58%。經(jīng)Real-time PCR檢測,共鑒定出陽性標(biāo)本210份,陽性率為21.36%,其中有121份來自男性,89份來自女性,三歲及三歲以下兒童的陽性

4、數(shù)為130份,所占比例高達(dá)62%(130/210)。
　　2、經(jīng)過RT-PCR擴(kuò)增后,將有陽性條帶的樣品測序后進(jìn)行比對分型。2010年共有85份樣品成功測序,其中有78份樣品屬于NVGⅡ型,分屬4種不同的基因型別,7份樣品屬于NVGⅠ型,分屬3種不同的基因型別。在GⅡ基因組中比例最高的是GⅡ.4/2006b,共檢測55份標(biāo)本,占所有成功測序標(biāo)本的64.5%(55/85),其次是GⅡ.4/2006 variant,共檢測出17份陽性

5、樣品,占所有型別比的20%;2011年共有60份樣品成功測序,其中有55份屬于NVGⅡ型,分屬7種不同的基因型,5份屬于NVG1型,分屬4種不同的基因型。在所測的GⅡ基因組中,比例最高是GⅡ.4/2006b,共檢測出28份,占所有基因型別比的46.7%。其次是GⅡ.4/2006b variant,共有10份陽性標(biāo)本,占所有基因型別比的16.7%。
　　研究結(jié)論:1.從這兩年的數(shù)據(jù)來看,諾如病毒引起的腹瀉在任何時節(jié)均可發(fā)生。但檢出率

6、較高的月份主要集中在3-7月份。在所有的腹瀉人群中,以三歲以下兒童居多。將這兩年諾如病毒在性別感染上的差異,通過SPSS軟件分析,得到2010年卡方檢驗的P值=0.344>0.05,2011年卡方檢驗的P值=0.824>0.05,這兩年的檢測結(jié)果均無統(tǒng)計學(xué)差異。
　　2.無論2010年還是2011年,NVGⅡ基因組所占比例都非常高,分別達(dá)到91.7%(78/85)和91.6%(55/60)。相對于2010年,2011年諾如病毒的基