5個鯉群體的遺傳多樣性分析和分子標記的篩選.pdf

1、鯉是鯉形目(Cypriniformes)、鯉科(Cyprinidae)、鯉亞科(Cyprinae)中的一種廣泛分布于我國黑龍江、黃河、長江流域等全國各淡水水域的經濟魚類。鯉在我國具有悠久的養(yǎng)殖歷史和重要的經濟價值，無論是天然種群還是養(yǎng)殖品種，年產量遠超過其它魚類。但是由于盲目的開發(fā)利用，許多重要的鯉養(yǎng)殖種類的種質資源遭到破壞。黃河鯉(Cyprinus.carpio haematopterus Temminck et Schlegel)、

2、黑龍江野鯉(C.carpiohaematopter us)、荷包紅鯉(C.carpio var.wuyuanensis)、興國紅鯉(C.carpio var.xingguonensis)和建鯉(C carpio va.jian)是我國中國鯉幾個具有代表性的養(yǎng)殖品種和野生種，在我國鯉魚遺傳育種研究中均占有非常重要的地位.
　　 本試驗采用RAPD和微衛(wèi)星分子標記技術對荷包紅鯉、黃河鯉、建鯉、興國紅鯉和黑龍江野鯉等5個鯉群體的基因組

3、DNA進行擴增分析。在RAPD分析中，52個隨機引物中有36個引物擴增出條帶，其中有28個引物能夠擴增出清晰、穩(wěn)定的條帶，用以分析。在28個多態(tài)性隨機引物中共擴增出4880個條帶，平均每個引物在每個個體中擴增出3.68個條帶。位點總數為122個，多態(tài)位點數為107個，多態(tài)位點比例平均為89.50％.有效等位基因范圍為1.3262-1.4867;Shannon信息指數的范圍為0.2845-0.3903.5個鯉群體中，黃河鯉和黑龍江野鯉群體

4、間的遺傳相似性系數最大(0.9011)，建鯉和興國紅鯉群體間的遺傳相似性系數次之(0.8726)，黑龍江野鯉和興國紅鯉間的遺傳相似性系數最小(0.7993).
　　 在28個多態(tài)性引物中，引物S131在荷包紅鯉中擴增出大小為1350bp的特異片段，而引物S472在建鯉和荷包紅鯉中擴增出2050bp大小的特異片段。但是由于RAPD標記的重復性和穩(wěn)定性較差，這在實際應用中受到了一定的限制，需要更多的個體進行驗證。同時將RAPD標記轉

5、化為SCAR標記，獲得該兩群體的穩(wěn)定的DNA片段標記，這對鯉種質資源的鑒定和對遺傳資源的保護具有重要的意義.
　　 在運用微衛(wèi)星標記技術對5個鯉群體的遺傳多樣性進行分析時，15對微衛(wèi)星引物中有6對能較好的擴增出特異條帶，經電泳檢測后，表現出清晰的片段大小和一定的多態(tài)性.微衛(wèi)星標記在各群體中檢測到的有效等位基因數在1.2857-1.5096之間，平均值為1.3967.Shannon信息指數在0.3537-0.5554之間.各群體的

6、平均觀測雜合度在0.2222-0.3833之間，期望觀測雜合度在0.1904-0.3119.
　　 將SSR和RAPD的實驗結果結合起來分析，結果發(fā)現，在5個鯉群體中，多態(tài)位點的比例從大到小依次是：黃河鯉(63.57％)、荷包紅鯉(61.43％)、建鯉(60.00％)、興國紅鯉(53.57％)和黑龍江野鯉(53.57％).5個鯉群體的Nei's遺傳多樣性指數和Shannon指數的大小順序為：荷包紅鯉（兩個指數分別為0.2419和